Table showing results for April 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6RPo	4979	2022-04-09	2019-05-14	2.39	2.44	—	2.4	0.006	0.92	0.0	0.05	15.02	0.01	2.326	7.31	0.00	3.7	95.8	0.5	-2.67	0.72	0.86	4.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	101400	12060	60	0	0	0	0	logfile
✘	7D7R	30610	2022-04-04	2020-10-05	4.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-3.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7680	1160	2	0	0	0	0	logfile
✘	6VFi	21173	2022-04-04	2020-01-05	4.54	4.63	4.96	4.5	0.018	1.47	0.0	0.09	10.93	0.01	2.449	0.53	0.00	1.3	98.7	0.0	1.21	0.80	0.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	58488	7560	48	0	0	0	0	logfile
✘	6L53	0836	2022-04-05	2019-10-22	3.63	3.79	—	3.7	0.002	0.67	0.0	0.04	9.71	0.00	2.193	8.74	3.49	9.8	89.9	0.3	-4.90	0.77	0.70	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13991	1935	1	0	0	0	0	logfile
✘	6VM3	21237	2022-04-05	2020-01-27	3.07	3.76	3.02	3.5	0.025	2.33	0.0	0.12	15.81	0.03	2.282	5.90	0.92	3.1	96.9	0.0	1.08	0.80	0.86	3.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15180	1810	15	0	15	0	0	logfile
✘	6ZMo	11299	2022-04-25	2020-07-03	3.1	3.04	—	2.8	0.009	1.04	0.0	0.06	16.54	0.01	1.993	4.70	0.82	8.2	91.5	0.3	-3.58	0.86	0.84	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	230351	12939	107	5951	264	0	0	logfile
✘	6XZG	10662	2022-04-05	2020-02-04	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6VXK	21442	2022-04-06	2020-02-22	3.1	3.57	—	3.2	0.011	0.83	0.0	0.05	14.64	0.00	2.122	15.31	8.05	10.5	89.5	0.0	-3.69	0.86	0.88	3.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17418	2254	8	0	18	0	0	logfile
✘	6YXR	10995	2022-04-05	2020-05-03	3.4	3.53	3.43	3.5	0.019	2.21	2.0	0.13	19.61	0.02	1.197	27.03	0.44	4.1	95.7	0.3	-3.53	0.67	0.76	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31910	2783	20	0	194	0	0	logfile
✘	6SL5	10236	2022-04-09	2019-08-18	2.84	2.97	2.83	3.0	0.026	2.99	9.0	0.13	21.10	0.02	1.187	20.75	0.73	7.3	92.0	0.7	-3.12	0.71	0.77	2.42	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	43789	3744	36	0	292	0	0	logfile
✘	6UD3	20731	2022-04-05	2019-09-18	3.5	4.06	3.46	3.8	0.014	1.59	0.0	0.10	11.86	0.01	2.293	7.45	0.00	4.6	95.4	0.0	-1.90	0.79	0.78	1.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14346	1765	10	0	6	0	0	logfile
✘	6TU7	10590	2022-04-07	2020-01-03	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7JMi	22395	2022-04-06	2020-07-31	4.5	6.62	—	4.3	0.004	0.92	0.0	0.05	10.07	0.01	1.373	7.43	0.31	10.5	89.3	0.2	-4.79	0.58	0.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	6PV6	20486	2022-04-06	2019-07-19	4.5	5.79	—	3.8	0.006	1.04	0.0	0.05	10.65	0.01	1.373	9.43	0.31	11.0	88.9	0.1	-4.72	0.60	0.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	7CF9	30343	2022-04-05	2020-06-24	4.7	4.24	5.21	4.0	0.006	1.23	0.0	0.06	16.02	0.01	1.538	5.45	1.67	6.2	93.7	0.1	-4.86	0.79	0.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	116104	14416	12	0	1820	0	0	logfile
✘	6VL6	21231	2022-04-06	2020-01-22	4.6	5.00	4.54	4.6	0.019	1.46	0.0	0.09	11.38	0.01	2.431	0.59	0.00	0.9	99.1	0.0	0.45	0.87	0.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21504	2640	24	0	0	0	0	logfile
✘	6WoU	21861	2022-04-28	2020-04-25	3.27	3.59	3.48	3.5	0.008	0.96	6.0	0.05	18.03	0.01	2.069	3.67	1.64	13.3	86.5	0.2	-4.35	0.65	0.72	1.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	245683	16112	12	0	4	0	120439	logfile
✘	6S6B	10102	2022-04-05	2019-07-02	2.75	3.35	3.07	3.2	0.005	0.76	0.0	0.05	14.62	0.00	1.961	19.06	0.15	15.3	84.3	0.4	-5.13	0.77	0.82	2.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	66914	8194	39	51	1	0	0	logfile
✘	6VVX	21406	2022-04-07	2020-02-18	3.39	4.23	—	3.8	0.007	0.84	0.0	0.05	18.93	0.01	1.182	5.41	3.99	6.2	93.8	0.0	-3.74	0.90	0.87	1.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29858	3508	12	128	4	0	0	logfile
✘	6VVY	21407	2022-04-07	2020-02-18	3.42	4.20	—	3.8	0.007	0.87	1.0	0.05	19.81	0.01	1.180	6.14	4.85	7.6	92.3	0.1	-3.95	0.90	0.87	1.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30033	3516	12	130	4	0	0	logfile

• ← previous
• Page 4 of 366
• next →