Table showing results for April 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6L4U	0835	2022-04-05	2019-10-21	2.4	2.57	—	2.4	0.026	2.52	13.0	0.09	20.13	0.02	1.166	7.54	1.65	6.1	93.6	0.2	-4.47	0.79	0.85	4.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	62199	5075	72	0	557	156	0	logfile
✘	6TU7	10590	2022-04-07	2020-01-03	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6U9H	20700	2022-04-09	2019-09-08	3.8	4.00	—	3.9	0.011	1.26	0.0	0.07	15.99	0.01	2.034	16.92	0.16	10.2	89.8	0.0	-4.80	0.83	0.77	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	46356	5952	24	0	24	0	0	logfile
✘	6VXM	21444	2022-04-05	2020-02-22	3.06	3.76	—	3.4	0.018	1.02	0.0	0.05	12.84	0.00	2.208	5.67	0.00	3.9	96.1	0.0	-2.02	0.75	0.81	2.38	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15064	1939	14	0	21	0	0	logfile
✘	6K33	9908	2022-04-08	2019-05-16	2.74	2.88	—	2.8	0.012	1.38	3.0	0.07	19.74	0.02	1.204	12.22	6.41	6.1	93.5	0.5	-4.27	0.75	0.74	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	137634	12681	112	0	759	21	0	logfile
✘	6ZDG	11173	2022-04-07	2020-06-14	4.7	4.97	—	4.8	0.003	0.50	0.0	0.04	8.99	0.00	1.891	7.03	2.41	3.9	96.1	0.0	0.05	0.71	0.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	28548	1884	12	0	3	0	13995	logfile
✘	6KPJ	0748	2022-04-05	2019-08-15	2.56	3.82	—	3.3	0.014	0.91	0.0	0.06	13.08	0.00	1.218	8.38	0.00	6.7	93.3	0.0	-4.33	0.85	0.86	3.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	62845	3936	24	0	48	0	31225	logfile
✘	6VXK	21442	2022-04-06	2020-02-22	3.1	3.57	—	3.2	0.011	0.83	0.0	0.05	14.64	0.00	2.122	15.31	8.05	10.5	89.5	0.0	-3.69	0.86	0.88	3.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17418	2254	8	0	18	0	0	logfile
✘	6LHS	0896	2022-04-06	2019-12-10	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22737	1456	2	0	0	0	11313	logfile
✘	6ZMo	11299	2022-04-25	2020-07-03	3.1	3.04	—	2.8	0.009	1.04	0.0	0.06	16.54	0.01	1.993	4.70	0.82	8.2	91.5	0.3	-3.58	0.86	0.84	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	230351	12939	107	5951	264	0	0	logfile
✘	6USF	20863	2022-04-07	2019-10-26	3.87	4.09	—	3.9	0.013	1.53	1.0	0.11	15.58	0.01	2.004	10.45	0.08	7.0	93.0	0.0	-4.48	0.81	0.80	1.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23022	2868	17	0	13	0	0	logfile
✘	6S3Q	10094	2022-04-05	2019-06-25	3.34	3.45	3.28	3.4	0.012	1.11	0.0	0.06	13.97	0.01	2.383	2.50	0.57	4.3	95.4	0.2	-4.53	0.66	0.86	2.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10290	1290	6	0	21	0	0	logfile
✘	6VL5	21230	2022-04-05	2020-01-22	4.5	4.57	4.20	4.4	0.018	1.68	0.0	0.10	10.25	0.01	2.242	0.64	0.20	1.2	98.8	0.0	0.88	0.79	0.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15039	1719	42	0	105	0	0	logfile
✘	6WH7	21668	2022-04-15	2020-04-07	2.78	2.79	—	2.9	0.011	0.89	0.0	0.07	9.91	0.01	1.989	20.54	0.71	3.5	96.2	0.3	-1.50	0.74	0.88	5.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	151800	19020	60	0	0	0	0	logfile
✘	6LHU	0899	2022-04-06	2019-12-10	3.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23169	1518	2	0	0	0	11483	logfile
✘	6Z2J	11041	2022-04-06	2020-05-16	4.0	4.25	3.91	4.2	0.005	0.80	0.0	0.06	15.15	0.00	1.425	3.18	0.39	7.9	92.1	0.0	-3.35	0.69	0.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18876	1185	8	0	8	0	9273	logfile
✘	6VoY	21301	2022-04-06	2020-02-01	3.7	4.09	—	4.0	0.013	1.52	30.0	0.10	24.39	0.01	1.583	34.97	0.46	2.4	97.6	0.0	-6.32	0.69	0.82	2.12	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17556	1724	16	180	6	0	0	logfile
✘	6PSV	20465	2022-04-08	2019-07-13	3.5	3.19	—	3.3	0.022	1.02	0.0	0.07	19.94	0.01	1.959	40.32	11.23	11.1	88.7	0.1	-4.43	0.67	0.79	1.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32331	3830	14	105	8	0	0	logfile
✘	6YV1	10940	2022-04-04	2020-04-27	3.4	4.09	3.01	3.7	0.002	0.58	0.0	0.04	12.66	0.00	2.272	8.02	1.85	1.0	99.0	0.0	-4.45	0.52	0.76	1.48	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	2496	328	1	0	0	0	0	logfile
✘	6WTi	21897	2022-04-05	2020-05-02	2.38	2.42	—	2.5	0.010	1.20	5.0	0.07	19.47	0.01	1.179	9.07	11.79	4.6	95.3	0.1	-3.48	0.60	0.74	1.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9980	1207	8	0	14	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 366
• next →