Table showing results for August 2021

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6iRS	9721	2021-08-07	2018-11-14	3.3	3.44	—	3.4	0.011	1.35	0.0	0.07	12.97	0.01	2.150	12.91	3.66	8.8	90.3	0.9	-5.69	0.62	0.77	2.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7337	926	4	0	10	0	0	logfile
✘	6DRC	7994	2021-08-12	2018-06-11	3.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	138860	8744	8	0	16	0	69384	logfile
✘	6KWX	0780	2021-08-08	2019-09-09	3.75	4.07	—	4.0	0.011	1.55	1.0	0.08	12.88	0.01	1.425	13.84	1.69	9.0	90.6	0.3	-4.69	0.68	0.72	1.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14227	1751	1	0	2	0	0	logfile
✘	6RH3	4882	2021-08-09	2019-04-18	3.6	3.97	—	3.9	0.013	1.04	0.0	0.06	12.34	0.01	1.044	13.36	0.11	13.4	86.4	0.3	-4.23	0.79	0.85	2.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26300	3207	9	58	4	0	0	logfile
✔	6NXE	0535	2021-08-31	2019-02-08	3.16	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	258000	32640	60	0	0	0	0	logfile
✘	5oYG	3861	2021-08-08	2017-09-08	4.06	4.29	4.02	4.1	0.007	1.27	10.0	0.10	12.53	0.01	2.282	5.95	1.98	6.9	93.1	0.0	-3.35	0.68	0.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11596	1418	2	0	0	0	0	logfile
✘	5LMo	4074	2021-08-08	2016-08-01	4.3	4.71	4.30	4.3	0.009	1.47	50.0	0.12	20.86	0.01	0.865	18.37	20.40	10.6	85.8	3.6	-2.76	0.80	0.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	54110	2622	29	1533	110	0	0	logfile
✘	5ooD	3837	2021-08-08	2017-08-07	3.7	3.73	3.79	3.7	0.016	1.63	0.0	0.07	12.61	0.02	1.149	7.23	0.00	5.5	92.0	2.5	-1.71	0.63	0.81	2.02	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14910	1855	10	0	20	0	0	logfile
✘	6GWT	0076	2021-08-17	2018-06-25	3.8	4.53	—	4.2	0.004	0.84	5.0	0.04	13.81	0.01	1.229	5.98	0.19	8.2	91.3	0.5	-4.05	0.85	0.83	0.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	151484	6670	59	4639	1	0	0	logfile
✘	6U59	20642	2021-08-09	2019-08-27	3.86	4.44	3.91	4.3	0.019	1.77	0.0	0.10	10.57	0.01	2.234	2.67	0.72	2.5	97.3	0.1	0.59	0.79	0.80	2.60	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20439	2412	18	0	117	0	0	logfile
✘	6Z3R	11063	2021-08-10	2020-05-21	2.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35481	2509	6	0	131	0	16494	logfile
✘	6B7N	7063	2021-08-09	2017-10-04	3.3	4.06	—	3.6	0.008	1.11	0.0	0.07	10.65	0.01	2.171	5.41	0.78	12.1	87.5	0.4	-4.33	0.88	0.85	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22215	2898	6	0	57	0	0	logfile
✘	6R81	4749	2021-08-07	2019-03-30	3.9	4.63	—	4.4	0.011	1.50	6.0	0.07	16.43	0.01	1.538	14.09	1.25	11.5	88.1	0.4	-5.27	0.71	0.82	1.01	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8861	1141	4	0	4	0	0	logfile
✘	5ZJi	6932	2021-08-11	2018-03-20	3.3	3.39	—	3.4	0.012	1.32	0.0	0.11	17.77	0.02	1.204	7.94	0.45	6.5	93.5	0.0	-3.56	0.68	0.84	3.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	44708	4087	40	0	271	0	0	logfile
✘	6o2P	0611	2021-08-07	2019-02-24	3.3	3.80	—	3.8	0.020	1.88	0.0	0.10	14.35	0.00	1.908	1.42	1.16	4.5	95.5	0.0	-3.17	0.51	0.72	2.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9767	1179	3	0	29	0	0	logfile
✘	5ooC	3836	2021-08-08	2017-08-07	3.6	3.68	3.40	3.7	0.015	1.59	0.0	0.07	12.47	0.02	1.147	8.15	0.00	4.4	92.9	2.7	-1.43	0.66	0.83	2.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14885	1855	10	0	15	0	0	logfile
✘	6KiW	0693	2021-08-10	2019-07-20	4.0	4.12	—	4.0	0.006	0.89	0.0	0.05	22.54	0.01	2.182	4.29	0.00	9.1	90.9	0.0	-3.96	0.70	0.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20225	1809	16	289	1	0	0	logfile
✘	6E7C	8998	2021-08-07	2018-07-25	3.65	3.83	3.42	3.8	0.008	0.86	0.0	0.04	12.40	0.00	1.901	7.73	0.00	6.8	93.2	0.0	-4.32	0.50	0.75	3.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6780	854	4	0	4	0	0	logfile
✘	6K61	9918	2021-08-11	2019-05-31	2.37	2.37	—	2.4	0.010	1.31	0.0	0.08	17.20	0.01	1.219	7.96	0.96	3.1	96.7	0.1	-2.65	0.60	0.88	5.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	49283	4542	44	0	259	0	0	logfile
✘	5XNL	6741	2021-08-13	2017-05-23	2.7	2.75	—	2.8	0.012	1.34	0.0	0.07	15.85	0.02	1.207	10.13	0.08	2.1	97.9	0.0	-3.12	0.55	0.78	3.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	98986	9364	136	0	490	1076	0	logfile

• ← previous
• Page 2 of 276
• next →