Table showing results for April 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6USF	20863	2022-04-07	2019-10-26	3.87	4.09	—	3.9	0.013	1.53	1.0	0.11	15.58	0.01	2.004	10.45	0.08	7.0	93.0	0.0	-4.48	0.81	0.80	1.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23022	2868	17	0	13	0	0	logfile
✘	6WH7	21668	2022-04-15	2020-04-07	2.78	2.79	—	2.9	0.011	0.89	0.0	0.07	9.91	0.01	1.989	20.54	0.71	3.5	96.2	0.3	-1.50	0.74	0.88	5.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	151800	19020	60	0	0	0	0	logfile
✘	6L4T	0834	2022-04-07	2019-10-21	2.6	2.86	—	2.7	0.026	2.50	0.0	0.07	19.28	0.02	1.166	8.87	0.27	8.0	91.8	0.2	-5.26	0.67	0.84	3.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23863	1851	26	0	192	12	0	logfile
✘	6VoN	21270	2022-04-09	2020-01-30	3.35	2.69	—	3.0	0.006	0.98	0.0	0.05	15.34	0.01	2.133	8.33	0.05	5.8	94.1	0.1	-3.10	0.72	0.74	2.09	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	39163	5186	32	0	7	0	0	logfile
✘	6ZDG	11173	2022-04-07	2020-06-14	4.7	4.97	—	4.8	0.003	0.50	0.0	0.04	8.99	0.00	1.891	7.03	2.41	3.9	96.1	0.0	0.05	0.71	0.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	28548	1884	12	0	3	0	13995	logfile
✘	6WXV	21964	2022-04-05	2020-05-12	3.3	3.75	—	3.7	0.008	0.90	2.0	0.05	13.45	0.01	1.248	9.50	0.47	5.5	94.4	0.2	-4.42	0.71	0.77	2.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10605	1319	5	0	15	0	0	logfile
✘	6UZV	20963	2022-04-07	2019-11-15	3.1	3.13	—	3.2	0.010	1.06	0.0	0.06	20.29	0.04	1.217	11.43	0.89	4.2	95.8	0.0	-1.85	0.71	0.84	3.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	72606	6711	60	0	408	0	0	logfile
✘	6WJV	21701	2022-04-06	2020-04-14	3.5	3.60	—	3.5	0.009	1.66	1.0	0.08	15.51	0.01	1.466	5.97	0.05	7.2	92.8	0.0	-5.50	0.75	0.66	0.87	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19593	2567	5	0	1	0	0	logfile
✘	6Z2J	11041	2022-04-06	2020-05-16	4.0	4.25	3.91	4.2	0.005	0.80	0.0	0.06	15.15	0.00	1.425	3.18	0.39	7.9	92.1	0.0	-3.35	0.69	0.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18876	1185	8	0	8	0	9273	logfile
✘	6VXM	21444	2022-04-05	2020-02-22	3.06	3.76	—	3.4	0.018	1.02	0.0	0.05	12.84	0.00	2.208	5.67	0.00	3.9	96.1	0.0	-2.02	0.75	0.81	2.38	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15064	1939	14	0	21	0	0	logfile
✘	6Z3R	11063	2022-04-08	2020-05-21	2.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35481	2509	6	0	131	0	16494	logfile
✘	6LHS	0896	2022-04-06	2019-12-10	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22737	1456	2	0	0	0	11313	logfile
✘	6U9H	20700	2022-04-09	2019-09-08	3.8	4.00	—	3.9	0.011	1.26	0.0	0.07	15.99	0.01	2.034	16.92	0.16	10.2	89.8	0.0	-4.80	0.83	0.77	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	46356	5952	24	0	24	0	0	logfile
✘	6Z2K	11042	2022-04-08	2020-05-16	4.5	4.70	4.41	4.5	0.006	0.97	0.0	0.08	14.93	0.01	1.425	5.20	0.15	9.0	90.8	0.2	-3.76	0.80	0.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	37843	2379	19	0	16	0	18577	logfile
✘	6LHU	0899	2022-04-06	2019-12-10	3.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23169	1518	2	0	0	0	11483	logfile
✘	6KWY	0781	2022-04-04	2019-09-09	2.72	2.94	—	2.9	0.011	1.23	3.0	0.07	10.95	0.01	1.425	8.33	0.95	5.5	94.4	0.1	-3.13	0.78	0.83	4.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	62499	7968	29	0	2	0	0	logfile
✘	6L4U	0835	2022-04-05	2019-10-21	2.4	2.57	—	2.4	0.026	2.52	13.0	0.09	20.13	0.02	1.166	7.54	1.65	6.1	93.6	0.2	-4.47	0.79	0.85	4.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	62199	5075	72	0	557	156	0	logfile
✘	6LSS	0964	2022-04-09	2020-01-20	3.23	3.30	—	3.2	0.011	1.14	5.0	0.06	16.92	0.03	1.330	4.42	0.86	7.7	92.1	0.2	-4.03	0.79	0.81	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	140565	7369	67	3750	250	16	20	logfile
✘	6YMX	10847	2022-04-09	2020-04-10	3.17	3.73	3.27	3.6	0.010	1.11	0.0	0.06	15.99	0.01	1.201	6.90	0.39	6.1	93.9	0.1	-5.84	0.76	0.85	2.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	47034	5759	47	0	38	0	0	logfile
✘	6YMY	10848	2022-04-05	2020-04-10	3.41	3.81	3.50	3.7	0.008	1.25	0.0	0.06	16.55	0.01	0.424	7.43	0.27	8.9	91.0	0.1	-6.00	0.68	0.82	2.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14612	1766	19	0	16	0	0	logfile

• ← previous
• Page 2 of 366
• next →