Table showing results for July 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7TFS	25879	2022-07-03	2022-01-07	4.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13008	1616	8	0	32	0	0	logfile
✘	7V6A	31740	2022-07-03	2021-08-20	3.6	2.46	—	2.1	0.003	0.69	0.0	0.04	13.77	0.00	1.212	14.28	0.00	4.4	95.6	0.0	-1.88	0.71	0.70	2.85	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8584	1122	5	0	1	0	0	logfile
✘	7WLD	32582	2022-07-04	2022-01-13	2.53	2.67	—	2.7	0.005	0.84	0.0	0.05	14.34	0.01	1.169	10.11	1.87	2.2	97.7	0.1	0.47	0.62	0.84	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19732	2393	11	0	29	0	0	logfile
✘	7oMM	12990	2022-07-04	2021-05-24	3.4	3.83	—	20.0	0.010	1.47	6.0	0.10	18.84	0.01	1.819	11.39	16.45	9.4	90.1	0.5	-2.70	0.09	0.01	0.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13981	1794	4	0	0	0	0	logfile
✘	7U2L	26314	2022-07-03	2022-02-24	3.2	3.55	—	3.5	0.004	0.57	0.0	0.04	13.97	0.00	1.204	8.27	0.00	4.0	96.0	0.0	-0.29	0.68	0.82	3.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8739	1122	6	0	1	0	0	logfile
✘	7T6M	25719	2022-07-04	2021-12-14	2.8	3.05	—	3.1	0.006	1.06	0.0	0.07	14.52	0.01	1.184	3.41	0.00	1.7	98.3	0.0	-2.68	0.71	0.84	3.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19600	2424	8	0	4	0	0	logfile
✘	7WZ0	32900	2022-07-05	2022-02-16	3.0	2.95	—	3.1	0.011	1.46	0.0	0.07	18.87	0.01	1.217	12.17	10.61	8.7	90.5	0.8	-3.72	0.73	0.82	2.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22688	2654	22	0	78	10	0	logfile
✘	7W01	32233	2022-07-03	2021-11-17	3.3	3.43	—	3.4	0.011	1.10	1.0	0.06	16.08	0.01	1.717	10.01	0.60	13.3	85.9	0.8	-4.55	0.68	0.86	2.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12724	1598	1	0	7	0	0	logfile
✘	7WLK	32586	2022-07-03	2022-01-13	3.6	3.50	—	3.6	0.010	0.97	0.0	0.06	14.57	0.00	1.179	14.07	0.10	6.7	93.3	0.0	0.27	0.72	0.79	1.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9461	1135	1	0	17	0	0	logfile
✘	7XJi	33228	2022-07-03	2022-04-18	3.9	3.60	3.70	3.9	0.003	0.60	0.0	0.04	13.72	0.00	1.224	9.09	0.00	4.3	95.7	0.0	-0.25	0.61	0.78	2.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7851	1027	6	0	1	0	0	logfile
✘	7WU4	32819	2022-07-03	2022-02-05	3.4	3.44	—	3.8	0.002	0.48	0.0	0.04	14.07	0.00	1.185	8.62	0.00	2.5	97.5	0.0	0.46	0.58	0.71	2.09	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6887	888	4	0	2	0	0	logfile
✘	7TXJ	26159	2022-07-06	2022-02-09	3.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	101029	10912	124	744	0	0	0	logfile
✘	7S1Y	24812	2022-07-03	2021-09-02	3.6	3.90	—	3.9	0.004	0.73	2.0	0.04	12.64	0.01	1.236	12.97	0.00	7.2	92.6	0.2	-0.33	0.40	0.55	0.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6580	948	4	0	6	0	0	logfile
✘	7T6Q	25724	2022-07-04	2021-12-14	3.4	3.68	—	3.7	0.006	1.29	2.0	0.06	15.07	0.01	1.184	5.16	0.00	3.9	96.1	0.0	-3.87	0.68	0.77	2.18	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19600	2424	8	0	4	0	0	logfile
✘	7WU3	32818	2022-07-03	2022-02-05	3.1	3.13	—	3.1	0.003	0.52	0.0	0.04	13.74	0.00	1.185	7.73	0.00	2.4	97.6	0.0	1.63	0.70	0.80	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7877	1013	5	0	1	0	0	logfile
✘	7WYX	32897	2022-07-05	2022-02-16	3.4	3.47	—	3.5	0.011	1.30	0.0	0.06	18.77	0.01	1.229	10.48	10.43	8.4	90.9	0.7	-3.31	0.74	0.80	1.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22714	2654	22	0	78	6	0	logfile
✘	7WYY	32898	2022-07-05	2022-02-16	3.9	3.73	—	3.9	0.011	1.42	0.0	0.07	18.87	0.01	1.228	11.53	10.61	8.7	90.7	0.6	-3.53	0.71	0.77	1.08	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22656	2654	22	0	78	8	0	logfile
✘	7WYZ	32899	2022-07-05	2022-02-16	3.4	3.29	—	3.5	0.010	1.23	0.0	0.06	18.69	0.01	1.216	9.43	10.39	7.9	91.7	0.5	-3.16	0.73	0.81	1.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22682	2654	22	0	78	4	0	logfile
✘	7QHo	13977	2022-07-06	2021-12-13	3.1	3.03	—	3.1	0.007	0.88	0.0	0.05	14.39	0.01	1.195	2.64	0.29	3.5	96.5	0.0	-0.18	0.56	0.76	3.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	93446	5870	54	0	78	10	44952	logfile
✘	7WLL	32587	2022-07-03	2022-01-13	3.6	3.89	—	3.8	0.012	1.18	2.0	0.08	14.85	0.00	1.204	13.97	0.50	7.3	92.6	0.1	-0.42	0.60	0.81	1.99	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9540	1135	1	0	21	0	0	logfile

• Page 1 of 392
• next →