Table showing results for May 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6XZG	10662	2022-05-13	2020-02-04	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6YLF	10837	2022-05-14	2020-04-07	4.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7SPB	24769	2022-05-13	2021-11-02	3.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7BL2	12215	2022-05-16	2021-01-18	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZR	10666	2022-05-14	2020-02-05	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZP	10664	2022-05-14	2020-02-05	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7SPC	24770	2022-05-16	2021-11-02	2.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6ZJi	11234	2022-05-13	2020-06-29	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6TF9	10491	2022-05-14	2019-11-13	4.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZD	10659	2022-05-13	2020-02-04	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6TU7	10590	2022-05-15	2020-01-03	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7SPi	24771	2022-05-13	2021-11-02	2.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6QCM	4508	2022-05-12	2018-12-28	4.21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✔	7Q5A	13830	2022-05-13	2021-11-03	2.46	2.69	—	2.6	0.014	1.28	1600.0	0.06	11.06	0.00	2.247	3.06	0.00	0.0	100.0	0.0	0.99	0.66	0.84	6.72	2.6	0.054	4.18	1601.0	0.23	17.37	0.02	1.952	19.88	2.92	0.0	100.0	0.0	0.76	1.64	0.67	0.86	6.24	61600	5600	800	0	1600	0	0	logfile
✔	6RVV	4443	2022-05-13	2019-06-03	3.7	3.95	—	3.9	0.006	0.60	0.0	0.05	13.27	0.00	2.245	2.48	0.00	2.0	98.0	0.0	-2.44	0.78	0.82	2.75	3.9	0.006	0.71	0.0	0.05	18.10	0.00	2.008	12.40	1.24	0.9	99.1	0.0	-1.15	1.07	0.79	0.83	2.99	110208	14520	384	0	120	0	0	logfile
✔	6RVW	4444	2022-05-13	2019-06-03	3.7	3.98	—	3.9	0.008	0.66	0.0	0.05	14.12	0.00	2.263	1.75	0.00	2.0	98.0	0.0	-2.37	0.79	0.82	2.87	4.0	0.004	0.68	0.0	0.05	18.17	0.00	2.111	11.92	1.01	1.2	98.8	0.0	-1.32	2.68	0.80	0.84	3.30	110208	14520	384	0	120	0	0	logfile
✔	5W7V	8781	2022-05-14	2017-06-20	3.8	3.42	—	3.5	0.007	0.77	0.0	0.06	12.79	0.00	2.365	17.82	0.00	1.4	98.6	0.0	-2.52	0.47	0.74	3.24	3.4	0.005	0.82	0.0	0.06	15.80	0.00	2.238	9.91	2.42	3.5	96.5	0.0	-0.65	1.28	0.53	0.79	3.88	20430	2640	270	0	0	0	0	logfile
✔	7CKC	30385	2022-05-22	2020-07-16	2.9	2.95	—	2.9	0.007	0.92	0.0	0.05	16.47	0.01	2.090	5.46	0.00	2.2	97.8	0.0	-0.01	0.81	0.87	3.65	2.9	0.002	0.60	0.0	0.04	17.46	0.00	2.132	5.68	1.24	1.8	98.2	0.0	0.97	1.55	0.81	0.87	3.45	150300	20820	240	0	0	0	0	logfile
✔	3J0G	5276	2022-05-12	2011-07-21	4.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	108000	14160	240	0	0	0	0	logfile
✔	6QN1	4595	2022-05-18	2019-02-08	3.28	3.37	3.25	3.3	0.007	0.66	0.0	0.04	14.37	0.00	1.898	4.69	0.41	4.9	95.1	0.0	-2.95	0.81	0.85	2.33	3.3	0.003	0.58	0.0	0.04	17.86	0.00	2.092	5.78	0.52	1.7	98.3	0.0	0.30	0.78	0.82	0.88	1.97	141480	19740	240	0	0	0	0	logfile

• Page 1 of 376
• next →