Table showing results for January 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	9E9F	47796	2025-01-25	2024-11-08	3.63	4.13	3.91	3.9	0.003	0.58	0.0	0.04	11.62	0.00	2.196	15.43	2.83	3.5	96.4	0.0	0.89	0.70	0.74	1.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23048	3035	3	0	0	0	0	logfile
✘	9DWE	47241	2025-01-21	2024-10-09	2.8	3.10	2.94	3.1	0.005	0.76	0.0	0.05	14.21	0.01	1.485	3.75	0.00	2.8	97.2	0.0	-0.83	0.72	0.87	4.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17400	2187	15	0	21	0	3	logfile
✘	9JUB	61826	2025-01-14	2024-10-07	3.1	3.29	3.10	3.4	0.007	0.79	1.0	0.06	11.95	0.01	1.934	17.05	0.56	7.6	92.3	0.1	-1.75	0.55	0.67	3.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6479	829	5	0	5	0	0	logfile
✘	9GUP	51615	2025-01-15	2024-09-20	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	53689	2594	24	1556	86	0	0	logfile
✘	9GUS	51618	2025-01-16	2024-09-20	3.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	55373	2597	26	1634	125	0	0	logfile
✘	9GUQ	51616	2025-01-16	2024-09-20	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	55411	2595	26	1636	128	0	0	logfile
✘	9GUU	51620	2025-01-16	2024-09-20	2.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	55336	2596	25	1633	120	0	0	logfile
✘	9GUT	51619	2025-01-17	2024-09-20	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	58183	2939	27	1633	137	0	0	logfile
✘	9GUV	51621	2025-01-16	2024-09-20	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	55998	2774	26	1633	86	0	0	logfile
✘	9GUW	51622	2025-01-26	2024-09-20	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	80600	5870	35	1608	121	0	0	logfile
✘	9GGQ	51339	2025-01-26	2024-08-13	2.6	3.32	2.71	3.0	0.003	0.50	0.0	0.04	14.80	0.00	1.848	3.87	0.37	3.4	96.6	0.0	0.28	0.80	0.87	3.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24628	2905	16	84	6	8	0	logfile
✘	9CX6	45979	2025-01-14	2024-07-30	3.2	3.35	3.13	3.5	0.009	1.46	0.0	0.07	12.63	0.01	0.182	28.34	0.00	5.0	95.0	0.0	-4.11	0.47	0.62	4.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	49250	7200	200	0	0	250	0	logfile
✘	9CUJ	45935	2025-01-24	2024-07-26	2.78	2.95	2.81	3.0	0.011	1.39	0.0	0.05	17.60	0.01	2.291	5.23	1.51	4.3	95.7	0.0	-5.66	0.60	0.82	4.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21557	2440	12	0	65	72	0	logfile
✘	9CTS	45917	2025-01-20	2024-07-25	2.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15623	1880	10	0	9	0	0	logfile
✘	9CTR	45916	2025-01-20	2024-07-25	2.42	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15623	1880	10	0	9	0	0	logfile
✘	9CTQ	45915	2025-01-20	2024-07-25	2.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15630	1880	10	0	10	0	0	logfile
✘	9CJ7	45624	2025-01-17	2024-07-05	3.0	3.67	3.21	3.4	0.006	0.95	0.0	0.06	16.20	0.01	2.107	2.90	0.00	4.2	95.8	0.0	-0.13	0.85	0.86	4.17	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11501	1300	38	0	89	0	0	logfile
✘	9CEU	45519	2025-01-19	2024-06-27	3.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13398	607	5	108	1	0	6141	logfile
✘	9CER	45516	2025-01-19	2024-06-27	4.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14598	612	2	142	0	0	6561	logfile
✘	9CEZ	45524	2025-01-19	2024-06-27	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13540	600	6	115	3	3	6178	logfile

• Page 1 of 39
• next →