Table showing results for all available months

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	9CEW	45521	2024-10-13	2024-06-27	2.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15163	600	7	166	3	0	6758	logfile
✔	9CES	45517	2025-01-20	2024-06-27	3.28	3.52	3.31	3.5	0.013	1.96	0.0	0.10	23.23	0.03	2.515	1.01	0.91	4.1	95.9	0.0	-0.87	0.56	0.46	2.49	3.4	0.005	0.67	0.0	0.04	23.34	0.01	2.196	7.83	1.64	6.0	94.0	0.0	0.85	1.27	0.72	0.76	2.44	15839	612	4	181	0	0	7001	logfile
✘	9CEU	45519	2024-09-26	2024-06-27	3.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13398	607	5	108	1	0	6141	logfile
✔	9CES	45517	2024-11-18	2024-06-27	3.28	3.52	3.31	3.5	0.013	1.96	0.0	0.10	23.23	0.03	2.515	1.01	0.91	4.1	95.9	0.0	-0.87	0.56	0.46	2.49	3.4	0.003	0.62	0.0	0.03	23.35	0.00	2.185	6.00	2.18	4.1	95.9	0.0	0.99	1.27	0.71	0.74	2.42	15839	612	4	181	0	0	7001	logfile
✘	9CEZ	45524	2024-12-30	2024-06-27	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13540	600	6	115	3	3	6178	logfile
✘	9CET	45518	2024-10-13	2024-06-27	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14090	596	5	134	1	0	6375	logfile
✔	9CES	45517	2024-12-31	2024-06-27	3.28	3.52	3.31	3.5	0.013	1.96	0.0	0.10	23.23	0.03	2.515	1.01	0.91	4.1	95.9	0.0	-0.87	0.56	0.46	2.49	3.4	0.003	0.62	0.0	0.03	23.35	0.00	2.185	6.00	2.18	4.1	95.9	0.0	0.99	1.27	0.71	0.74	2.42	15839	612	4	181	0	0	7001	logfile
✘	9CEU	45519	2024-10-12	2024-06-27	3.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13398	607	5	108	1	0	6141	logfile
✘	9CET	45518	2024-09-26	2024-06-27	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14090	596	5	134	1	0	6375	logfile
✘	9CEU	45519	2024-11-17	2024-06-27	3.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13398	607	5	108	1	0	6141	logfile
✘	9CET	45518	2025-01-19	2024-06-27	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14090	596	5	134	1	0	6375	logfile
✘	9CEY	45523	2025-01-19	2024-06-27	3.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13829	607	6	121	3	3	6298	logfile
✘	9CEW	45521	2024-12-31	2024-06-27	2.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15163	600	7	166	3	0	6758	logfile
✘	9CEZ	45524	2024-10-12	2024-06-27	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13540	600	6	115	3	3	6178	logfile
✔	9CF1	45526	2024-09-27	2024-06-27	3.52	3.91	3.74	3.8	0.013	1.84	1.0	0.10	20.92	0.02	1.358	1.05	0.76	6.0	93.5	0.5	-1.31	0.72	0.61	2.15	3.7	0.003	0.64	0.0	0.04	21.26	0.00	2.353	7.69	1.14	4.8	95.1	0.1	0.14	1.09	0.77	0.74	1.45	17138	888	5	82	0	0	8199	logfile
✘	9CEY	45523	2024-09-26	2024-06-27	3.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13829	607	6	121	3	3	6298	logfile
✔	9CF1	45526	2024-11-18	2024-06-27	3.52	3.91	3.74	3.8	0.013	1.84	1.0	0.10	20.92	0.02	1.358	1.05	0.76	6.0	93.5	0.5	-1.31	0.72	0.61	2.15	3.7	0.003	0.64	0.0	0.04	21.26	0.00	2.353	7.69	1.14	4.8	95.1	0.1	0.14	1.09	0.77	0.74	1.45	17138	888	5	82	0	0	8199	logfile
✔	9CF2	45527	2024-11-19	2024-06-27	3.15	2.38	3.26	2.8	0.002	0.61	0.0	0.04	18.51	0.00	1.441	3.97	0.00	1.4	98.6	0.0	2.60	0.67	0.60	2.80	2.8	0.003	0.58	0.0	0.04	21.00	0.00	2.383	5.11	0.51	2.9	97.1	0.0	1.38	1.44	0.73	0.77	3.26	18387	888	7	121	0	0	8649	logfile
✔	9CF1	45526	2024-10-14	2024-06-27	3.52	3.91	3.74	3.8	0.013	1.84	1.0	0.10	20.92	0.02	1.358	1.05	0.76	6.0	93.5	0.5	-1.31	0.72	0.61	2.15	3.7	0.003	0.64	0.0	0.04	21.26	0.00	2.353	7.69	1.14	4.8	95.1	0.1	0.14	1.09	0.77	0.74	1.45	17138	888	5	82	0	0	8199	logfile
✔	9CF2	45527	2024-09-28	2024-06-27	3.15	2.38	3.26	2.8	0.002	0.61	0.0	0.04	18.51	0.00	1.441	3.97	0.00	1.4	98.6	0.0	2.60	0.67	0.60	2.80	2.8	0.003	0.58	0.0	0.04	21.00	0.00	2.383	5.11	0.51	2.9	97.1	0.0	1.38	1.44	0.73	0.77	3.26	18387	888	7	121	0	0	8649	logfile

• ← previous
• Page 41 of 5115
• next →