Table showing results for May 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6XZG	10662	2022-05-13	2020-02-04	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7BL2	12215	2022-05-16	2021-01-18	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7SPC	24770	2022-05-16	2021-11-02	2.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6YLF	10837	2022-05-14	2020-04-07	4.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6TF9	10491	2022-05-14	2019-11-13	4.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6TU7	10590	2022-05-15	2020-01-03	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6ZJi	11234	2022-05-13	2020-06-29	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZR	10666	2022-05-14	2020-02-05	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6QCM	4508	2022-05-12	2018-12-28	4.21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZD	10659	2022-05-13	2020-02-04	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7SPB	24769	2022-05-13	2021-11-02	3.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZP	10664	2022-05-14	2020-02-05	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7SPi	24771	2022-05-13	2021-11-02	2.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✔	7K00	22586	2022-05-21	2020-09-02	1.98	1.72	—	1.9	0.007	0.96	3.0	0.05	15.24	0.02	1.588	7.51	6.32	3.9	96.0	0.1	-1.76	0.69	0.83	5.00	1.8	0.006	0.84	0.0	0.04	15.29	0.01	1.757	8.10	3.17	3.9	96.1	0.0	0.01	0.86	0.71	0.86	4.96	149338	5585	117	4555	331	7248	0	logfile
✔	7PF1	13364	2022-05-17	2021-08-11	2.1	1.83	—	2.0	0.020	1.66	0.0	0.12	14.32	0.01	1.766	1.61	0.65	1.7	98.3	0.0	1.14	0.71	0.75	6.05	1.8	0.003	0.56	0.0	0.04	17.16	0.00	1.943	11.41	0.05	1.7	98.3	0.0	5.04	1.38	0.78	0.82	7.01	41646	4176	72	0	263	7207	0	logfile
✔	7A6A	11668	2022-05-16	2020-08-25	1.15	1.13	—	1.2	0.018	1.70	24.0	0.16	14.68	0.01	1.857	4.11	3.03	1.2	98.8	0.0	2.45	0.47	0.61	9.02	1.2	0.003	0.57	0.0	0.04	15.15	0.00	2.188	2.73	1.82	1.8	98.2	0.0	4.61	0.45	0.69	0.82	8.90	41613	4152	72	0	32	4621	0	logfile
✔	7PWG	13681	2022-05-12	2021-10-06	2.75	2.35	—	2.5	0.010	1.05	0.0	0.06	15.98	0.02	1.376	3.87	6.08	4.4	95.6	0.0	-2.19	0.76	0.88	4.64	2.5	0.007	0.89	1.0	0.05	16.44	0.01	1.669	4.26	3.41	3.5	96.5	0.0	-0.28	0.30	0.76	0.87	3.98	109151	5769	105	2722	294	4397	0	logfile
✔	6CVM	7770	2022-05-17	2018-03-28	1.9	2.49	1.94	2.3	0.012	0.92	0.0	0.07	10.17	0.01	2.053	3.98	0.00	2.7	97.3	0.0	-1.16	0.81	0.91	7.66	2.3	0.005	0.63	0.0	0.05	13.84	0.00	1.973	6.97	0.69	2.2	97.8	0.0	0.70	0.37	0.85	0.94	6.94	37062	4084	12	0	20	4194	0	logfile
✔	6Z9F	11122	2022-05-16	2020-06-03	1.56	1.61	1.61	1.6	0.015	1.74	48.0	0.10	15.51	0.01	1.782	5.46	3.66	1.7	98.3	0.0	2.70	0.68	0.69	8.63	1.6	0.002	0.57	0.0	0.04	15.00	0.00	2.179	5.54	3.05	1.8	98.2	0.0	4.97	0.98	0.84	0.85	8.54	41020	4152	72	0	32	4172	0	logfile
✔	6PJ6	20353	2022-05-24	2019-06-27	2.2	2.48	—	2.5	0.011	1.07	14.0	0.06	15.16	0.02	1.227	5.32	2.25	5.6	94.4	0.1	-2.65	0.62	0.85	4.58	2.5	0.006	0.72	0.0	0.04	15.73	0.01	0.931	7.61	2.47	5.6	94.3	0.0	-0.99	1.30	0.63	0.86	4.35	154542	3356	67	3016	187	3897	59624	logfile

• Page 1 of 376
• next →