Table showing results for July 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6Ui9	20783	2022-07-06	2019-09-30	3.1	3.28	—	3.3	0.012	1.23	0.0	0.07	15.82	0.01	1.023	6.72	0.27	6.7	93.1	0.2	-3.91	0.67	0.67	2.57	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31951	4084	8	0	12	0	0	logfile
✘	6EF0	9042	2022-07-05	2018-08-15	4.43	3.84	—	4.1	0.011	1.07	0.0	0.06	12.59	0.01	2.089	8.62	0.00	16.8	83.2	0.0	-5.24	0.62	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24748	3318	20	0	6	0	0	logfile
✘	6V39	21030	2022-07-07	2019-11-25	3.04	3.20	—	3.1	0.003	0.48	0.0	0.03	14.58	0.00	1.179	6.23	0.00	2.5	97.4	0.1	-1.02	0.86	0.85	2.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	141897	5458	70	4615	116	273	0	logfile
✘	6UUW	20902	2022-07-06	2019-11-01	2.85	2.97	—	2.9	0.011	0.83	0.0	0.06	13.92	0.01	1.179	20.01	0.99	5.0	94.8	0.2	-4.59	0.74	0.85	4.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32438	4136	12	0	8	29	0	logfile
✘	6V3A	21031	2022-07-07	2019-11-25	2.82	3.02	—	3.0	0.003	0.51	0.0	0.03	14.39	0.00	1.179	6.00	0.07	2.8	97.2	0.1	-1.23	0.82	0.82	2.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	142113	5457	74	4615	95	520	0	logfile
✘	5M32	4146	2022-07-05	2016-10-14	3.8	3.96	—	3.8	0.009	1.47	12.0	0.07	13.19	0.01	0.185	19.68	3.10	14.4	83.9	1.7	-5.42	0.81	0.79	1.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	76085	10500	52	0	8	0	0	logfile
✘	5YKG	6833	2022-07-08	2017-10-14	4.57	4.68	4.39	4.4	0.005	0.71	4.0	0.04	13.41	0.01	2.245	13.33	7.90	4.2	95.6	0.1	-2.42	0.73	0.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	50868	6536	16	0	12	0	0	logfile
✘	6N1W	9320	2022-07-06	2018-11-12	4.2	4.55	—	4.3	0.005	0.82	0.0	0.05	12.95	0.01	2.314	5.82	7.06	5.3	94.7	0.0	-3.05	0.81	0.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31905	3852	27	0	138	0	0	logfile
✘	6N9X	0382	2022-07-04	2018-12-04	4.1	4.18	—	4.1	0.005	0.84	0.0	0.05	13.69	0.02	1.250	3.73	0.60	3.9	96.1	0.0	-4.04	0.74	0.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19658	2419	14	31	12	0	0	logfile
✘	6N06	9311	2022-07-05	2018-11-06	3.4	3.49	—	3.5	0.005	0.74	0.0	0.05	8.24	0.01	2.241	7.24	0.04	1.9	98.1	0.0	-4.01	0.76	0.86	3.99	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	28197	3915	39	0	0	0	0	logfile
✘	6C0W	7326	2022-07-03	2018-01-02	4.0	4.10	3.87	4.0	0.006	0.81	0.0	0.05	27.80	0.01	2.107	4.30	0.00	4.9	95.1	0.0	-4.19	0.80	0.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13122	925	11	278	0	0	0	logfile
✘	6N9U	0379	2022-07-03	2018-12-04	3.7	3.80	—	3.7	0.005	0.84	0.0	0.05	12.70	0.01	1.189	3.72	0.34	5.3	94.7	0.0	-4.67	0.75	0.82	3.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8822	1063	7	18	4	0	0	logfile
✘	6Jo5	9853	2022-07-08	2019-03-20	2.9	2.97	—	2.9	0.028	2.73	0.0	0.09	18.14	0.02	1.209	12.17	0.43	4.0	96.0	0.1	-2.29	0.79	0.84	3.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	48476	4170	40	0	313	0	0	logfile
✘	6HiZ	0233	2022-07-05	2018-08-31	3.08	3.20	3.05	3.1	0.009	1.38	0.0	0.06	18.06	0.01	1.229	11.28	12.80	3.2	96.7	0.1	-2.90	0.89	0.91	2.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	76845	9056	33	143	19	3	0	logfile
✘	6J6i	0688	2022-07-07	2019-01-15	3.7	3.66	—	3.6	0.007	1.12	0.0	0.06	11.66	0.01	1.183	6.90	0.72	10.1	89.6	0.3	-4.37	0.82	0.83	2.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35992	4470	13	0	7	0	0	logfile
✘	6NSJ	0498	2022-07-03	2019-01-24	2.7	3.69	2.67	3.6	0.007	1.06	0.0	0.06	10.76	0.01	1.182	8.25	2.18	6.0	94.0	0.0	-4.40	0.61	0.75	5.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9096	1092	12	0	18	0	0	logfile
✘	6MZV	9308	2022-07-06	2018-11-05	3.4	3.57	—	3.5	0.006	0.73	0.0	0.05	8.48	0.01	2.343	7.32	0.34	3.4	96.6	0.0	-4.51	0.79	0.86	4.27	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32833	4523	42	0	0	0	0	logfile
✘	6KMW	0726	2022-07-03	2019-08-01	2.35	2.41	—	2.4	0.026	2.51	0.0	0.08	20.93	0.03	1.212	6.39	3.70	4.3	95.6	0.1	-4.06	0.77	0.85	4.54	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	64083	5739	63	0	366	627	0	logfile
✘	6QCM	4508	2022-07-02	2018-12-28	4.21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6KMX	0727	2022-07-04	2019-08-01	2.41	2.47	—	2.4	0.025	2.34	0.0	0.08	19.68	0.03	1.209	6.49	2.13	3.1	96.8	0.1	-4.21	0.75	0.87	4.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	65112	5919	72	0	363	636	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 392
• next →