Table showing results for December 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6UTF	20877	2022-12-21	2019-10-29	3.4	4.04	3.76	4.0	0.009	1.28	0.0	0.07	10.41	0.01	2.036	7.47	0.70	5.7	93.9	0.5	-3.27	0.75	0.77	1.47	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	46494	6013	28	0	0	0	0	logfile
✘	7C2K	30275	2022-12-18	2020-05-07	2.93	3.24	3.00	3.1	0.007	0.67	0.0	0.04	13.79	0.00	2.256	7.24	0.00	4.5	95.5	0.0	-2.91	0.78	0.89	4.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10692	1256	7	31	3	0	0	logfile
✔	6W20	21520	2022-12-22	2020-03-04	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	48206	6110	27	0	35	0	0	logfile
✘	6YMY	10848	2022-12-18	2020-04-10	3.41	3.81	3.50	3.7	0.008	1.25	0.0	0.06	16.55	0.01	0.424	7.47	0.27	8.9	91.0	0.1	-6.00	0.68	0.82	2.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14612	1766	19	0	16	0	0	logfile
✘	6YXR	10995	2022-12-19	2020-05-03	3.4	3.53	3.43	3.5	0.019	2.32	2.0	0.14	19.66	0.02	1.197	27.04	0.44	4.1	95.7	0.3	-3.53	0.67	0.76	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31910	2783	20	0	194	0	0	logfile
✘	7ABF	11694	2022-12-18	2020-09-07	3.9	4.03	—	3.9	0.004	0.69	0.0	0.13	11.14	0.00	1.747	4.07	0.19	11.8	88.1	0.1	-3.73	0.73	0.72	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25904	3732	17	152	3	0	0	logfile
✔	7oJ8	12939	2022-12-18	2021-05-14	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9148	1150	4	0	7	0	0	logfile
✘	6YBQ	10771	2022-12-18	2020-03-17	1.96	2.06	—	2.0	0.005	0.73	0.0	0.05	13.34	0.01	1.192	2.27	0.00	2.7	97.3	0.0	-1.94	0.82	0.87	6.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34092	4289	36	0	12	871	0	logfile
✘	6VY2	21456	2022-12-18	2020-02-25	4.86	6.05	—	5.2	0.006	0.91	0.0	0.07	14.28	0.00	2.056	18.44	4.96	5.7	93.8	0.5	-2.41	0.82	0.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21426	2442	66	0	180	0	0	logfile
✘	6XKT	22224	2022-12-18	2020-06-27	3.75	3.88	—	3.8	0.009	0.99	1.0	0.07	13.78	0.01	1.732	26.25	0.08	16.5	83.1	0.4	-4.20	0.75	0.79	2.04	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13079	1678	12	0	8	0	0	logfile
✔	6UQE	20845	2022-12-22	2019-10-18	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	48402	6140	28	0	33	0	0	logfile
✘	6ZHD	11218	2022-12-18	2020-06-22	3.7	4.31	—	3.8	0.008	1.45	10.0	0.10	12.70	0.01	1.973	5.32	0.74	3.6	96.3	0.0	-0.92	0.89	0.88	2.51	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26927	3353	29	0	66	0	0	logfile
✘	6V4D	21040	2022-12-18	2019-11-27	3.8	4.13	—	4.1	0.007	0.90	0.0	0.06	13.63	0.01	1.752	21.75	1.35	7.0	93.0	0.0	-3.84	0.49	0.80	2.10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3095	422	1	0	0	0	0	logfile
✘	7AQC	11862	2022-12-19	2020-10-21	2.99	2.20	—	2.5	0.004	0.83	0.0	0.05	16.62	0.01	1.862	5.15	0.13	5.4	94.6	0.0	-1.91	0.83	0.80	2.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	95378	3752	34	3077	0	0	0	logfile
✘	6PW6	20500	2022-12-18	2019-07-22	4.5	4.56	4.36	4.5	0.021	1.78	0.0	0.11	10.80	0.01	2.200	1.86	0.56	2.7	97.2	0.2	0.50	0.74	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15942	1842	45	0	108	0	0	logfile
✘	7JL2	22370	2022-12-20	2020-07-29	4.3	4.04	—	3.6	0.006	1.35	3.0	0.05	14.41	0.00	1.889	19.18	0.55	5.3	94.7	0.0	-0.56	0.85	0.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22128	2526	11	88	12	0	0	logfile
✘	6XZC	10658	2022-12-18	2020-02-03	3.37	3.56	3.37	3.6	0.004	0.63	0.0	0.04	12.50	0.01	2.323	2.37	3.06	1.7	98.3	0.0	-1.92	0.66	0.74	0.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13279	1694	7	0	0	0	0	logfile
✘	6WTi	21897	2022-12-18	2020-05-02	2.38	2.42	—	2.5	0.010	1.20	5.0	0.07	19.47	0.01	1.179	9.26	11.79	4.6	95.3	0.1	-3.48	0.60	0.74	1.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9980	1207	8	0	14	0	0	logfile
✘	6TRC	10558	2022-12-19	2019-12-18	2.98	3.06	—	3.1	0.010	1.16	0.0	0.07	19.32	0.02	1.220	9.53	1.42	7.9	92.1	0.0	-3.92	0.71	0.79	3.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	75591	6849	99	0	402	651	0	logfile
✘	7JPW	22425	2022-12-18	2020-08-10	3.2	3.29	—	3.2	0.015	1.06	0.0	0.06	18.76	0.01	2.068	16.08	11.04	9.6	90.3	0.1	-4.54	0.69	0.85	2.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18583	2257	4	0	12	0	0	logfile

• ← previous
• Page 4 of 443
• next →