Table showing results for January 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	8HTT	35017	2025-01-13	2022-12-21	3.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3292	389	5	0	8	0	0	logfile
✘	8C21	16387	2025-01-18	2022-12-21	3.6	4.19	3.27	3.8	0.003	0.58	0.0	0.04	14.61	0.00	2.223	10.61	0.07	5.2	94.4	0.4	0.00	0.65	0.67	2.10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11954	1441	6	0	2	0	0	logfile
✘	8C1Q	16380	2025-01-22	2022-12-21	2.82	2.61	2.76	2.8	0.010	1.40	1.0	0.08	16.04	0.01	2.171	4.38	2.54	2.7	97.3	0.0	-0.72	0.64	0.82	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18462	2315	23	0	18	25	0	logfile
✘	8C07	16356	2025-01-14	2022-12-16	3.3	2.75	3.20	2.2	0.004	0.94	0.0	0.05	16.63	0.01	2.288	4.36	0.38	8.1	91.9	0.0	-3.00	0.77	0.72	1.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4974	644	5	0	1	0	0	logfile
✘	8HRC	34967	2025-01-24	2022-12-15	2.58	2.69	2.60	2.6	0.002	0.48	0.0	0.04	13.75	0.00	2.237	8.80	0.01	1.9	98.1	0.0	1.74	0.79	0.84	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	74964	9312	12	0	0	0	0	logfile
✘	8HQS	34953	2025-01-24	2022-12-14	3.2	3.55	3.31	3.4	0.003	0.57	0.0	0.04	11.43	0.00	2.203	11.20	0.60	5.2	94.8	0.0	0.73	0.63	0.59	1.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19224	2387	7	0	0	0	0	logfile
✘	8BWP	16293	2025-01-16	2022-12-07	3.6	3.85	3.55	3.8	0.011	0.90	1.0	0.06	12.54	0.01	2.213	4.13	0.48	2.9	97.1	0.0	-1.51	0.68	0.83	2.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9578	1195	2	0	1	0	0	logfile
✘	8HMZ	34905	2025-01-18	2022-12-06	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11542	1367	9	82	6	0	0	logfile
✘	8BVS	16270	2025-01-14	2022-12-05	3.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4799	617	4	1	1	0	0	logfile
✘	8FD7	29004	2025-01-23	2022-12-02	3.1	3.01	—	3.2	0.005	0.58	0.0	0.11	12.34	0.00	2.223	7.54	2.76	6.1	93.7	0.1	-0.41	0.72	0.76	2.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19701	2416	6	0	20	3	0	logfile
✘	8HKX	34862	2025-01-18	2022-11-28	3.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-2.91	—	—	1.03	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-2.84	—	—	—	0.78	59656	3419	28	1491	57	0	0	logfile
✘	8HK7	34848	2025-01-20	2022-11-25	3.0	3.70	3.51	3.9	0.009	0.75	0.0	0.04	16.92	0.00	1.579	11.81	0.53	8.6	91.2	0.2	-0.87	0.43	0.39	0.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15765	1872	8	0	17	0	0	logfile
✘	8F7Q	28907	2025-01-18	2022-11-20	3.22	3.34	3.24	3.4	0.004	0.87	0.0	0.07	8.26	0.01	2.262	3.31	0.00	1.4	98.6	0.0	0.89	0.64	0.78	2.57	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11994	1484	11	0	10	0	0	logfile
✘	8F7W	28911	2025-01-16	2022-11-20	3.19	3.44	3.14	3.4	0.004	0.80	0.0	0.06	8.29	0.01	2.282	3.96	0.10	1.9	98.1	0.0	-1.80	0.58	0.75	1.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9087	1145	7	0	5	0	0	logfile
✘	8F7E	28904	2025-01-14	2022-11-18	4.13	4.21	4.35	4.1	0.005	0.98	0.0	0.05	15.17	0.01	2.266	14.09	0.53	7.4	92.6	0.0	-3.38	0.55	0.57	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6642	814	2	0	0	0	0	logfile
✘	8F7B	28901	2025-01-21	2022-11-18	3.15	3.53	3.17	3.5	0.005	0.79	0.0	0.04	18.68	0.00	2.263	5.78	0.23	2.4	97.6	0.0	1.06	0.63	0.79	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16166	1894	18	0	17	6	0	logfile
✘	8F6R	28889	2025-01-17	2022-11-17	4.0	4.17	3.97	4.1	0.005	0.75	0.0	0.04	12.99	0.00	1.997	17.80	0.00	1.4	98.6	0.0	-1.46	0.77	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10290	1314	6	0	0	0	0	logfile
✘	8F6J	28885	2025-01-17	2022-11-16	3.7	3.93	3.62	3.9	0.003	0.51	0.0	0.04	14.39	0.01	2.084	6.66	0.00	6.0	93.6	0.4	-0.50	0.73	0.81	1.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10472	1366	8	0	8	0	0	logfile
✘	8HG0	34730	2025-01-14	2022-11-13	3.51	4.44	3.51	3.7	0.003	0.61	0.0	0.04	17.58	0.00	2.098	7.93	1.15	1.8	98.1	0.1	0.06	0.85	0.80	1.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6470	790	4	0	4	0	0	logfile
✘	8BKZ	16099	2025-01-21	2022-11-09	2.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	67875	8680	70	0	42	3505	0	logfile

• ← previous
• Page 14 of 39
• next →