Table showing results for May 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6Ui9	20783	2022-05-16	2019-09-30	3.1	3.28	—	3.3	0.012	1.23	0.0	0.07	15.82	0.01	1.023	6.72	0.27	6.7	93.1	0.2	-3.91	0.67	0.67	2.57	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31951	4084	8	0	12	0	0	logfile
✘	5NUG	3698	2022-05-18	2017-04-30	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-0.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	46232	5840	4	0	10	0	0	logfile
✘	6K7L	9939	2022-05-13	2019-06-07	2.83	2.93	2.81	2.9	0.012	1.15	0.0	0.07	15.48	0.01	1.976	4.83	0.17	7.5	92.3	0.2	-3.27	0.58	0.83	3.57	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10615	1317	4	0	8	0	0	logfile
✘	5GW5	9541	2022-05-13	2016-09-08	4.6	4.75	—	4.7	0.002	0.58	0.0	0.04	7.37	0.00	2.136	6.96	0.01	4.5	95.4	0.1	-3.73	0.74	0.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	64544	8446	16	0	0	0	0	logfile
✘	6C0W	7326	2022-05-13	2018-01-02	4.0	4.10	3.87	4.0	0.006	0.81	0.0	0.05	27.80	0.01	2.107	4.30	0.00	4.9	95.1	0.0	-4.19	0.80	0.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13122	925	11	278	0	0	0	logfile
✘	6RHZ	4883	2022-05-16	2019-04-23	3.2	3.48	3.18	3.4	0.008	1.15	0.0	0.10	19.68	0.02	1.172	4.66	0.00	3.7	96.2	0.1	-3.89	0.70	0.76	1.85	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	53055	2783	20	0	193	0	21167	logfile
✘	6PoD	20412	2022-05-12	2019-07-03	4.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	53637	3427	20	0	25	0	26898	logfile
✘	6RBE	4794	2022-05-15	2019-04-10	3.8	4.03	3.73	40.0	0.007	1.27	0.0	0.06	18.44	0.01	2.076	9.23	1.35	11.9	86.8	1.2	-4.17	0.25	0.02	0.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	72721	4512	33	1750	0	0	0	logfile
✘	6KMX	0727	2022-05-13	2019-08-01	2.41	2.47	—	2.4	0.025	2.34	0.0	0.08	19.68	0.03	1.209	6.49	2.13	3.1	96.8	0.1	-4.21	0.75	0.87	4.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	65112	5919	72	0	363	636	0	logfile
✘	6QEL	4537	2022-05-13	2019-01-08	3.9	4.04	—	4.0	0.011	1.02	0.0	0.05	11.57	0.01	1.292	4.73	0.46	11.6	88.4	0.0	-4.53	0.79	0.76	1.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	64816	4092	24	0	24	0	32302	logfile
✘	6JSi	9882	2022-05-13	2019-04-08	4.7	4.70	—	4.6	0.007	1.48	0.0	0.06	15.33	0.01	2.231	10.68	2.42	23.2	72.3	4.5	-6.05	0.64	0.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	62820	5844	9	0	4044	0	0	logfile
✘	5W7G	8780	2022-05-12	2017-06-19	4.5	4.20	—	4.2	0.015	1.17	0.0	0.07	15.16	0.01	2.165	7.63	0.45	1.2	98.8	0.0	-0.31	0.50	0.47	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	53508	5397	44	504	0	0	0	logfile
✘	6KN8	0729	2022-05-13	2019-08-03	4.8	8.89	—	8.4	0.019	1.81	10.0	0.10	12.39	0.01	2.211	9.51	0.41	2.0	97.4	0.5	-0.24	0.74	0.43	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	60966	7669	44	0	15	0	0	logfile
✘	6EF0	9042	2022-05-15	2018-08-15	4.43	3.84	—	4.1	0.011	1.07	0.0	0.06	12.59	0.01	2.089	8.62	0.00	16.8	83.2	0.0	-5.24	0.62	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24748	3318	20	0	6	0	0	logfile
✘	6Po1	20406	2022-05-12	2019-07-03	4.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	53244	3407	20	0	18	0	26717	logfile
✘	6HE4	0209	2022-05-13	2018-08-20	4.85	4.88	—	4.8	0.036	3.64	111.0	0.21	18.70	0.03	1.953	1.87	3.66	6.4	89.5	4.1	-2.84	0.55	0.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12684	1602	11	0	10	0	0	logfile
✘	6J5T	0680	2022-05-12	2019-01-12	3.4	3.94	—	3.0	0.009	1.20	0.0	0.07	11.49	0.01	1.182	7.11	0.59	11.3	88.4	0.3	-4.25	0.83	0.67	0.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	53488	6640	25	0	15	0	0	logfile
✘	6oSM	20186	2022-05-12	2019-05-01	3.4	3.31	—	3.4	0.012	1.45	0.0	0.09	14.06	0.00	2.183	28.91	14.88	34.5	65.5	0.0	-5.34	0.46	0.74	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4100	600	10	0	0	0	0	logfile
✘	6E2G	8962	2022-05-14	2018-07-11	3.6	4.05	—	3.9	0.010	1.21	0.0	0.06	11.96	0.01	2.249	4.70	1.05	12.4	87.2	0.4	-5.78	0.69	0.83	2.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21108	2637	7	0	6	0	0	logfile
✘	6oPC	20149	2022-05-16	2019-04-24	3.7	4.08	—	3.7	0.010	1.06	4.0	0.06	14.10	0.02	1.515	5.03	0.09	8.2	91.1	0.7	-4.20	0.79	0.71	1.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30015	4455	13	0	48	0	0	logfile

• ← previous
• Page 4 of 376
• next →