Table showing results for December 2021

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7AHE	11784	2021-12-01	2020-09-24	4.1	4.22	4.11	4.1	0.009	1.11	0.0	0.09	12.70	0.00	2.205	16.70	0.45	9.6	90.4	0.0	-5.40	0.69	0.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10060	1308	5	0	1	0	0	logfile
✘	6ZU5	11437	2021-12-01	2020-07-21	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7LJD	23391	2021-12-01	2021-01-28	3.2	3.31	—	3.3	0.004	0.90	0.0	0.06	8.40	0.01	2.294	3.63	0.00	2.2	97.8	0.0	-2.10	0.57	0.72	2.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8518	1046	6	0	11	0	0	logfile
✘	7DX4	30895	2021-12-01	2021-01-18	3.6	3.96	—	3.8	0.007	0.99	0.0	0.06	10.06	0.01	0.766	7.15	0.23	6.0	93.7	0.3	-4.20	0.71	0.79	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8234	1027	6	0	5	0	0	logfile
✘	7AGG	11779	2021-12-01	2020-09-22	3.3	3.68	—	3.6	0.007	0.79	0.0	0.05	13.16	0.01	1.980	6.95	0.00	4.2	95.8	0.0	-1.18	0.83	0.80	3.30	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8252	1056	5	0	0	0	0	logfile
✘	7E0i	30933	2021-12-01	2021-01-28	3.53	3.56	—	3.5	0.007	1.51	0.0	0.06	18.60	0.02	1.214	10.76	0.78	7.3	92.7	0.0	-4.03	0.57	0.73	2.10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8033	677	6	0	58	0	0	logfile
✘	6TM2	10517	2021-12-01	2019-12-03	2.95	3.12	—	3.1	0.008	1.01	0.0	0.06	10.00	0.01	2.181	3.02	0.10	11.3	88.7	0.0	-4.14	0.44	0.47	3.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	55254	7230	60	0	54	138	0	logfile
✘	7D5i	30582	2021-12-01	2020-09-26	2.79	2.96	—	3.0	0.005	0.71	0.0	0.04	13.37	0.00	1.220	6.64	0.00	8.3	91.7	0.0	-1.65	0.65	0.88	3.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6232	793	3	0	3	0	0	logfile
✘	7D77	30603	2021-12-01	2020-10-03	2.9	3.25	—	3.2	0.029	1.07	0.0	0.08	13.47	0.00	2.107	8.42	0.21	3.7	96.3	0.0	-2.58	0.62	0.80	4.03	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8785	1105	7	0	7	1	0	logfile
✘	7CZ5	30505	2021-12-01	2020-09-07	2.6	2.89	—	2.9	0.004	0.69	0.0	0.05	13.20	0.00	2.186	6.27	0.00	3.3	96.7	0.0	-2.04	0.60	0.80	4.16	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8336	1046	11	0	3	3	0	logfile
✘	6X17	21991	2021-12-01	2020-05-18	3.66	3.75	—	3.7	0.007	1.05	0.0	0.05	15.45	0.01	2.284	4.19	0.00	3.4	96.6	0.0	-3.74	0.64	0.85	2.25	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9390	1245	9	0	3	3	0	logfile
✘	7D7R	30610	2021-12-01	2020-10-05	4.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-3.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7680	1160	2	0	0	0	0	logfile
✘	6ZRF	11380	2021-12-01	2020-07-13	3.6	3.66	1.96	3.6	0.014	1.03	0.0	0.05	13.43	0.00	1.993	42.14	0.00	4.9	95.1	0.0	-6.22	0.67	0.79	1.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	2220	300	12	0	0	0	0	logfile
✘	7E0H	30932	2021-12-01	2021-01-28	3.75	3.80	—	3.7	0.006	1.52	0.0	0.05	18.52	0.02	1.210	11.19	0.00	9.0	91.0	0.0	-3.64	0.68	0.76	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8017	661	6	0	57	0	0	logfile
✘	6YV1	10940	2021-12-01	2020-04-27	3.4	4.09	3.01	3.7	0.002	0.58	0.0	0.04	12.66	0.00	2.272	8.02	1.85	1.0	99.0	0.0	-4.45	0.52	0.77	1.48	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	2496	328	1	0	0	0	0	logfile
✘	6LQA	0942	2021-12-01	2020-01-13	3.3	3.51	—	3.5	0.008	1.28	0.0	0.07	14.15	0.01	1.369	15.36	6.02	7.8	91.4	0.9	-4.09	0.56	0.77	2.44	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9387	1151	1	0	10	0	0	logfile
✘	7oP8	13014	2021-12-01	2021-05-31	3.5	3.85	—	3.8	0.004	0.86	0.0	0.05	14.44	0.01	1.950	6.24	0.00	5.6	94.4	0.0	-1.73	0.66	0.77	1.18	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8872	1118	1	0	2	0	0	logfile
✘	7BC5	12139	2021-12-01	2020-12-18	3.1	3.06	3.11	3.1	0.005	1.05	0.0	0.05	15.92	0.01	2.314	7.83	0.76	8.2	91.8	0.0	-5.64	0.23	0.62	0.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	1200	161	1	0	0	0	0	logfile
✘	7K0K	22600	2021-12-01	2020-09-04	2.6	2.96	—	2.9	0.006	0.71	0.0	0.05	12.70	0.00	1.915	7.43	0.00	2.2	97.8	0.0	0.53	0.68	0.84	4.15	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7615	964	4	0	2	0	0	logfile
✘	7C9C	30311	2021-12-01	2020-06-05	3.33	3.44	—	3.4	0.007	0.88	0.0	0.05	17.06	0.00	1.232	5.18	0.79	5.4	94.6	0.0	-5.45	0.54	0.87	4.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7452	924	7	9	6	0	0	logfile

• Page 1 of 85
• next →