Table showing results for April 2023

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7SL7	25193	2023-04-24	2021-10-22	3.1	3.35	—	3.4	0.002	0.56	0.0	0.04	13.08	0.00	2.149	8.91	0.24	5.5	94.2	0.3	-0.86	0.77	0.82	3.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14732	1826	10	0	0	0	0	logfile
✘	7S6C	24868	2023-04-22	2021-09-13	3.1	3.69	—	3.3	0.005	0.74	0.0	0.04	14.16	0.01	2.068	4.24	0.00	4.0	96.0	0.0	-0.30	0.82	0.76	2.85	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	47369	3190	10	0	2	0	23420	logfile
✘	7S3D	24821	2023-04-28	2021-09-05	2.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	75150	7074	78	0	417	333	0	logfile
✘	7N4U	24178	2023-04-23	2021-06-04	3.34	3.91	—	3.8	0.014	1.80	0.0	0.29	15.32	0.01	2.102	4.84	1.79	5.3	94.5	0.2	-2.74	0.58	0.74	1.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15396	1906	10	0	28	0	0	logfile
✘	8AC0	15329	2023-04-28	2022-07-05	4.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27948	3188	9	143	3	0	0	logfile
✘	7UT8	26760	2023-04-25	2022-04-26	2.43	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20221	2538	18	0	13	29	0	logfile
✘	7Z37	14472	2023-04-23	2022-03-01	3.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	5GKZ	9519	2023-04-21	2016-07-07	4.0	4.10	—	4.0	0.019	1.71	36.0	0.11	11.29	0.01	1.755	15.04	0.51	6.5	91.2	2.3	-2.89	0.72	0.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	111000	15068	12	0	4	0	0	logfile
✘	6RWN	10043	2023-04-24	2019-06-05	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18346	2076	26	86	16	8	0	logfile
✘	6WWZ	21950	2023-04-21	2020-05-09	3.34	3.53	—	3.5	0.014	1.77	0.0	0.09	13.13	0.00	2.318	2.07	0.10	4.4	95.6	0.0	-3.33	0.56	0.77	2.93	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9450	1211	6	0	0	0	0	logfile
✘	7E9P	31035	2023-04-20	2021-03-04	3.69	4.11	—	4.0	0.005	0.78	0.0	0.05	13.87	0.00	2.218	11.34	0.00	7.5	92.5	0.0	-2.51	0.74	0.81	2.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4898	639	4	0	1	0	0	logfile
✘	7UTA	26764	2023-04-27	2022-04-26	2.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24323	3068	20	0	22	55	0	logfile
✘	7KKL	22910	2023-04-19	2020-10-27	2.85	3.36	2.85	3.2	0.020	1.69	0.0	0.12	10.22	0.01	2.377	0.94	0.41	1.5	98.5	0.0	0.96	0.80	0.84	4.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	52461	3360	27	0	63	0	25437	logfile
✘	7SiX	25148	2023-04-20	2021-10-15	3.16	3.34	3.16	3.3	0.004	0.59	0.0	0.05	12.52	0.00	2.257	3.34	0.00	4.1	95.9	0.0	-1.63	0.79	0.86	4.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4621	574	6	0	4	0	0	logfile
✘	7RR6	24653	2023-04-26	2021-08-09	3.1	3.36	3.18	3.3	0.008	1.21	12.0	0.08	15.64	0.01	2.102	14.14	0.44	5.0	95.0	0.0	-1.19	0.74	0.84	3.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23821	3063	6	0	35	0	0	logfile
✘	7CUQ	30474	2023-04-21	2020-08-24	2.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9834	1199	6	0	9	0	0	logfile
✘	8E6W	27928	2023-04-25	2022-08-23	4.27	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21145	2502	13	58	18	0	53	logfile
✘	7WRL	32732	2023-04-19	2022-01-27	3.51	3.69	—	3.6	0.006	1.03	0.0	0.06	14.71	0.01	2.289	5.84	0.00	13.4	86.6	0.0	-4.19	0.64	0.78	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3251	419	3	0	0	0	0	logfile
✘	6JRS	9880	2023-04-21	2019-04-05	3.7	3.86	—	3.7	0.010	1.08	0.0	0.06	16.39	0.01	2.225	8.77	0.90	12.4	87.2	0.3	-5.87	0.74	0.80	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	112168	14652	20	0	24	0	0	logfile
✘	6JGZ	9824	2023-04-21	2019-02-16	4.6	4.96	—	4.6	0.007	1.13	0.0	0.06	11.54	0.01	2.171	11.98	0.73	11.3	88.3	0.4	-4.06	0.78	0.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	109824	14368	12	0	4	0	0	logfile

• ← previous
• Page 6 of 372
• next →