Table showing results for September 2021

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7oCD	12804	2021-09-03	2021-04-26	3.5	3.46	—	3.4	0.009	0.89	0.0	0.04	12.47	0.00	2.132	6.95	0.00	5.3	94.7	0.0	0.37	0.71	0.83	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13624	1920	10	0	10	0	0	logfile
✘	7RH7	24457	2021-09-06	2021-07-16	3.0	3.06	—	3.2	0.007	1.32	0.0	0.25	14.59	0.01	1.182	16.11	0.00	7.7	92.1	0.2	-0.61	0.55	0.70	2.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	93330	6072	44	0	68	0	44390	logfile
✘	7L08	23096	2021-09-03	2020-12-11	3.49	3.80	—	3.7	0.005	0.84	0.0	0.05	16.32	0.01	0.654	10.29	0.68	6.6	93.2	0.2	-3.57	0.74	0.78	1.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	168922	14304	103	2528	199	0	0	logfile
✘	7DVQ	30875	2021-09-07	2021-01-14	2.89	3.02	—	3.0	0.021	1.37	11.0	0.11	13.66	0.01	1.987	12.00	3.57	3.7	96.2	0.1	-1.62	0.63	0.81	3.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	99906	13326	57	276	17	3	0	logfile
✘	7M4V	23667	2021-09-06	2021-03-22	2.54	2.36	—	2.4	0.002	0.51	0.0	0.03	14.92	0.00	1.183	2.88	0.00	2.3	97.6	0.2	0.82	0.71	0.79	4.43	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	86404	3128	48	2847	162	802	0	logfile
✘	7DWQ	30882	2021-09-04	2021-01-17	3.3	3.86	—	3.7	0.011	0.88	0.0	0.05	14.64	0.00	1.204	14.58	0.00	4.2	95.8	0.0	0.78	0.64	0.80	2.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19961	1943	18	0	100	0	0	logfile
✘	7ASL	11897	2021-09-05	2020-10-27	4.5	5.02	—	5.1	0.015	1.83	90.0	0.15	16.07	0.01	2.081	23.92	1.04	3.0	97.0	0.0	-4.02	0.46	0.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32490	4230	18	0	0	0	0	logfile
✘	7EFD	31084	2021-09-04	2021-03-21	1.77	1.79	1.83	1.9	0.034	3.25	60.0	0.10	15.30	0.00	0.000	2.62	2.15	1.7	97.5	0.8	-0.54	0.71	0.78	5.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20020	2400	20	0	20	780	0	logfile
✘	7M4W	23668	2021-09-06	2021-03-22	2.55	1.74	—	1.6	0.008	0.57	0.0	0.05	15.01	0.01	1.760	3.05	0.02	2.8	97.0	0.2	1.38	0.77	0.74	3.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	137923	5518	76	4373	195	797	0	logfile
✘	7MKL	23898	2021-09-04	2021-04-24	3.2	2.50	—	2.1	0.004	0.82	0.0	0.06	12.45	0.01	2.162	10.10	0.00	2.9	97.1	0.0	0.35	0.64	0.58	0.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25597	3164	23	0	63	0	0	logfile
✘	7ARH	11882	2021-09-03	2020-10-25	3.3	3.57	—	3.5	0.003	0.70	0.0	0.05	12.25	0.00	2.324	2.92	0.20	3.5	96.5	0.0	-5.69	0.70	0.75	0.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9649	1261	7	0	2	0	0	logfile
✘	7oF6	12871	2021-09-07	2021-05-04	2.6	3.23	2.55	2.9	0.003	0.53	0.0	0.04	14.86	0.01	1.785	4.18	0.01	3.0	97.0	0.0	1.49	0.90	0.89	3.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	100321	8320	61	1519	94	0	0	logfile
✔	7BK0	12195	2021-09-03	2021-01-14	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	57536	7411	34	0	0	0	0	logfile
✘	7BC5	12139	2021-09-02	2020-12-18	3.1	3.06	3.11	3.1	0.005	1.05	0.0	0.05	15.92	0.01	2.314	7.83	0.76	8.2	91.8	0.0	-5.64	0.23	0.62	0.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	1200	161	1	0	0	0	0	logfile
✘	7F4G	31450	2021-09-05	2021-06-18	2.78	3.30	—	3.2	0.017	1.11	4.0	0.07	14.67	0.01	1.898	14.79	1.43	8.7	91.0	0.3	-3.97	0.69	0.81	3.30	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27957	3491	17	0	5	0	0	logfile
✘	7o4J	12720	2021-09-05	2021-04-06	2.9	2.83	2.83	2.8	0.003	0.50	1.0	0.04	14.76	0.00	1.910	4.27	0.01	2.5	97.5	0.0	0.31	0.75	0.80	3.09	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	73025	8889	43	90	22	0	0	logfile
✔	7BiN	12192	2021-09-05	2021-01-12	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	81721	10887	56	0	0	0	0	logfile
✔	7oJ8	12939	2021-09-02	2021-05-14	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9148	1150	4	0	7	0	0	logfile
✘	6ZZX	11588	2021-09-03	2020-08-05	2.7	2.80	2.77	2.8	0.024	2.75	0.0	0.12	21.74	0.02	1.178	15.51	0.00	6.0	93.8	0.2	0.75	0.75	0.88	3.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	56369	4684	68	0	403	99	0	logfile
✘	7M3M	23657	2021-09-25	2021-03-18	2.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	258518	32452	61	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 279
• next →