Table showing results for February 2023

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7SPC	24770	2023-02-27	2021-11-02	2.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6YLF	10837	2023-02-22	2020-04-07	4.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6TU7	10590	2023-02-24	2020-01-03	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7SPi	24771	2023-02-22	2021-11-02	2.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7SPB	24769	2023-02-22	2021-11-02	3.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZG	10662	2023-02-24	2020-02-04	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6ZJi	11234	2023-02-19	2020-06-29	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7Z37	14472	2023-02-21	2022-03-01	3.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZD	10659	2023-02-24	2020-02-04	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZR	10666	2023-02-25	2020-02-05	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZP	10664	2023-02-25	2020-02-05	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✔	7Q5A	13830	2023-02-23	2021-11-03	2.46	2.69	—	2.6	0.012	1.10	1600.0	0.06	9.54	0.00	2.247	3.06	0.00	0.0	100.0	0.0	0.99	0.66	0.84	6.72	2.6	0.055	3.99	1601.0	0.21	16.66	0.02	1.952	25.67	2.65	0.0	100.0	0.0	0.76	1.64	0.67	0.86	6.20	61600	5600	800	0	1600	0	0	logfile
✔	5W7V	8781	2023-02-23	2017-06-20	3.8	3.42	—	3.5	0.007	0.77	0.0	0.06	12.79	0.00	2.365	15.84	0.00	1.4	98.6	0.0	-2.52	0.47	0.74	3.24	3.4	0.006	0.83	0.0	0.06	15.83	0.00	2.285	7.47	2.21	3.3	96.7	0.0	-0.77	1.27	0.54	0.79	3.99	20430	2640	270	0	0	0	0	logfile
✔	6SAG	10130	2023-02-21	2019-07-16	2.0	2.11	2.01	2.1	0.004	0.65	0.0	0.04	12.99	0.00	0.351	2.79	0.00	2.6	97.4	0.0	-0.33	0.58	0.86	6.64	2.1	0.004	0.66	0.0	0.04	15.32	0.01	2.026	3.22	1.43	2.9	97.1	0.0	1.37	0.73	0.60	0.90	6.95	54080	6120	240	120	240	2840	0	logfile
✔	7o0V	12680	2023-02-22	2021-03-27	2.5	2.50	—	2.4	0.017	4.34	0.0	0.05	24.73	0.01	2.117	1.80	0.31	1.2	98.8	0.0	1.63	0.82	0.86	5.41	2.4	0.009	1.87	0.0	0.05	22.39	0.01	2.028	8.70	1.66	1.1	98.9	0.0	3.14	0.50	0.84	0.89	4.44	55475	4947	238	0	317	489	0	logfile
✔	7o0X	12682	2023-02-22	2021-03-28	2.44	2.39	—	2.3	0.017	4.29	0.0	0.05	24.76	0.01	2.099	1.63	0.23	1.4	98.6	0.0	1.33	0.82	0.86	5.55	2.3	0.006	1.78	0.0	0.04	21.55	0.00	2.065	7.28	1.40	1.1	98.9	0.0	3.54	0.48	0.83	0.88	4.44	56446	5072	237	0	316	521	0	logfile
✔	7o0U	12679	2023-02-22	2021-03-27	2.35	2.42	—	2.3	0.017	4.32	0.0	0.05	24.86	0.01	2.121	1.72	0.41	1.2	98.8	0.0	1.39	0.83	0.86	5.52	2.3	0.003	1.69	0.0	0.03	21.19	0.00	1.841	7.76	1.07	0.9	99.1	0.0	3.90	0.51	0.84	0.89	4.22	55758	4972	236	0	320	491	0	logfile
✔	7o0W	12681	2023-02-22	2021-03-27	2.47	2.42	—	2.3	0.017	4.29	0.0	0.05	24.76	0.01	2.010	1.97	0.28	1.4	98.6	0.0	1.25	0.82	0.86	5.37	2.3	0.003	1.66	0.0	0.03	21.33	0.00	1.950	7.87	1.13	0.9	99.1	0.0	3.95	1.13	0.83	0.88	3.99	56476	5076	236	0	320	406	0	logfile
✔	7LQG	23485	2023-02-20	2021-02-13	3.4	3.13	—	3.3	0.016	1.42	0.0	0.04	20.72	0.00	1.842	31.02	14.58	0.0	100.0	0.0	-5.94	0.61	0.81	5.57	3.1	0.110	4.37	186.0	0.30	23.67	0.02	1.819	120.04	3.70	35.6	64.4	0.0	-8.04	1.65	0.66	0.86	3.86	12096	1152	144	0	0	0	0	logfile
✔	7LQH	23486	2023-02-20	2021-02-13	3.4	3.12	—	3.4	0.016	1.42	0.0	0.04	20.72	0.00	2.098	31.15	14.58	0.0	100.0	0.0	-5.94	0.59	0.80	5.83	3.2	0.111	4.25	190.0	0.31	24.04	0.02	1.610	112.99	4.28	40.1	59.5	0.3	-8.01	3.50	0.66	0.87	3.32	12096	1152	144	0	0	0	0	logfile

• Page 1 of 353
• next →