Table showing results for April 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	8Hii	34817	2024-04-06	2022-11-20	3.57	2.49	3.54	3.0	0.004	0.80	0.0	0.05	9.45	0.01	2.260	3.48	0.00	5.4	94.6	0.0	-3.43	0.72	0.70	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8212	1055	4	0	0	0	0	logfile
✘	8HiJ	34818	2024-04-06	2022-11-20	3.54	2.56	3.51	3.0	0.004	0.72	1.0	0.05	9.92	0.01	2.315	3.83	0.00	5.2	94.8	0.0	-3.81	0.69	0.69	2.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8245	1055	5	0	1	0	0	logfile
✘	8F7X	28912	2024-04-06	2022-11-20	3.28	3.38	3.18	3.4	0.004	0.88	0.0	0.05	8.64	0.01	2.274	2.87	0.10	2.1	97.9	0.0	0.54	0.59	0.78	2.02	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8902	1145	6	0	0	0	0	logfile
✘	8F6T	28890	2024-04-05	2022-11-17	2.76	3.61	2.91	3.4	0.004	0.63	0.0	0.04	12.87	0.00	2.119	4.79	0.00	5.4	94.6	0.0	0.80	0.65	0.86	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3473	428	1	0	4	0	0	logfile
✘	8BPB	16148	2024-04-06	2022-11-16	2.8	2.48	3.00	2.8	0.004	0.61	0.0	0.04	17.77	0.00	1.755	8.92	2.96	2.5	97.5	0.0	0.64	0.74	0.80	2.51	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8384	1030	7	0	6	12	0	logfile
✘	8F68	28877	2024-04-07	2022-11-16	3.15	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9666	1198	6	0	6	0	0	logfile
✘	8F6C	28879	2024-04-10	2022-11-16	3.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19344	2396	12	0	12	0	0	logfile
✘	8HH6	34753	2024-04-12	2022-11-16	2.9	3.16	3.03	3.1	0.003	0.58	0.0	0.04	13.71	0.00	2.002	5.07	0.00	2.3	97.7	0.0	1.53	0.80	0.89	3.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24277	3129	13	0	13	0	0	logfile
✘	8F6E	28881	2024-04-07	2022-11-16	3.8	4.02	3.70	4.0	0.003	0.55	0.0	0.04	13.52	0.00	2.060	5.75	0.00	5.4	94.2	0.4	-0.77	0.72	0.75	2.20	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10478	1366	8	0	8	0	0	logfile
✘	8F6P	28887	2024-04-10	2022-11-16	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17507	1091	4	0	34	0	8229	logfile
✘	8BoB	16140	2024-04-08	2022-11-15	2.94	3.13	2.90	3.0	0.009	0.87	0.0	0.06	15.31	0.00	2.208	10.38	3.17	4.2	95.5	0.3	-1.98	0.85	0.84	3.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12712	1604	8	0	4	0	0	logfile
✘	8HGH	34739	2024-04-12	2022-11-14	4.16	3.79	4.05	3.7	0.003	0.62	2.0	0.05	12.05	0.01	2.298	3.92	5.83	3.4	96.6	0.0	-1.78	0.76	0.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25512	3266	6	0	2	0	0	logfile
✘	8HG6	34736	2024-04-06	2022-11-13	3.44	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7259	593	6	0	60	0	0	logfile
✘	8HG5	34735	2024-04-06	2022-11-13	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7794	627	6	0	64	0	0	logfile
✘	8HG3	34733	2024-04-06	2022-11-13	2.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7456	604	6	0	62	0	0	logfile
✘	8BLo	16110	2024-04-06	2022-11-10	2.9	3.05	2.97	3.1	0.007	0.69	0.0	0.04	17.38	0.00	2.328	7.94	0.98	2.9	96.9	0.3	-1.47	0.67	0.87	4.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8487	1056	9	0	24	18	0	logfile
✘	8BLP	16112	2024-04-07	2022-11-10	2.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9378	1065	9	0	66	66	0	logfile
✘	8BL2	16100	2024-04-06	2022-11-09	2.3	2.29	2.26	2.2	0.005	0.59	0.0	0.04	16.84	0.00	1.872	11.53	1.01	1.2	98.8	0.0	0.70	0.76	0.75	3.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	57128	7336	42	0	42	2780	0	logfile
✘	8F39	28835	2024-04-16	2022-11-09	3.5	4.18	3.05	3.6	0.003	0.74	0.0	0.04	15.48	0.01	1.955	14.72	0.22	5.2	94.6	0.2	0.30	0.77	0.70	0.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	38767	5098	32	0	9	0	0	logfile
✘	8F1K	28791	2024-04-14	2022-11-05	2.8	3.72	2.83	3.2	0.002	0.47	0.0	0.04	15.01	0.00	2.130	4.40	1.30	2.3	97.7	0.0	0.58	0.88	0.82	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30854	3689	14	95	3	10	0	logfile

• ← previous
• Page 15 of 75
• next →