Table showing results for December 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	9EGX	48039	2024-12-30	2024-11-21	2.9	4.30	—	3.1	0.004	0.69	0.0	0.04	15.38	0.01	2.018	8.54	0.50	4.6	95.3	0.1	-1.07	0.77	0.57	1.20	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	65003	8183	39	328	10	0	0	logfile
✘	9DW9	47239	2024-12-30	2024-10-08	2.8	3.05	2.88	3.1	0.004	0.67	1.0	0.04	15.32	0.00	1.931	2.37	1.69	2.2	97.8	0.0	0.50	0.68	0.87	3.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12332	1511	5	0	19	3	0	logfile
✘	9GUV	51621	2024-12-28	2024-09-20	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	55998	2774	26	1633	86	0	0	logfile
✘	9GUS	51618	2024-12-28	2024-09-20	3.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	55373	2597	26	1634	125	0	0	logfile
✘	9GUU	51620	2024-12-28	2024-09-20	2.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	55336	2596	25	1633	120	0	0	logfile
✘	9GUP	51615	2024-12-28	2024-09-20	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	53689	2594	24	1556	86	0	0	logfile
✘	9GUQ	51616	2024-12-28	2024-09-20	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	55411	2595	26	1636	128	0	0	logfile
✘	9GUT	51619	2024-12-29	2024-09-20	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	58183	2939	27	1633	137	0	0	logfile
✘	9JE0	61403	2024-12-27	2024-09-01	3.23	3.76	3.35	3.9	0.003	0.58	0.0	0.04	14.22	0.00	2.281	4.93	2.61	2.1	97.9	0.0	-0.32	0.44	0.66	1.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3321	435	2	0	1	1	0	logfile
✘	9DDE	46771	2024-12-31	2024-08-28	3.2	4.04	3.22	3.3	0.004	0.65	0.0	0.04	26.36	0.01	2.226	7.39	0.33	2.7	97.3	0.0	1.79	0.88	0.82	2.44	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15394	1147	18	324	5	0	0	logfile
✘	9CX6	45979	2024-12-27	2024-07-30	3.2	3.35	3.13	3.5	0.009	1.46	0.0	0.07	12.63	0.01	0.182	28.34	0.00	5.0	95.0	0.0	-4.11	0.47	0.62	4.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	49250	7200	200	0	0	250	0	logfile
✘	9CTQ	45915	2024-12-31	2024-07-25	2.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15630	1880	10	0	10	0	0	logfile
✘	9CTS	45917	2024-12-31	2024-07-25	2.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15623	1880	10	0	9	0	0	logfile
✘	9iMH	60689	2024-12-28	2024-07-03	4.2	3.96	3.75	4.1	0.006	1.06	7.0	0.08	15.41	0.01	2.171	19.62	0.70	12.0	84.5	3.5	-2.10	0.51	0.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7674	960	6	0	0	0	0	logfile
✘	9CGi	45580	2024-12-31	2024-06-29	2.92	3.60	3.10	3.4	0.005	0.88	2.0	0.05	12.93	0.01	2.249	3.35	0.24	2.3	97.7	0.0	-0.05	0.85	0.88	3.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14751	1839	5	0	0	0	0	logfile
✘	9CEX	45522	2024-12-30	2024-06-27	3.27	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14679	600	8	151	3	3	6578	logfile
✘	9CET	45518	2024-12-30	2024-06-27	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14090	596	5	134	1	0	6375	logfile
✘	9CEU	45519	2024-12-30	2024-06-27	3.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13398	607	5	108	1	0	6141	logfile
✘	9CER	45516	2024-12-30	2024-06-27	4.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14598	612	2	142	0	0	6561	logfile
✘	9CEW	45521	2024-12-31	2024-06-27	2.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15163	600	7	166	3	0	6758	logfile

• Page 1 of 28
• next →