Table showing results for December 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✔	7BK0	12195	2022-12-19	2021-01-14	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	57536	7411	34	0	0	0	0	logfile
✔	7BiN	12192	2022-12-19	2021-01-12	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	81721	10887	56	0	0	0	0	logfile
✘	7oF0	12865	2022-12-19	2021-05-04	2.2	3.01	2.23	2.8	0.005	0.59	0.0	0.04	14.90	0.00	1.851	7.50	0.08	2.7	97.3	0.0	1.19	0.86	0.87	3.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	99476	8446	62	1432	64	0	0	logfile
✘	7E0K	30935	2022-12-18	2021-01-28	3.09	2.58	—	3.1	0.011	1.60	0.0	0.08	17.75	0.02	1.210	8.32	0.00	7.2	92.8	0.0	-3.05	0.62	0.82	4.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8044	677	6	0	58	0	0	logfile
✘	7M4P	23663	2022-12-22	2021-03-22	2.86	2.57	—	2.7	0.011	1.14	5.0	0.07	14.52	0.01	1.213	5.92	1.93	2.9	97.1	0.0	0.36	0.54	0.72	3.11	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	48616	3142	6	0	9	0	24343	logfile
✘	7DXA	30902	2022-12-18	2021-01-18	3.14	2.79	—	3.0	0.020	2.37	2.0	0.14	20.59	0.03	1.222	13.10	10.97	5.8	94.1	0.2	-4.41	0.75	0.83	2.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15162	1629	23	0	50	0	0	logfile
✘	6ZY5	11550	2022-12-18	2020-07-30	3.6	3.95	3.56	4.1	0.011	1.17	0.0	0.09	13.75	0.01	2.219	6.20	0.15	1.8	98.2	0.0	-0.64	0.73	0.74	0.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13504	1520	8	60	2	0	0	logfile
✘	7AKJ	11813	2022-12-18	2020-10-01	3.8	3.63	—	3.6	0.005	0.83	0.0	0.07	13.19	0.01	2.143	6.11	0.09	2.9	97.1	0.0	-1.03	0.79	0.79	2.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31812	3930	30	0	96	0	0	logfile
✘	7BL2	12215	2022-12-19	2021-01-18	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7LiW	23387	2022-12-18	2021-01-28	2.85	3.25	—	3.2	0.009	1.04	2.0	0.06	13.70	0.01	1.182	5.06	0.71	3.3	96.7	0.0	-3.80	0.74	0.87	4.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14598	1871	5	0	3	0	0	logfile
✘	7CH7	30370	2022-12-18	2020-07-05	3.9	4.00	—	3.9	0.007	0.94	0.0	0.05	16.39	0.01	2.096	26.29	18.11	13.6	86.4	0.0	-4.81	0.69	0.81	1.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9198	1214	6	0	0	0	0	logfile
✘	7E0J	30934	2022-12-18	2021-01-28	3.13	2.94	—	3.1	0.007	1.59	0.0	0.08	17.73	0.02	1.214	6.98	0.97	5.0	95.0	0.0	-2.78	0.59	0.82	2.44	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8140	672	6	0	56	0	0	logfile
✘	7E0H	30932	2022-12-18	2021-01-28	3.75	3.80	—	3.7	0.007	1.54	0.0	0.08	17.97	0.02	1.210	11.26	0.00	9.0	91.0	0.0	-3.64	0.68	0.76	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8017	661	6	0	57	0	0	logfile
✘	7DZ8	30926	2022-12-19	2021-01-23	3.16	3.25	—	3.2	0.011	1.68	1.0	0.07	20.65	0.02	1.209	8.52	0.19	5.7	94.3	0.0	-3.15	0.82	0.83	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	69460	5986	55	0	471	0	0	logfile
✔	7A1D	11606	2022-12-18	2020-08-12	4.19	4.02	4.19	4.1	0.006	1.04	0.0	0.06	10.62	0.01	2.253	7.83	0.35	8.4	91.6	0.0	-4.40	0.83	0.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	33032	4252	4	0	0	0	0	logfile
✘	7DZ7	30925	2022-12-19	2021-01-23	2.84	2.53	—	2.8	0.009	1.59	0.0	0.07	20.30	0.02	1.210	6.41	0.47	4.7	95.2	0.1	-2.58	0.67	0.77	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	69647	5998	55	0	471	0	0	logfile
✘	7F3T	31440	2022-12-18	2021-06-17	3.69	3.94	—	3.9	0.010	1.16	0.0	0.06	15.70	0.00	1.217	9.54	0.33	5.2	94.5	0.3	0.40	0.68	0.81	1.54	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5632	660	4	0	2	0	0	logfile
✘	7Boi	12244	2022-12-19	2021-01-25	2.98	3.76	2.97	2.9	0.007	0.72	3.0	0.05	14.40	0.00	1.227	16.40	0.00	3.6	96.4	0.0	-1.74	0.89	0.91	1.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35970	1617	16	1078	74	0	0	logfile
✘	7MLU	23910	2022-12-18	2021-04-29	4.1	5.27	—	4.2	0.004	0.88	0.0	0.05	9.47	0.01	2.271	7.23	0.21	6.4	93.6	0.0	-4.41	0.72	0.65	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21886	2746	20	0	5	0	0	logfile
✘	7EVZ	31342	2022-12-18	2021-05-24	3.07	3.81	—	3.7	0.004	0.58	0.0	0.04	13.30	0.00	2.160	7.43	0.30	3.2	96.8	0.0	-1.99	0.54	0.75	1.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9078	1144	6	0	5	0	0	logfile

• ← previous
• Page 4 of 443
• next →