Table showing results for December 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7D72	30599	2022-12-19	2020-10-02	3.4	3.58	—	3.5	0.009	1.23	4.0	0.07	17.20	0.01	1.640	10.30	8.56	4.9	94.8	0.2	-2.44	0.74	0.83	2.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35458	4505	27	0	15	6	0	logfile
✘	7ASL	11897	2022-12-18	2020-10-27	4.5	5.02	—	5.1	0.015	1.83	90.0	0.15	16.07	0.01	2.081	24.02	1.04	3.0	97.0	0.0	-4.02	0.46	0.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32490	4230	18	0	0	0	0	logfile
✘	7D73	30600	2022-12-19	2020-10-02	3.0	2.48	—	2.7	0.011	1.23	7.0	0.07	19.92	0.01	1.302	10.11	10.36	6.3	93.4	0.3	-3.01	0.55	0.71	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35292	4495	24	0	12	0	0	logfile
✔	7MKQ	23903	2022-12-18	2021-04-26	4.8	4.92	—	4.8	0.004	0.91	1.0	0.05	15.07	0.01	2.010	16.97	1.16	7.0	92.6	0.4	-2.42	0.81	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32822	4182	7	0	3	0	0	logfile
✘	7DWQ	30882	2022-12-18	2021-01-17	3.3	3.86	—	3.7	0.021	1.24	0.0	0.06	19.97	0.01	1.204	14.61	0.00	4.2	95.8	0.0	0.78	0.64	0.80	2.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19961	1943	18	0	100	0	0	logfile
✔	7oL0	12974	2022-12-18	2021-05-18	3.0	2.88	2.88	2.9	0.010	0.88	0.0	0.06	15.67	0.01	2.073	6.24	0.06	3.0	97.0	0.0	-1.45	0.73	0.84	3.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32892	3912	22	79	9	0	0	logfile
✘	7D5i	30582	2022-12-18	2020-09-26	2.79	2.96	—	3.0	0.005	0.71	0.0	0.04	13.37	0.00	1.220	6.64	0.00	8.3	91.7	0.0	-1.65	0.65	0.88	3.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6232	793	3	0	3	0	0	logfile
✘	7E0K	30935	2022-12-18	2021-01-28	3.09	2.58	—	3.1	0.011	1.60	0.0	0.08	17.75	0.02	1.210	8.32	0.00	7.2	92.8	0.0	-3.05	0.62	0.82	4.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8044	677	6	0	58	0	0	logfile
✘	7MJK	23876	2022-12-19	2021-04-20	2.73	3.61	—	2.9	0.004	0.77	0.0	0.05	12.93	0.01	2.307	3.00	0.00	3.0	97.0	0.0	-0.85	0.86	0.82	2.65	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34878	4389	30	0	60	0	0	logfile
✘	7M4V	23667	2022-12-19	2021-03-22	2.54	2.36	—	2.4	0.002	0.51	0.0	0.03	14.92	0.00	1.183	2.96	0.00	2.3	97.6	0.2	0.82	0.71	0.79	4.43	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	86404	3128	48	2847	162	802	0	logfile
✘	7EDA	31062	2022-12-18	2021-03-15	2.78	2.14	2.78	2.1	0.019	1.96	0.0	0.07	17.44	0.02	1.308	9.52	0.47	3.4	96.6	0.0	-4.11	0.67	0.76	4.32	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22843	2567	32	0	67	16	0	logfile
✔	7EWQ	31361	2022-12-21	2021-05-25	3.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	43232	5236	28	84	0	0	0	logfile
✘	7DXA	30902	2022-12-18	2021-01-18	3.14	2.79	—	3.0	0.020	2.37	2.0	0.14	20.59	0.03	1.222	13.10	10.97	5.8	94.1	0.2	-4.41	0.75	0.83	2.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15162	1629	23	0	50	0	0	logfile
✘	7DXH	30909	2022-12-18	2021-01-18	3.14	2.87	—	2.9	0.020	2.46	1.0	0.12	20.97	0.03	1.222	23.06	7.91	6.4	92.6	1.0	-4.83	0.71	0.81	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20054	2150	31	0	69	0	0	logfile
✔	6ZLG	11265	2022-12-18	2020-06-30	3.0	3.18	—	3.1	0.003	0.44	0.0	0.03	16.50	0.00	2.180	7.56	4.15	0.1	99.9	0.0	1.26	0.80	0.87	2.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	33008	4072	24	0	0	0	0	logfile
✔	7M2W	23635	2022-12-20	2021-03-17	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	39366	4827	16	0	4	0	0	logfile
✘	7DZ8	30926	2022-12-19	2021-01-23	3.16	3.25	—	3.2	0.011	1.68	1.0	0.07	20.65	0.02	1.209	8.52	0.19	5.7	94.3	0.0	-3.15	0.82	0.83	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	69460	5986	55	0	471	0	0	logfile
✔	7DPA	30802	2022-12-18	2020-12-18	3.8	4.83	3.79	3.0	0.006	0.84	0.0	0.05	15.30	0.01	2.038	22.35	0.00	12.3	87.7	0.0	-3.05	0.70	0.39	0.50	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32858	4034	6	0	0	0	0	logfile
✘	7N7P	24230	2022-12-18	2021-06-10	3.24	2.66	—	3.2	0.004	0.66	0.0	0.04	16.53	0.00	1.184	3.81	0.35	1.6	98.4	0.0	1.62	0.58	0.84	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5400	626	4	0	2	0	0	logfile
✘	7CUW	30475	2022-12-18	2020-08-25	2.63	2.93	—	2.8	0.010	0.93	0.0	0.05	15.56	0.02	1.241	3.73	5.84	3.8	96.0	0.3	-4.15	0.71	0.89	4.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9839	1199	6	0	9	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 443
• next →