Table showing results for March 2023

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6S5T	10100	2023-03-12	2019-07-02	4.15	4.28	4.17	4.2	0.007	1.48	3.0	0.09	17.31	0.00	2.450	5.08	3.93	7.1	92.4	0.6	-4.05	0.75	0.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6958	896	3	0	1	0	0	logfile
✘	7Ji3	22343	2023-03-12	2020-07-22	3.46	4.28	—	4.0	0.005	0.79	0.0	0.05	13.46	0.01	2.365	6.77	0.00	3.6	96.4	0.0	-5.13	0.64	0.72	2.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6000	777	3	0	0	0	0	logfile
✘	7Z12	14438	2023-03-16	2022-02-24	3.0	3.83	—	3.4	0.007	1.03	1.0	0.06	15.28	0.01	0.865	31.24	1.37	15.0	83.9	1.1	-3.04	0.84	0.81	1.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18352	2286	3	0	0	0	0	logfile
✘	7VFF	31951	2023-03-14	2021-09-13	4.1	3.76	3.90	4.0	0.007	0.72	0.0	0.05	13.87	0.00	2.334	2.40	0.41	3.6	96.4	0.0	-0.82	0.79	0.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12579	1581	3	0	0	0	0	logfile
✘	6X2L	22011	2023-03-13	2020-05-20	2.85	2.95	—	2.9	0.009	0.96	0.0	0.06	13.68	0.01	2.078	2.99	0.00	2.5	97.5	0.0	-6.46	0.64	0.88	2.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9396	1233	3	0	0	0	0	logfile
✘	7JGH	22327	2023-03-17	2020-07-19	3.36	3.67	—	3.6	0.007	0.83	1.0	0.08	11.51	0.00	2.092	7.77	0.39	5.3	94.7	0.0	-0.15	0.55	0.63	1.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19608	1421	3	0	12	0	7725	logfile
✘	8A01	15044	2023-03-12	2022-05-26	3.2	3.25	3.20	3.2	0.002	0.44	0.0	0.05	14.81	0.00	2.289	4.13	0.00	2.0	98.0	0.0	0.02	0.48	0.86	2.87	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5511	717	3	0	0	0	0	logfile
✘	6XWR	10636	2023-03-13	2020-01-24	3.22	3.96	—	3.7	0.008	0.75	0.0	0.05	12.81	0.00	2.122	11.13	0.00	5.7	94.3	0.0	-2.71	0.74	0.85	2.44	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9564	1278	3	0	0	0	0	logfile
✘	6oUA	20200	2023-03-12	2019-05-04	4.18	4.32	—	4.3	0.008	1.37	1.0	0.07	13.97	0.01	2.294	7.03	2.35	17.4	82.3	0.3	-5.89	0.72	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5208	637	3	0	0	0	0	logfile
✘	7UL4	26591	2023-03-11	2022-04-03	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	2524	351	3	0	1	4	0	logfile
✘	7WSF	32756	2023-03-15	2022-01-29	2.87	3.08	—	3.1	0.003	0.44	0.0	0.04	11.23	0.00	2.016	6.14	3.87	2.7	97.3	0.0	-0.12	0.72	0.81	4.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7170	879	3	0	1	0	0	logfile
✘	8DLY	27520	2023-03-11	2022-07-08	3.0	3.63	2.92	3.6	0.005	0.94	0.0	0.06	12.37	0.01	2.317	1.86	0.37	3.5	96.5	0.0	-1.46	0.63	0.81	3.36	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	2483	314	3	0	1	0	0	logfile
✘	6XS6	22301	2023-03-16	2020-07-15	3.7	2.21	—	2.2	0.004	0.83	0.0	0.05	14.26	0.01	2.240	4.49	0.00	6.1	93.9	0.0	-1.99	0.57	0.59	2.30	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18294	2357	3	0	0	0	0	logfile
✘	7D5i	30582	2023-03-12	2020-09-26	2.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6232	793	3	0	3	0	0	logfile
✘	7P14	13155	2023-03-12	2021-07-01	3.66	3.82	3.50	3.8	0.004	0.64	0.0	0.04	16.56	0.00	2.295	7.45	0.00	2.7	97.3	0.0	1.11	0.60	0.78	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3796	454	3	0	3	0	0	logfile
✘	7SWP	25478	2023-03-12	2021-11-20	3.8	3.74	—	4.0	0.008	0.92	0.0	0.05	12.87	0.01	2.202	40.14	0.00	12.1	87.9	0.0	-2.17	0.51	0.71	1.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3372	436	3	0	0	0	0	logfile
✘	6PCV	20308	2023-03-13	2019-06-18	3.2	2.93	3.33	3.3	0.006	0.98	0.0	0.06	14.31	0.01	2.235	6.90	0.71	4.0	96.0	0.0	-3.37	0.71	0.72	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9035	1155	3	0	0	0	0	logfile
✘	7WAH	32385	2023-03-14	2021-12-14	2.45	2.65	—	2.8	0.002	0.51	0.0	0.04	11.56	0.00	2.239	7.07	0.55	1.7	98.3	0.0	0.28	0.64	0.80	3.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13217	1473	3	62	4	0	0	logfile
✘	6PYH	20524	2023-03-14	2019-07-29	4.3	4.52	—	4.3	0.016	1.05	0.0	0.05	14.64	0.01	2.079	28.75	0.55	18.2	81.6	0.2	-5.21	0.84	0.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13187	1648	3	0	0	0	0	logfile
✘	6o1U	0605	2023-03-17	2019-02-21	2.8	3.27	—	3.2	0.010	1.08	4.0	0.06	14.75	0.01	2.180	5.37	2.65	4.6	95.4	0.0	-5.22	0.69	0.83	2.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19612	2456	4	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 29
• next →