Table showing results for April 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6VoC	21260	2022-04-19	2020-01-30	3.1	3.49	—	20.0	0.006	0.90	0.0	0.06	8.74	0.01	0.163	464.29	0.00	1.9	98.1	0.0	-1.94	0.19	0.06	0.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	214200	28560	180	0	0	0	0	logfile
✘	6KNG	0731	2022-04-04	2019-08-05	2.85	3.15	—	3.1	0.005	0.65	0.0	0.05	14.34	0.00	2.093	4.97	3.68	0.9	99.1	0.0	-2.31	0.83	0.91	4.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7749	1002	6	0	6	0	0	logfile
✔	7LNK	23460	2022-04-28	2021-02-07	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	243540	30600	60	0	0	0	0	logfile
✘	6XZG	10662	2022-04-05	2020-02-04	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6PW6	20500	2022-04-05	2019-07-22	4.5	4.56	4.36	4.5	0.021	1.78	0.0	0.11	10.80	0.01	2.200	1.61	0.56	2.7	97.2	0.2	0.50	0.74	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15942	1842	45	0	108	0	0	logfile
✘	7BoX	30135	2022-04-06	2020-03-20	3.8	3.29	—	3.8	0.012	1.46	5.0	0.07	12.93	0.01	2.236	9.50	0.05	8.1	91.5	0.5	-4.94	0.78	0.81	2.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18618	2334	12	0	0	0	0	logfile
✘	6XQN	22290	2022-04-04	2020-07-09	3.3	3.76	—	3.7	0.005	0.67	1.0	0.04	14.56	0.00	1.922	7.08	2.87	2.5	97.5	0.0	0.13	0.65	0.70	1.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9433	1290	10	0	1	0	0	logfile
✘	6YXR	10995	2022-04-05	2020-05-03	3.4	3.53	3.43	3.5	0.019	2.21	2.0	0.13	19.61	0.02	1.197	27.03	0.44	4.1	95.7	0.3	-3.53	0.67	0.76	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31910	2783	20	0	194	0	0	logfile
✘	7ND4	12275	2022-04-07	2021-01-30	3.6	3.31	—	3.2	0.003	0.58	3.0	0.05	11.05	0.00	2.233	3.79	0.28	4.1	95.6	0.2	-0.12	0.74	0.79	2.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29848	3729	30	0	71	0	0	logfile
✘	6SL5	10236	2022-04-09	2019-08-18	2.84	2.97	2.83	3.0	0.026	2.99	9.0	0.13	21.10	0.02	1.187	20.75	0.73	7.3	92.0	0.7	-3.12	0.71	0.77	2.42	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	43789	3744	36	0	292	0	0	logfile
✘	6VoY	21301	2022-04-06	2020-02-01	3.7	4.09	—	4.0	0.013	1.52	30.0	0.10	24.39	0.01	1.583	34.97	0.46	2.4	97.6	0.0	-6.32	0.69	0.82	2.12	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17556	1724	16	180	6	0	0	logfile
✘	6YMX	10847	2022-04-09	2020-04-10	3.17	3.73	3.27	3.6	0.010	1.11	0.0	0.06	15.99	0.01	1.201	6.90	0.39	6.1	93.9	0.1	-5.84	0.76	0.85	2.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	47034	5759	47	0	38	0	0	logfile
✘	7CFT	30347	2022-04-05	2020-06-28	3.9	4.07	—	4.0	0.009	0.98	0.0	0.06	15.17	0.01	2.276	6.04	1.75	7.4	92.6	0.0	-5.25	0.81	0.84	2.08	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11283	1425	9	0	6	0	0	logfile
✘	6L53	0836	2022-04-05	2019-10-22	3.63	3.79	—	3.7	0.002	0.67	0.0	0.04	9.71	0.00	2.193	8.74	3.49	9.8	89.9	0.3	-4.90	0.77	0.70	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13991	1935	1	0	0	0	0	logfile
✘	6T0N	10356	2022-04-05	2019-10-03	2.54	2.64	2.56	2.6	0.005	0.69	0.0	0.05	14.69	0.01	2.105	3.18	4.90	4.3	95.4	0.2	-2.43	0.73	0.89	4.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14598	1703	12	29	2	268	0	logfile
✘	6Z2Y	11052	2022-04-05	2020-05-18	3.34	3.06	—	3.2	0.004	0.58	0.0	0.04	17.64	0.00	2.271	3.84	0.69	3.9	96.1	0.0	-2.11	0.66	0.77	2.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14998	1664	14	80	4	0	0	logfile
✘	7AML	11822	2022-04-08	2020-10-09	3.5	3.67	3.38	3.6	0.005	0.82	1.0	0.06	13.09	0.00	1.789	11.29	0.84	5.8	94.2	0.0	-3.64	0.67	0.58	0.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31304	1996	10	0	24	0	15286	logfile
✘	6YV1	10940	2022-04-04	2020-04-27	3.4	4.09	3.01	3.7	0.002	0.58	0.0	0.04	12.66	0.00	2.272	8.02	1.85	1.0	99.0	0.0	-4.45	0.52	0.76	1.48	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	2496	328	1	0	0	0	0	logfile
✘	6XZD	10659	2022-04-05	2020-02-04	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZR	10666	2022-04-05	2020-02-05	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile

• ← previous
• Page 3 of 366
• next →