Table showing results for July 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7B2L	11987	2022-07-05	2020-11-27	3.9	3.99	3.82	3.9	0.013	1.96	32.0	0.11	16.21	0.02	1.393	2.87	3.78	5.8	93.6	0.6	-1.26	0.83	0.78	1.17	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26192	3152	28	0	20	0	0	logfile
✘	7E0H	30932	2022-07-03	2021-01-28	3.75	3.80	—	3.7	0.006	1.45	0.0	0.06	18.08	0.02	1.210	11.25	0.00	9.0	91.0	0.0	-3.64	0.68	0.76	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8017	661	6	0	57	0	0	logfile
✘	7ALN	11818	2022-07-04	2020-10-06	3.77	3.85	—	3.8	0.009	0.95	0.0	0.06	10.60	0.01	1.198	10.50	0.22	4.1	95.8	0.0	-3.95	0.60	0.82	2.71	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20789	2616	11	0	13	0	0	logfile
✘	6WHG	21672	2022-07-04	2020-04-08	3.1	2.89	3.05	3.1	0.009	1.12	0.0	0.07	16.14	0.01	1.174	2.65	1.98	3.1	96.9	0.0	-1.32	0.66	0.80	3.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17116	2092	8	0	12	0	0	logfile
✘	7D9T	30620	2022-07-03	2020-10-14	4.1	4.18	—	3.9	0.003	0.57	0.0	0.04	10.99	0.00	2.230	6.95	0.00	3.9	96.1	0.0	-1.91	0.84	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7451	1079	2	0	1	0	0	logfile
✘	7EB2	31049	2022-07-04	2021-03-08	3.5	3.43	—	3.4	0.007	0.74	0.0	0.05	11.69	0.00	1.256	7.85	0.00	3.6	96.4	0.0	-1.24	0.79	0.74	1.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18497	2337	8	0	2	0	0	logfile
✘	7EFD	31084	2022-07-04	2021-03-21	1.77	1.79	1.83	1.9	0.033	3.16	60.0	0.09	15.47	0.02	0.000	2.38	2.15	1.7	97.5	0.8	-0.54	0.71	0.78	5.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20020	2400	20	0	20	780	0	logfile
✘	7MKL	23898	2022-07-05	2021-04-24	3.2	2.50	—	2.1	0.004	0.82	0.0	0.06	12.45	0.01	2.162	10.30	0.00	2.9	97.1	0.0	0.35	0.64	0.58	0.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25597	3164	23	0	63	0	0	logfile
✘	7M4U	23666	2022-07-02	2021-03-22	2.71	1.78	—	1.6	0.003	0.54	2.0	0.04	14.67	0.00	1.182	4.49	0.20	3.1	96.7	0.2	1.08	0.79	0.76	3.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	51764	2386	27	1528	84	191	0	logfile
✘	7S9Y	24941	2022-07-03	2021-09-21	3.56	3.89	—	3.9	0.007	0.93	0.0	0.05	13.74	0.01	1.241	10.16	0.00	8.2	91.8	0.0	-1.32	0.69	0.82	3.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7395	901	1	0	3	0	0	logfile
✘	7oTW	13068	2022-07-06	2021-06-10	2.99	3.85	—	3.2	0.009	0.94	0.0	0.05	14.13	0.01	1.219	16.27	0.28	10.0	89.9	0.2	-2.30	0.80	0.71	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29038	3636	1	0	21	0	0	logfile
✘	7RX5	24725	2022-07-03	2021-08-21	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9348	1189	41	0	0	0	0	logfile
✘	7DX4	30895	2022-07-03	2021-01-18	3.6	3.96	—	3.8	0.007	0.99	0.0	0.06	10.06	0.01	0.766	7.28	0.23	6.0	93.7	0.3	-4.20	0.71	0.79	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8234	1027	6	0	5	0	0	logfile
✘	7SPi	24771	2022-07-03	2021-11-02	2.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7P06	13145	2022-07-05	2021-06-29	3.77	4.42	—	4.0	0.005	0.71	0.0	0.04	13.79	0.01	1.299	9.20	0.00	5.5	94.5	0.0	-0.50	0.71	0.77	2.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21476	1350	1	0	3	0	10638	logfile
✘	7LQY	23491	2022-07-05	2021-02-15	3.19	3.30	—	3.3	0.011	1.36	0.0	0.05	20.43	0.01	1.180	4.96	0.69	6.6	93.3	0.2	-5.23	0.74	0.81	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22954	2636	8	0	38	0	0	logfile
✘	7KRo	23008	2022-07-05	2020-11-20	3.6	4.10	—	4.0	0.008	0.73	0.0	0.05	14.56	0.00	1.225	9.00	9.40	6.9	92.8	0.3	-1.73	0.79	0.81	1.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21988	2553	11	80	19	0	0	logfile
✔	7oJ8	12939	2022-07-03	2021-05-14	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9148	1150	4	0	7	0	0	logfile
✘	7oH6	12895	2022-07-03	2021-05-09	3.0	3.69	3.20	3.6	0.003	0.99	0.0	0.04	10.25	0.00	1.184	5.10	1.20	4.0	96.0	0.0	-2.49	0.65	0.74	2.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11552	1414	7	0	10	2	0	logfile
✘	7oH7	12896	2022-07-03	2021-05-09	3.8	4.09	3.79	3.9	0.004	0.60	0.0	0.04	10.39	0.00	1.184	7.15	1.20	4.7	95.3	0.0	-3.01	0.64	0.69	1.65	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11552	1414	6	0	11	3	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 392
• next →