Table showing results for May 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7R88	24311	2022-05-13	2021-06-26	3.5	3.76	—	3.7	0.002	0.45	0.0	0.04	12.49	0.00	2.274	5.35	1.02	3.5	96.5	0.0	-1.50	0.69	0.85	2.38	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10787	1368	4	0	0	0	0	logfile
✘	7E0H	30932	2022-05-12	2021-01-28	3.75	3.80	—	3.7	0.006	1.45	0.0	0.06	18.08	0.02	1.210	11.25	0.00	9.0	91.0	0.0	-3.64	0.68	0.76	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8017	661	6	0	57	0	0	logfile
✘	7MKL	23898	2022-05-15	2021-04-24	3.2	2.50	—	2.1	0.004	0.82	0.0	0.06	12.45	0.01	2.162	10.30	0.00	2.9	97.1	0.0	0.35	0.64	0.58	0.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25597	3164	23	0	63	0	0	logfile
✘	7LMB	23439	2022-05-14	2021-02-05	3.8	3.98	—	3.9	0.004	0.63	0.0	0.04	17.20	0.00	2.160	11.78	0.06	6.7	93.3	0.0	-3.71	0.77	0.75	1.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18498	1837	9	162	1	0	0	logfile
✘	7M4V	23667	2022-05-16	2021-03-22	2.54	2.36	—	2.4	0.002	0.51	0.0	0.03	14.92	0.00	1.183	2.96	0.00	2.3	97.6	0.2	0.82	0.71	0.79	4.43	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	86404	3128	48	2847	162	802	0	logfile
✔	7BiN	12192	2022-05-16	2021-01-12	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	81721	10887	56	0	0	0	0	logfile
✘	7EFC	31083	2022-05-14	2021-03-21	1.7	1.76	1.83	1.9	0.032	3.16	80.0	0.09	15.03	0.02	0.000	3.39	2.15	2.5	96.6	0.8	-0.84	0.73	0.80	6.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20020	2400	20	0	20	780	0	logfile
✘	7DXH	30909	2022-05-14	2021-01-18	3.14	2.87	—	2.9	0.020	2.46	1.0	0.12	20.97	0.03	1.222	23.06	7.91	6.4	92.6	1.0	-4.83	0.71	0.81	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20054	2150	31	0	69	0	0	logfile
✘	6W6J	21557	2022-05-16	2020-03-17	3.2	3.50	—	3.4	0.007	0.89	0.0	0.05	15.32	0.01	1.459	11.30	0.82	12.4	87.5	0.2	-4.72	0.82	0.84	1.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29240	3725	13	0	38	0	0	logfile
✘	7ALN	11818	2022-05-14	2020-10-06	3.77	3.85	—	3.8	0.009	0.95	0.0	0.06	10.60	0.01	1.198	10.50	0.22	4.1	95.8	0.0	-3.95	0.60	0.82	2.71	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20789	2616	11	0	13	0	0	logfile
✘	7DXA	30902	2022-05-13	2021-01-18	3.14	2.79	—	3.0	0.020	2.37	2.0	0.14	20.59	0.03	1.222	13.10	10.97	5.8	94.1	0.2	-4.41	0.75	0.83	2.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15162	1629	23	0	50	0	0	logfile
✘	7D5i	30582	2022-05-12	2020-09-26	2.79	2.96	—	3.0	0.005	0.71	0.0	0.04	13.37	0.00	1.220	6.64	0.00	8.3	91.7	0.0	-1.65	0.65	0.88	3.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6232	793	3	0	3	0	0	logfile
✘	7S9Z	24942	2022-05-12	2021-09-21	4.14	4.38	—	4.3	0.006	0.81	1.0	0.04	13.12	0.00	1.246	10.18	0.00	10.6	89.4	0.0	-2.53	0.66	0.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7274	890	1	0	2	0	0	logfile
✘	7V83	31788	2022-05-17	2021-08-22	2.8	3.28	—	3.2	0.005	0.58	0.0	0.04	14.22	0.00	2.147	10.13	0.00	5.7	94.3	0.0	-0.33	0.76	0.79	1.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	40162	4902	40	0	89	0	0	logfile
✘	7o3Y	12712	2022-05-25	2021-04-03	3.8	5.36	4.02	6.6	0.017	1.23	0.0	0.07	17.45	0.01	1.232	13.83	1.39	2.3	97.7	0.0	2.03	0.56	0.43	-1.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	158288	20576	112	0	16	0	0	logfile
✘	7ASL	11897	2022-05-16	2020-10-27	4.5	5.02	—	5.1	0.015	1.83	90.0	0.15	16.07	0.01	2.081	24.02	1.04	3.0	97.0	0.0	-4.02	0.46	0.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32490	4230	18	0	0	0	0	logfile
✘	7E0i	30933	2022-05-12	2021-01-28	3.53	3.56	—	3.5	0.007	1.46	0.0	0.06	17.87	0.02	1.214	10.82	0.78	7.3	92.7	0.0	-4.03	0.57	0.73	2.10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8033	677	6	0	58	0	0	logfile
✘	7ETW	31303	2022-05-12	2021-05-14	4.1	4.06	—	4.0	0.056	1.80	1.0	1.42	14.44	0.01	1.843	16.29	1.36	11.6	86.4	1.9	-5.46	0.53	0.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4952	680	4	0	6	0	0	logfile
✘	7RX4	24724	2022-05-13	2021-08-21	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14012	1798	62	0	0	0	0	logfile
✘	7RX5	24725	2022-05-13	2021-08-21	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9348	1189	41	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 4 of 376
• next →