Table showing results for July 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6ZKC	11244	2022-07-04	2020-06-30	3.1	3.23	—	3.2	0.007	1.01	0.0	1.02	11.44	0.01	1.224	5.66	0.10	4.2	95.8	0.0	-3.11	0.66	0.83	3.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	67967	8227	71	0	45	0	0	logfile
✘	6XZR	10666	2022-07-04	2020-02-05	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6ZKT	11261	2022-07-04	2020-06-30	2.8	2.58	—	2.8	0.008	1.00	0.0	1.03	11.31	0.01	1.224	5.05	0.07	3.9	96.1	0.0	-2.94	0.57	0.81	4.03	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	66294	8070	67	0	36	0	0	logfile
✘	7JRP	22448	2022-07-07	2020-08-12	3.8	3.87	—	3.9	0.008	0.87	0.0	0.05	15.33	0.01	1.282	11.98	0.11	7.4	92.5	0.1	0.07	0.61	0.85	2.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	45166	5472	46	0	57	0	0	logfile
✘	6X32	22015	2022-07-04	2020-05-21	3.8	3.75	—	3.9	0.001	0.36	0.0	0.03	7.99	0.00	2.266	3.35	0.00	1.4	98.6	0.0	-3.72	0.56	0.69	2.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	114280	14744	16	0	1416	0	0	logfile
✘	7KDV	22830	2022-07-08	2020-10-09	4.59	8.08	5.28	6.0	0.004	0.82	0.0	0.05	12.35	0.01	2.109	13.08	0.98	5.4	94.2	0.4	-1.39	0.88	0.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	51696	6312	42	0	72	0	0	logfile
✘	6XZG	10662	2022-07-04	2020-02-04	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7JVP	22509	2022-07-03	2020-08-22	2.9	3.02	—	3.0	0.005	0.95	0.0	0.07	8.77	0.01	1.354	6.09	0.00	1.3	98.7	0.0	2.55	0.62	0.76	2.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8486	1041	6	0	12	0	0	logfile
✘	6ZKP	11257	2022-07-04	2020-06-30	3.2	3.28	—	3.2	0.010	1.04	0.0	1.02	11.80	0.01	1.220	4.75	0.13	3.8	96.2	0.0	-3.03	0.69	0.88	4.50	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	67353	8157	70	0	44	0	0	logfile
✘	6ZKi	11250	2022-07-04	2020-06-30	2.8	2.89	—	2.8	0.009	1.04	0.0	1.03	11.64	0.01	1.223	5.35	0.06	3.7	96.2	0.1	-2.73	0.75	0.87	4.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	67479	8163	70	0	46	0	0	logfile
✘	7K65	22689	2022-07-03	2020-09-18	3.4	3.95	3.54	3.9	0.003	0.61	0.0	0.04	13.43	0.00	1.391	8.37	0.00	2.9	97.1	0.0	-1.91	0.54	0.76	2.44	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8796	1120	4	0	11	0	0	logfile
✘	7CRH	30452	2022-07-04	2020-08-13	3.3	3.36	—	3.6	0.002	0.57	0.0	0.04	13.74	0.00	1.279	10.54	1.40	3.2	96.8	0.0	-2.77	0.57	0.79	1.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8068	1035	5	0	1	0	0	logfile
✘	7K4E	22666	2022-07-04	2020-09-15	4.34	5.29	—	4.9	0.005	1.04	0.0	0.06	10.89	0.01	1.304	5.91	0.56	8.2	91.8	0.0	-4.96	0.63	0.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20119	2480	8	0	5	0	0	logfile
✘	7K4B	22663	2022-07-04	2020-09-15	3.1	3.39	—	3.4	0.013	1.51	0.0	0.07	16.32	0.01	1.299	4.84	0.95	8.9	91.0	0.1	-6.09	0.56	0.82	3.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21118	2428	8	0	62	0	0	logfile
✘	6ZKL	11253	2022-07-04	2020-06-30	3.1	2.15	—	2.2	0.006	1.01	0.0	1.03	11.64	0.01	1.227	5.77	0.07	3.9	96.1	0.0	-2.99	0.56	0.74	3.16	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	67492	8162	71	0	47	0	0	logfile
✘	7CUM	30472	2022-07-05	2020-08-23	3.52	3.83	—	3.8	0.007	1.14	3.0	0.08	14.62	0.01	1.183	10.92	0.34	7.1	92.9	0.0	-4.26	0.69	0.76	2.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22214	1358	4	0	19	0	10852	logfile
✘	7D99	30617	2022-07-04	2020-10-12	2.9	3.02	—	3.1	0.009	1.09	0.0	0.06	9.63	0.01	2.187	2.92	0.41	4.7	95.1	0.1	-5.36	0.71	0.85	3.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13800	1782	8	0	14	0	0	logfile
✘	6ZKF	11247	2022-07-04	2020-06-30	2.8	2.93	—	2.9	0.008	1.01	0.0	1.03	11.55	0.01	1.224	5.26	0.06	3.4	96.6	0.0	-2.83	0.73	0.86	4.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	67440	8158	69	0	46	0	0	logfile
✘	7LFY	23309	2022-07-04	2021-01-19	3.6	3.05	—	3.4	0.004	0.58	0.0	0.04	13.12	0.00	1.239	10.22	0.25	2.3	97.7	0.0	-1.18	0.65	0.81	2.47	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14851	1800	12	0	7	4	0	logfile
✘	7LFX	23308	2022-07-04	2021-01-19	3.1	2.80	—	3.0	0.004	0.58	0.0	0.04	13.12	0.00	1.240	9.95	0.25	2.3	97.7	0.0	-1.18	0.64	0.81	2.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14846	1800	8	0	6	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 392
• next →