Table showing results for all available months

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✔	8XV1	38689	2025-05-13	2024-01-14	3.05	3.37	3.22	3.4	0.003	0.61	0.0	0.05	15.77	0.00	2.244	3.39	0.00	4.7	95.3	0.0	1.11	0.48	0.66	2.62	3.3	0.003	0.57	0.0	0.04	15.53	0.00	2.555	2.93	1.86	5.6	94.3	0.1	0.78	1.81	0.63	0.82	2.94	6652	794	7	0	15	0	0	logfile
✔	8XV1	38689	2025-02-14	2024-01-14	3.05	3.37	3.22	3.4	0.003	0.57	0.0	0.05	15.77	0.00	2.244	3.39	0.00	4.7	95.3	0.0	1.11	0.48	0.66	2.62	3.3	0.003	0.59	0.0	0.04	15.55	0.00	2.555	3.16	1.43	5.3	94.6	0.1	0.72	1.81	0.64	0.82	2.99	6652	794	7	0	15	0	0	logfile
✔	8XV1	38689	2024-12-29	2024-01-14	3.05	3.37	3.22	3.4	0.003	0.57	0.0	0.05	15.77	0.00	2.244	3.39	0.00	4.7	95.3	0.0	1.11	0.48	0.66	2.62	3.3	0.003	0.57	0.0	0.04	15.55	0.00	2.548	3.16	1.58	4.9	94.9	0.1	0.72	1.81	0.63	0.82	2.86	6652	794	7	0	15	0	0	logfile
✘	8XUU	38684	2025-01-13	2024-01-14	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3598	431	3	0	9	0	0	logfile
✘	8XUU	38684	2025-03-05	2024-01-14	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3598	431	3	0	9	0	0	logfile
✘	8XUU	38684	2024-12-27	2024-01-14	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3598	431	3	0	9	0	0	logfile
✘	8XUU	38684	2025-04-26	2024-01-14	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3598	431	3	0	9	0	0	logfile
✘	8XUU	38684	2024-08-02	2024-01-14	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3598	431	3	0	9	0	0	logfile
✘	8XUU	38684	2025-05-09	2024-01-14	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3598	431	3	0	9	0	0	logfile
✘	8XUR	38681	2025-05-24	2024-01-14	3.85	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25792	3189	20	0	63	0	0	logfile
✘	8XUR	38681	2024-08-09	2024-01-14	3.85	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25792	3189	20	0	63	0	0	logfile
✘	8XUU	38684	2024-10-09	2024-01-14	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3598	431	3	0	9	0	0	logfile
✔	8XUZ	38687	2025-05-28	2024-01-14	3.05	3.55	3.07	3.4	0.003	0.54	0.0	0.04	15.16	0.00	2.161	6.09	0.00	4.4	95.6	0.0	0.00	0.82	0.84	2.68	3.4	0.003	0.60	0.0	0.04	15.11	0.00	2.439	5.69	0.72	4.7	95.2	0.0	0.23	0.47	0.81	0.84	2.50	26825	3306	18	0	60	0	0	logfile
✔	8VoB	43373	2025-05-14	2024-01-14	3.1	4.16	3.26	3.4	0.005	0.76	0.0	0.04	31.21	0.01	2.066	20.74	0.79	3.3	96.7	0.0	0.86	0.83	0.80	1.22	3.4	0.006	0.77	0.0	0.04	31.27	0.01	2.022	21.23	2.85	5.5	94.5	0.0	0.32	1.15	0.84	0.81	0.68	12550	777	10	314	0	0	0	logfile
✔	8VoA	43369	2025-05-21	2024-01-14	4.0	4.00	3.90	3.9	0.004	0.61	0.0	0.05	15.00	0.00	1.925	17.25	0.26	4.4	95.6	0.0	0.13	0.63	0.78	—	3.9	0.003	0.64	0.0	0.04	16.39	0.00	2.089	9.08	1.62	3.8	96.2	0.0	0.38	0.55	0.66	0.80	—	21459	2723	13	0	12	0	0	logfile
✔	8XUY	38686	2024-12-26	2024-01-14	3.14	3.59	3.30	3.3	0.004	0.61	0.0	0.05	15.40	0.00	2.063	9.95	0.00	6.7	93.3	0.0	-1.39	0.79	0.83	1.83	3.3	0.006	0.70	0.0	0.05	15.63	0.00	2.346	9.34	1.63	7.7	92.3	0.0	-1.08	0.52	0.77	0.81	1.72	34827	4266	24	0	74	0	0	logfile
✘	8XUU	38684	2024-09-23	2024-01-14	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3598	431	3	0	9	0	0	logfile
✘	8XUU	38684	2024-11-14	2024-01-14	3.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3598	431	3	0	9	0	0	logfile
✔	8XV5	38692	2025-05-09	2024-01-14	3.7	2.43	3.70	2.9	0.005	0.90	0.0	0.05	9.70	0.01	2.280	3.19	0.00	4.4	95.6	0.0	-3.67	0.68	0.71	3.33	2.1	0.005	0.69	0.0	0.04	14.72	0.00	2.548	10.53	4.20	3.4	96.6	0.0	0.97	0.65	0.69	0.72	3.50	3122	388	2	0	1	0	0	logfile
✔	8XV5	38692	2025-04-26	2024-01-14	3.7	2.43	3.70	2.9	0.005	0.90	0.0	0.05	9.70	0.01	2.280	3.19	0.00	4.4	95.6	0.0	-3.67	0.68	0.71	3.33	2.9	0.003	0.63	0.0	0.04	14.87	0.00	2.604	8.62	3.60	3.1	96.9	0.0	1.36	0.66	0.68	0.71	3.12	3122	388	2	0	1	0	0	logfile

• ← previous
• Page 411 of 5030
• next →