Table showing results for July 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7E32	30974	2022-07-03	2021-02-07	2.9	3.21	—	3.1	0.003	0.45	0.0	0.04	12.53	0.00	1.363	6.09	0.10	2.1	97.9	0.0	2.17	0.62	0.74	2.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8797	1117	5	0	2	0	0	logfile
✘	7LMB	23439	2022-07-04	2021-02-05	3.8	3.98	—	3.9	0.004	0.63	0.0	0.04	17.20	0.00	2.160	11.78	0.06	6.7	93.3	0.0	-3.71	0.77	0.75	1.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18498	1837	9	162	1	0	0	logfile
✘	6XLK	22246	2022-07-03	2020-06-28	3.3	3.63	—	3.5	0.008	0.72	0.0	0.05	20.19	0.00	1.395	5.81	0.41	0.9	99.1	0.0	-2.26	0.78	0.84	2.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5456	536	6	46	4	0	0	logfile
✘	6WHG	21672	2022-07-04	2020-04-08	3.1	2.89	3.05	3.1	0.009	1.12	0.0	0.07	16.14	0.01	1.174	2.65	1.98	3.1	96.9	0.0	-1.32	0.66	0.80	3.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17116	2092	8	0	12	0	0	logfile
✔	7oJ8	12939	2022-07-03	2021-05-14	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9148	1150	4	0	7	0	0	logfile
✘	7ALN	11818	2022-07-04	2020-10-06	3.77	3.85	—	3.8	0.009	0.95	0.0	0.06	10.60	0.01	1.198	10.50	0.22	4.1	95.8	0.0	-3.95	0.60	0.82	2.71	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20789	2616	11	0	13	0	0	logfile
✘	6XLM	22248	2022-07-05	2020-06-28	3.2	3.76	—	3.5	0.008	0.79	0.0	0.05	14.95	0.00	1.395	9.49	0.07	0.7	99.3	0.0	-2.52	0.82	0.84	2.16	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	28244	3485	11	40	5	0	0	logfile
✘	6XL5	22234	2022-07-07	2020-06-28	2.5	3.07	—	3.0	0.010	0.93	0.0	0.06	16.91	0.01	1.394	7.64	0.00	0.8	99.2	0.0	-2.54	0.74	0.86	3.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35828	4220	20	108	10	42	0	logfile
✘	7DX4	30895	2022-07-03	2021-01-18	3.6	3.96	—	3.8	0.007	0.99	0.0	0.06	10.06	0.01	0.766	7.28	0.23	6.0	93.7	0.3	-4.20	0.71	0.79	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8234	1027	6	0	5	0	0	logfile
✘	7EB2	31049	2022-07-04	2021-03-08	3.5	3.43	—	3.4	0.007	0.74	0.0	0.05	11.69	0.00	1.256	7.85	0.00	3.6	96.4	0.0	-1.24	0.79	0.74	1.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18497	2337	8	0	2	0	0	logfile
✘	7KRo	23008	2022-07-05	2020-11-20	3.6	4.10	—	4.0	0.008	0.73	0.0	0.05	14.56	0.00	1.225	9.00	9.40	6.9	92.8	0.3	-1.73	0.79	0.81	1.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21988	2553	11	80	19	0	0	logfile
✘	7KRN	23007	2022-07-04	2020-11-20	3.4	3.94	—	3.9	0.007	0.71	0.0	0.05	13.82	0.00	1.225	9.15	7.54	8.6	91.4	0.0	-2.51	0.77	0.82	2.51	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17351	1963	9	80	13	0	0	logfile
✘	7KRP	23009	2022-07-03	2020-11-20	3.2	3.57	—	3.6	0.004	0.59	0.0	0.04	12.31	0.00	1.226	6.16	4.18	2.9	97.1	0.0	-1.51	0.65	0.64	0.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12561	1373	8	73	7	0	0	logfile
✘	7S9Y	24941	2022-07-03	2021-09-21	3.56	3.89	—	3.9	0.007	0.93	0.0	0.05	13.74	0.01	1.241	10.16	0.00	8.2	91.8	0.0	-1.32	0.69	0.82	3.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7395	901	1	0	3	0	0	logfile
✘	7P06	13145	2022-07-05	2021-06-29	3.77	4.42	—	4.0	0.005	0.71	0.0	0.04	13.79	0.01	1.299	9.20	0.00	5.5	94.5	0.0	-0.50	0.71	0.77	2.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21476	1350	1	0	3	0	10638	logfile
✔	7BiN	12192	2022-07-05	2021-01-12	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	81721	10887	56	0	0	0	0	logfile
✘	7DJT	30700	2022-07-07	2020-11-21	2.8	3.74	—	3.7	0.006	0.90	8.0	0.05	15.09	0.01	1.220	5.26	0.00	3.5	96.5	0.0	-4.23	0.78	0.82	1.21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	40136	5112	16	0	24	0	0	logfile
✘	7BL2	12215	2022-07-06	2021-01-18	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6WQH	21870	2022-07-05	2020-04-28	3.6	4.01	—	3.9	0.013	0.93	2.0	0.05	15.19	0.01	1.208	22.42	0.56	8.0	91.9	0.2	-4.12	0.75	0.83	1.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25471	3223	13	0	22	0	0	logfile
✘	7N33	24137	2022-07-04	2021-05-31	2.5	2.72	—	2.6	0.005	0.56	0.0	0.05	13.04	0.00	1.217	4.10	2.93	2.6	97.4	0.0	0.50	0.82	0.87	5.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16524	2076	12	12	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 4 of 392
• next →