Table showing results for June 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7XJi	33228	2022-06-02	2022-04-18	3.9	3.60	3.70	3.9	0.004	0.61	0.0	0.04	14.07	0.00	2.165	9.09	0.00	4.3	95.7	0.0	-0.25	0.61	0.78	2.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7851	1027	6	0	1	0	0	logfile
✘	7XCT	33127	2022-06-04	2022-03-25	2.72	3.02	—	3.0	0.012	1.10	0.0	0.06	22.70	0.01	2.220	3.90	0.59	5.3	94.3	0.4	-5.11	0.73	0.82	3.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18633	1575	16	290	2	0	0	logfile
✘	7WU5	32820	2022-06-02	2022-02-05	3.0	2.73	—	3.1	0.003	0.50	0.0	0.04	13.51	0.00	1.184	9.21	0.00	2.4	97.6	0.0	0.35	0.61	0.77	2.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6948	888	4	0	2	0	0	logfile
✘	7WU3	32818	2022-06-02	2022-02-05	3.1	3.13	—	3.1	0.003	0.52	0.0	0.04	13.74	0.00	1.185	7.73	0.00	2.4	97.6	0.0	1.63	0.70	0.80	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7877	1013	5	0	1	0	0	logfile
✘	7WU4	32819	2022-06-02	2022-02-05	3.4	3.44	—	3.8	0.002	0.48	0.0	0.04	14.07	0.00	1.185	8.62	0.00	2.5	97.5	0.0	0.46	0.58	0.71	2.09	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6887	888	4	0	2	0	0	logfile
✘	7R12	14228	2022-06-02	2022-02-02	3.3	3.37	3.22	3.3	0.003	0.53	0.0	0.04	13.47	0.00	2.161	4.03	0.00	2.8	97.2	0.0	0.39	0.74	0.81	2.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6858	839	4	0	7	0	0	logfile
✘	7QWS	14193	2022-06-06	2022-01-25	3.4	3.09	—	7.2	0.002	0.46	0.0	0.03	14.64	0.00	2.011	9.49	1.65	3.7	96.3	0.0	0.47	0.23	0.02	-0.02	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	137913	7047	55	3769	126	0	0	logfile
✘	7QWQ	14191	2022-06-07	2022-01-25	2.83	2.26	—	2.7	0.002	0.53	0.0	0.03	14.96	0.01	1.516	9.20	0.03	4.6	95.4	0.0	0.48	0.46	0.66	1.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	143809	7312	59	3936	158	0	0	logfile
✘	7TJ8	25919	2022-06-02	2022-01-14	3.2	3.59	—	3.5	0.014	1.03	2.0	0.06	16.35	0.01	2.042	6.56	0.80	6.0	93.4	0.7	-2.85	0.58	0.84	3.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10551	1242	4	0	18	0	0	logfile
✘	7TiB	25616	2022-06-04	2022-01-13	3.4	3.28	3.41	3.3	0.002	0.53	0.0	0.04	16.66	0.00	2.099	8.58	1.09	2.2	97.8	0.0	-1.97	0.64	0.79	1.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21377	2581	15	42	9	0	0	logfile
✘	7TFS	25879	2022-06-03	2022-01-07	4.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13008	1616	8	0	32	0	0	logfile
✘	7TES	25851	2022-06-05	2022-01-05	4.7	8.44	4.80	4.3	0.004	0.92	0.0	0.05	14.89	0.01	2.261	9.08	1.27	8.9	90.9	0.3	-4.01	0.82	0.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31306	3986	8	0	0	0	0	logfile
✘	7TDi	25830	2022-06-03	2021-12-31	3.3	3.81	3.62	3.6	0.005	0.81	0.0	0.04	16.22	0.01	2.159	4.28	0.85	4.4	95.5	0.1	-0.18	0.82	0.72	0.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	117132	12936	8	0	3616	0	0	logfile
✘	7WG5	32477	2022-06-02	2021-12-28	3.89	3.98	—	3.9	0.008	1.48	1.0	0.06	16.25	0.02	1.205	9.81	0.93	8.2	91.7	0.1	-3.89	0.64	0.66	1.18	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	112687	11759	92	0	545	0	0	logfile
✘	7WFE	32463	2022-06-06	2021-12-26	3.25	3.37	—	3.3	0.008	1.72	0.0	0.05	18.88	0.02	1.207	6.15	1.38	6.3	93.6	0.1	-3.28	0.68	0.82	3.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35123	3216	30	0	205	0	0	logfile
✘	7WFD	32462	2022-06-06	2021-12-26	3.25	3.37	—	3.3	0.008	1.60	0.0	0.06	19.32	0.02	1.208	5.04	1.18	6.7	93.3	0.0	-3.23	0.69	0.83	3.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35603	3231	30	0	211	0	0	logfile
✘	7WEC	32446	2022-06-05	2021-12-23	3.3	3.63	—	3.5	0.004	0.68	1.0	0.05	13.95	0.00	1.785	9.88	0.26	6.6	93.2	0.1	-1.96	0.78	0.81	2.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32217	3984	33	0	78	0	0	logfile
✘	7WDB	32436	2022-06-04	2021-12-21	2.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22404	2660	8	0	28	0	4	logfile
✘	7QKU	14053	2022-06-01	2021-12-19	2.57	2.42	2.48	2.7	0.011	1.83	5.0	0.10	11.69	0.01	2.516	0.85	0.00	5.2	94.8	0.0	-1.72	0.47	0.88	5.27	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3456	453	6	0	0	0	0	logfile
✘	7QHM	13976	2022-06-06	2021-12-13	2.8	2.80	—	2.8	0.008	0.94	0.0	0.05	15.82	0.01	1.191	2.01	0.35	4.0	95.8	0.2	-1.90	0.62	0.81	3.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	94633	5886	67	0	88	416	45103	logfile

• Page 1 of 29
• next →