Table showing results for September 2021

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6oPC	20149	2021-09-05	2019-04-24	3.7	4.08	—	3.7	0.010	1.05	4.0	0.06	14.10	0.02	1.515	5.04	0.09	8.2	91.1	0.7	-4.20	0.79	0.71	1.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30015	4455	13	0	48	0	0	logfile
✘	6DRC	7994	2021-09-06	2018-06-11	3.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	138860	8744	8	0	16	0	69384	logfile
✔	6V1G	21011	2021-09-24	2019-11-20	2.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	249900	31200	120	120	0	0	0	logfile
✘	6oLM	20117	2021-09-04	2019-04-16	4.4	5.29	—	4.3	0.012	1.28	0.0	0.06	6.94	0.01	2.397	0.92	0.00	2.0	98.0	0.0	-0.33	0.89	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10602	2112	12	0	6	0	0	logfile
✘	6iRS	9721	2021-09-02	2018-11-14	3.3	3.44	—	3.4	0.011	1.35	0.0	0.07	12.97	0.01	2.150	12.91	3.66	8.8	90.3	0.9	-5.69	0.62	0.77	2.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7337	926	4	0	10	0	0	logfile
✘	6E7C	8998	2021-09-02	2018-07-25	3.65	3.83	3.42	3.8	0.008	0.86	0.0	0.04	12.40	0.00	1.901	7.73	0.00	6.8	93.2	0.0	-4.32	0.50	0.75	3.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6780	854	4	0	4	0	0	logfile
✘	6U59	20642	2021-09-04	2019-08-27	3.86	4.44	3.91	4.3	0.019	1.77	0.0	0.10	10.57	0.01	2.234	2.67	0.72	2.5	97.3	0.1	0.59	0.79	0.80	2.60	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20439	2412	18	0	117	0	0	logfile
✘	5LMo	4074	2021-09-02	2016-08-01	4.3	4.71	4.30	4.3	0.009	1.47	50.0	0.12	20.86	0.01	0.865	18.37	20.40	10.6	85.8	3.6	-2.76	0.80	0.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	54110	2622	29	1533	110	0	0	logfile
✘	6GXo	0082	2021-09-11	2018-06-27	3.9	4.77	—	4.3	0.004	0.82	4.0	0.04	13.92	0.01	0.695	7.12	0.15	8.2	91.3	0.5	-3.98	0.85	0.83	0.32	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	151479	6643	59	4643	1	0	0	logfile
✘	6GWT	0076	2021-09-11	2018-06-25	3.8	4.53	—	4.2	0.004	0.84	5.0	0.04	13.81	0.01	1.229	5.98	0.19	8.2	91.3	0.5	-4.05	0.85	0.83	0.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	151484	6670	59	4639	1	0	0	logfile
✘	5A1A	2984	2021-09-05	2015-04-29	2.2	2.04	2.58	2.5	0.009	1.21	0.0	0.04	13.14	0.01	0.020	13.89	1.03	3.9	95.5	0.6	-1.86	0.53	0.76	4.20	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	33696	4088	12	0	20	776	0	logfile
✘	5ooC	3836	2021-09-03	2017-08-07	3.6	3.68	3.40	3.7	0.015	1.59	0.0	0.07	12.47	0.02	1.147	8.15	0.00	4.4	92.9	2.7	-1.43	0.66	0.83	2.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14885	1855	10	0	15	0	0	logfile
✘	6GXM	0080	2021-09-11	2018-06-27	3.8	4.73	—	4.3	0.004	0.81	0.0	0.04	13.85	0.01	1.229	6.05	0.20	8.4	91.2	0.4	-4.08	0.85	0.83	0.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	151394	6643	59	4639	1	0	0	logfile
✘	6GXP	0083	2021-09-09	2018-06-27	4.4	5.60	—	5.1	0.003	0.80	6.0	0.04	14.00	0.01	1.229	5.43	0.27	8.3	91.2	0.5	-4.12	0.84	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	147637	6392	56	4555	1	0	0	logfile
✘	6iH9	9671	2021-09-22	2018-09-29	2.8	2.91	—	3.5	0.008	0.94	0.0	0.05	10.02	0.01	1.244	43.37	0.65	4.2	95.6	0.2	-2.32	0.34	0.23	0.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	248580	31020	60	0	0	0	0	logfile
✘	6BX0	7301	2021-09-25	2017-12-15	3.79	4.07	—	4.0	0.010	1.28	180.0	0.08	11.39	0.01	1.342	41.95	2.59	4.5	95.3	0.2	-3.37	0.53	0.67	3.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	259560	32100	60	0	0	0	0	logfile
✘	4V8Y	2421	2021-09-13	2013-07-20	4.3	4.35	—	4.3	0.026	1.73	246.0	0.10	19.96	0.02	0.030	35.19	23.07	10.6	82.9	6.5	-4.49	0.62	0.65	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	221288	12072	110	5354	711	0	7033	logfile
✘	6BX1	7302	2021-09-25	2017-12-15	3.25	3.31	—	3.4	0.009	1.00	120.0	0.07	10.33	0.01	0.683	20.60	1.07	3.9	95.9	0.2	-2.14	0.71	0.87	5.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	261180	32400	60	0	0	0	0	logfile
✘	5A7U	3079	2021-09-02	2015-07-10	4.8	3.82	—	4.6	0.020	3.41	3.0	0.25	21.78	0.08	2.651	28.57	25.00	24.0	72.0	4.0	-6.05	-0.01	0.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	455	27	1	0	1	0	231	logfile
✘	6UiW	20789	2021-09-04	2019-10-01	2.7	3.36	—	3.1	0.010	0.99	0.0	0.05	14.23	0.01	1.838	6.39	1.10	3.1	96.9	0.0	-3.44	0.71	0.81	4.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23617	3234	22	0	11	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 279
• next →