Table showing results for April 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6UD3	20731	2022-04-05	2019-09-18	3.5	4.06	3.46	3.8	0.014	1.59	0.0	0.10	11.86	0.01	2.293	7.45	0.00	4.6	95.4	0.0	-1.90	0.79	0.78	1.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14346	1765	10	0	6	0	0	logfile
✘	6LHU	0899	2022-04-06	2019-12-10	3.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23169	1518	2	0	0	0	11483	logfile
✘	6VM3	21237	2022-04-05	2020-01-27	3.07	3.76	3.02	3.5	0.025	2.33	0.0	0.12	15.81	0.03	2.282	5.90	0.92	3.1	96.9	0.0	1.08	0.80	0.86	3.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15180	1810	15	0	15	0	0	logfile
✘	6USF	20863	2022-04-07	2019-10-26	3.87	4.09	—	3.9	0.013	1.53	1.0	0.11	15.58	0.01	2.004	10.45	0.08	7.0	93.0	0.0	-4.48	0.81	0.80	1.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23022	2868	17	0	13	0	0	logfile
✘	6VL5	21230	2022-04-05	2020-01-22	4.5	4.57	4.20	4.4	0.018	1.68	0.0	0.10	10.25	0.01	2.242	0.64	0.20	1.2	98.8	0.0	0.88	0.79	0.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15039	1719	42	0	105	0	0	logfile
✘	6Z2K	11042	2022-04-08	2020-05-16	4.5	4.70	4.41	4.5	0.006	0.97	0.0	0.08	14.93	0.01	1.425	5.20	0.15	9.0	90.8	0.2	-3.76	0.80	0.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	37843	2379	19	0	16	0	18577	logfile
✘	6PSV	20465	2022-04-08	2019-07-13	3.5	3.19	—	3.3	0.022	1.02	0.0	0.07	19.94	0.01	1.959	40.32	11.23	11.1	88.7	0.1	-4.43	0.67	0.79	1.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32331	3830	14	105	8	0	0	logfile
✘	6VY2	21456	2022-04-06	2020-02-25	4.86	6.05	—	5.2	0.006	0.91	0.0	0.07	14.28	0.00	2.056	18.18	4.96	5.7	93.8	0.5	-2.41	0.82	0.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21426	2442	66	0	180	0	0	logfile
✘	6U9H	20700	2022-04-09	2019-09-08	3.8	4.00	—	3.9	0.011	1.26	0.0	0.07	15.99	0.01	2.034	16.92	0.16	10.2	89.8	0.0	-4.80	0.83	0.77	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	46356	5952	24	0	24	0	0	logfile
✘	6L53	0836	2022-04-05	2019-10-22	3.63	3.79	—	3.7	0.002	0.67	0.0	0.04	9.71	0.00	2.193	8.74	3.49	9.8	89.9	0.3	-4.90	0.77	0.70	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13991	1935	1	0	0	0	0	logfile
✘	6ZMo	11299	2022-04-25	2020-07-03	3.1	3.04	—	2.8	0.009	1.04	0.0	0.06	16.54	0.01	1.993	4.70	0.82	8.2	91.5	0.3	-3.58	0.86	0.84	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	230351	12939	107	5951	264	0	0	logfile
✘	6LHS	0896	2022-04-06	2019-12-10	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22737	1456	2	0	0	0	11313	logfile
✘	6VoY	21301	2022-04-06	2020-02-01	3.7	4.09	—	4.0	0.013	1.52	30.0	0.10	24.39	0.01	1.583	34.97	0.46	2.4	97.6	0.0	-6.32	0.69	0.82	2.12	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17556	1724	16	180	6	0	0	logfile
✘	6UZV	20963	2022-04-07	2019-11-15	3.1	3.13	—	3.2	0.010	1.06	0.0	0.06	20.29	0.04	1.217	11.43	0.89	4.2	95.8	0.0	-1.85	0.71	0.84	3.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	72606	6711	60	0	408	0	0	logfile
✘	7BoX	30135	2022-04-06	2020-03-20	3.8	3.29	—	3.8	0.012	1.46	5.0	0.07	12.93	0.01	2.236	9.50	0.05	8.1	91.5	0.5	-4.94	0.78	0.81	2.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18618	2334	12	0	0	0	0	logfile
✘	6SL5	10236	2022-04-09	2019-08-18	2.84	2.97	2.83	3.0	0.026	2.99	9.0	0.13	21.10	0.02	1.187	20.75	0.73	7.3	92.0	0.7	-3.12	0.71	0.77	2.42	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	43789	3744	36	0	292	0	0	logfile
✘	6XQN	22290	2022-04-04	2020-07-09	3.3	3.76	—	3.7	0.005	0.67	1.0	0.04	14.56	0.00	1.922	7.08	2.87	2.5	97.5	0.0	0.13	0.65	0.70	1.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9433	1290	10	0	1	0	0	logfile
✘	6PW6	20500	2022-04-05	2019-07-22	4.5	4.56	4.36	4.5	0.021	1.78	0.0	0.11	10.80	0.01	2.200	1.61	0.56	2.7	97.2	0.2	0.50	0.74	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15942	1842	45	0	108	0	0	logfile
✘	6TRA	10557	2022-04-07	2019-12-18	2.85	3.02	—	3.0	0.006	0.84	0.0	0.04	18.74	0.02	1.225	8.48	0.05	4.7	95.3	0.0	-3.41	0.73	0.83	4.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25197	2283	33	0	134	217	0	logfile
✘	7CKY	30394	2022-04-05	2020-07-20	3.2	3.28	—	3.3	0.003	0.48	0.0	0.04	14.59	0.00	2.154	17.05	1.51	4.3	95.7	0.0	-2.84	0.46	0.50	0.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8128	1038	5	0	2	0	0	logfile

• ← previous
• Page 4 of 366
• next →