Table showing results for January 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	8FGX	29077	2024-01-19	2022-12-13	2.62	3.60	2.58	3.0	0.003	0.45	0.0	0.04	9.99	0.00	2.400	1.82	0.00	1.6	98.4	0.0	1.41	0.90	0.88	4.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9899	645	4	0	3	0	4873	logfile
✘	8HPD	34930	2024-01-19	2022-12-12	2.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7949	651	6	0	56	0	0	logfile
✘	8HoY	34927	2024-01-20	2022-12-11	2.76	2.99	2.88	3.1	0.002	0.46	0.0	0.04	13.25	0.00	2.189	9.49	0.00	7.4	92.6	0.1	-0.64	0.51	0.54	0.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13454	1650	3	0	0	0	0	logfile
✘	8HNL	34915	2024-01-18	2022-12-08	2.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8944	1135	6	0	3	0	0	logfile
✘	8BX5	16308	2024-01-19	2022-12-07	4.2	4.41	4.00	4.3	0.003	0.78	1.0	0.06	14.22	0.01	2.218	14.11	0.63	3.9	96.1	0.0	-0.69	0.60	0.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12527	1630	13	0	4	4	0	logfile
✘	8HMP	34902	2024-01-18	2022-12-05	2.77	2.61	2.82	2.8	0.005	0.92	0.0	0.06	14.08	0.01	2.228	5.94	0.00	3.4	96.6	0.0	-0.73	0.63	0.79	3.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8319	1045	6	0	1	0	0	logfile
✘	8BVR	16269	2024-01-17	2022-12-05	3.52	4.00	3.61	3.9	0.005	0.72	0.0	0.04	17.01	0.01	2.178	12.22	0.19	4.6	95.4	0.0	0.64	0.62	0.78	1.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4806	617	3	0	3	0	0	logfile
✘	8FE1	29019	2024-01-20	2022-12-05	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15445	1772	10	0	48	0	0	logfile
✘	8FDU	29014	2024-01-20	2022-12-04	3.3	3.75	3.30	3.6	0.005	0.83	0.0	0.05	13.46	0.00	2.212	12.19	0.21	4.1	95.9	0.1	-0.29	0.66	0.78	1.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13193	1633	4	0	2	0	0	logfile
✘	8HLV	34883	2024-01-20	2022-12-01	2.55	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8136	669	6	0	57	0	0	logfile
✘	8HKU	34860	2024-01-17	2022-11-28	2.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	8HKX	34862	2024-01-18	2022-11-28	3.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	8HL3	34868	2024-01-17	2022-11-28	4.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	8HL4	34869	2024-01-17	2022-11-28	4.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	8HL2	34867	2024-01-17	2022-11-28	4.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	8HiJ	34818	2024-01-18	2022-11-20	3.54	2.56	3.51	3.0	0.004	0.72	1.0	0.05	9.92	0.01	2.315	3.83	0.00	5.2	94.8	0.0	-3.81	0.69	0.69	2.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8245	1055	5	0	1	0	0	logfile
✘	8Hii	34817	2024-01-18	2022-11-20	3.57	2.49	3.54	3.0	0.004	0.80	0.0	0.05	9.45	0.01	2.260	3.48	0.00	5.4	94.6	0.0	-3.43	0.72	0.70	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8212	1055	4	0	0	0	0	logfile
✘	8F7X	28912	2024-01-18	2022-11-20	3.28	3.38	3.18	3.4	0.004	0.88	0.0	0.05	8.64	0.01	2.274	2.87	0.10	2.1	97.9	0.0	0.54	0.59	0.78	2.02	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8902	1145	6	0	0	0	0	logfile
✘	8F6T	28890	2024-01-17	2022-11-17	2.76	3.61	2.91	3.4	0.004	0.63	0.0	0.04	12.87	0.00	2.119	4.79	0.00	5.4	94.6	0.0	0.80	0.65	0.86	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3473	428	1	0	4	0	0	logfile
✘	8BPB	16148	2024-01-18	2022-11-16	2.8	2.48	3.00	2.8	0.004	0.61	0.0	0.04	17.77	0.00	1.755	8.92	2.96	2.5	97.5	0.0	0.64	0.74	0.80	2.51	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8384	1030	7	0	6	12	0	logfile

• ← previous
• Page 5 of 27
• next →