Table showing results for December 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7XYB	33516	2022-12-18	2022-06-01	3.7	4.48	3.71	3.3	0.005	0.75	1.0	0.05	16.21	0.00	1.956	17.43	0.62	4.8	95.0	0.2	-0.49	0.87	0.82	1.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22525	3187	10	65	1	0	0	logfile
✔	7V0K	26943	2022-12-18	2022-05-10	2.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32037	3997	22	0	14	554	0	logfile
✘	7XTC	33446	2022-12-18	2022-05-16	3.2	3.40	3.31	3.4	0.006	0.59	0.0	0.04	12.99	0.00	1.913	4.53	0.00	1.4	98.6	0.0	1.71	0.54	0.70	2.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16301	1038	5	0	2	0	8097	logfile
✘	7XYA	33515	2022-12-18	2022-06-01	3.3	3.39	3.24	3.2	0.004	0.68	1.0	0.04	18.79	0.00	1.962	11.61	1.00	4.0	95.9	0.0	-0.19	0.81	0.84	1.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26550	3479	11	126	1	0	0	logfile
✔	7PSD	13612	2022-12-18	2021-09-22	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9032	1160	2	0	0	0	0	logfile
✘	7SK6	25174	2022-12-18	2021-10-19	4.0	4.42	—	4.1	0.018	1.92	2.0	0.11	13.16	0.01	2.462	0.21	0.76	4.2	94.0	1.8	0.35	0.52	0.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9144	585	4	0	0	0	4462	logfile
✘	7XL4	33272	2022-12-18	2022-04-21	3.86	3.92	—	3.8	0.001	0.36	0.0	0.04	9.42	0.00	2.274	4.13	0.00	1.4	98.6	0.0	-4.82	0.78	0.75	1.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24560	3479	8	0	3	0	0	logfile
✘	7XL3	33271	2022-12-18	2022-04-21	3.13	3.20	—	3.2	0.002	0.39	0.0	0.04	12.03	0.00	2.263	4.81	1.08	2.9	97.1	0.0	-4.73	0.73	0.79	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25700	3480	8	0	3	0	0	logfile
✘	7UZE	26886	2022-12-18	2022-05-09	2.4	2.27	2.42	2.3	0.003	0.58	0.0	0.04	15.32	0.00	2.040	3.82	0.68	3.0	96.6	0.4	1.69	0.66	0.88	6.32	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14969	988	12	0	4	113	7392	logfile
✘	8CVX	27020	2022-12-18	2022-05-18	3.39	3.62	3.40	3.6	0.009	1.58	16.0	0.11	16.44	0.01	2.272	8.22	5.13	4.5	95.3	0.2	-3.03	0.64	0.74	1.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20448	2541	12	0	4	0	0	logfile
✘	7UY8	26867	2022-12-18	2022-05-06	4.5	8.56	4.38	4.2	0.003	0.63	1.0	0.05	14.55	0.00	2.207	8.85	0.00	6.1	93.9	0.0	-0.66	0.79	0.60	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9552	1161	5	0	1	0	0	logfile
✘	7VY1	32191	2022-12-20	2021-11-13	3.3	3.60	—	3.6	0.007	0.82	0.0	0.04	17.76	0.00	2.061	9.23	0.20	4.4	95.6	0.0	1.76	0.77	0.89	2.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	38899	4652	44	0	24	0	0	logfile
✘	7VF9	31948	2022-12-18	2021-09-10	4.04	4.13	—	4.1	0.001	0.38	0.0	0.04	9.65	0.00	2.176	3.71	0.05	1.5	98.5	0.0	-4.44	0.74	0.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24247	3425	7	0	3	0	0	logfile
✘	7URC	26708	2022-12-18	2022-04-21	3.14	3.74	3.25	3.6	0.017	0.98	0.0	0.88	13.59	0.00	1.182	10.27	0.00	3.5	96.5	0.0	-3.02	0.58	0.86	3.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5561	658	4	0	12	0	0	logfile
✘	8H0Y	34418	2022-12-18	2022-09-30	2.85	3.06	2.88	3.0	0.008	0.82	0.0	0.06	13.16	0.01	2.274	2.64	0.00	3.2	96.8	0.0	-1.19	0.81	0.86	3.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24999	3094	6	0	52	0	0	logfile
✘	7WoN	32652	2022-12-18	2022-01-22	3.9	4.07	—	4.0	0.006	0.97	0.0	0.06	15.10	0.01	2.035	5.41	0.28	9.8	90.2	0.0	-4.42	0.67	0.83	2.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3318	425	4	0	2	0	0	logfile
✘	7VDD	31914	2022-12-18	2021-09-06	3.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11940	1044	10	0	0	0	3736	logfile
✘	7Z5J	14522	2022-12-22	2022-03-09	2.58	3.23	2.56	3.1	0.022	1.37	14.0	0.08	12.35	0.01	1.486	7.21	1.03	4.3	95.4	0.2	-3.15	0.81	0.80	5.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25576	3234	24	0	54	0	0	logfile
✘	8DH6	27430	2022-12-18	2022-06-25	2.94	3.31	3.02	3.3	0.006	1.04	0.0	0.05	14.94	0.01	1.241	12.48	0.15	4.9	95.1	0.1	0.12	0.66	0.83	3.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12901	1560	16	0	17	0	0	logfile
✔	7T8B	25743	2022-12-18	2021-12-16	3.8	2.77	3.90	2.3	0.002	0.47	0.0	0.04	8.77	0.00	2.205	7.91	1.40	4.3	95.6	0.2	-0.32	0.73	0.72	2.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	33025	4131	8	0	0	0	0	logfile

• Page 1 of 443
• next →