Table showing results for August 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	8D4T	27196	2022-08-07	2022-06-02	3.1	3.33	3.11	3.4	0.013	1.92	33.0	0.13	18.29	0.02	1.331	6.59	9.65	3.6	96.0	0.4	-0.95	0.66	0.83	3.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27974	1738	17	0	12	0	13710	logfile
✘	8CTK	26993	2022-08-03	2022-05-15	3.52	3.87	3.55	3.9	0.003	0.69	0.0	0.05	14.37	0.00	2.347	4.53	0.00	3.8	96.2	0.0	-1.07	0.54	0.70	0.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3042	376	2	0	0	0	0	logfile
✘	7UZY	26922	2022-08-05	2022-05-09	4.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15332	1781	11	44	0	0	0	logfile
✘	7UZX	26921	2022-08-05	2022-05-09	3.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14858	1760	9	36	0	0	0	logfile
✘	7UY8	26867	2022-08-04	2022-05-06	4.5	8.56	4.38	4.2	0.003	0.63	1.0	0.05	14.55	0.00	2.207	8.85	0.00	6.1	93.9	0.0	-0.66	0.79	0.60	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9552	1161	5	0	1	0	0	logfile
✘	7ZR8	14886	2022-08-03	2022-05-03	3.7	3.81	3.43	3.8	0.003	0.46	0.0	0.04	8.45	0.00	2.181	7.02	0.74	3.9	96.1	0.0	-0.94	0.72	0.82	2.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3693	471	4	0	1	0	0	logfile
✘	7Xo7	33339	2022-08-08	2022-05-01	3.38	2.45	3.48	2.1	0.002	0.42	0.0	0.04	7.66	0.00	2.025	7.28	0.08	2.0	98.0	0.0	-3.21	0.62	0.55	1.27	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34209	4267	10	0	43	0	0	logfile
✘	7XoB	33343	2022-08-08	2022-05-01	3.3	2.37	3.36	2.1	0.005	0.91	12.0	0.08	13.68	0.01	1.329	8.16	0.57	4.9	95.0	0.2	-3.07	0.57	0.43	1.44	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34108	4260	10	0	39	0	0	logfile
✘	7XJi	33228	2022-08-03	2022-04-18	3.9	3.60	3.70	3.9	0.004	0.61	0.0	0.04	14.07	0.00	2.165	9.09	0.00	4.3	95.7	0.0	-0.25	0.61	0.78	2.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7851	1027	6	0	1	0	0	logfile
✘	7XCT	33127	2022-08-06	2022-03-25	2.72	3.02	—	3.0	0.012	1.10	0.0	0.06	22.70	0.01	2.220	3.90	0.59	5.3	94.3	0.4	-5.11	0.73	0.82	3.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18633	1575	16	290	2	0	0	logfile
✘	7XBW	33107	2022-08-03	2022-03-22	2.8	3.01	2.74	3.1	0.005	0.54	0.0	0.04	11.71	0.00	2.251	6.83	0.00	2.6	97.4	0.0	1.47	0.60	0.72	2.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6663	886	4	0	3	0	0	logfile
✘	7X8R	33057	2022-08-03	2022-03-14	2.61	2.75	—	2.8	0.018	0.72	0.0	0.23	14.24	0.00	2.201	7.67	0.00	3.1	96.9	0.0	0.83	0.67	0.80	3.43	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8493	1051	5	0	1	0	0	logfile
✘	7WYX	32897	2022-08-06	2022-02-16	3.4	3.47	—	3.5	0.012	1.32	0.0	0.06	18.77	0.01	1.893	10.48	10.43	8.4	90.9	0.7	-3.31	0.74	0.80	1.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22714	2654	22	0	78	6	0	logfile
✘	7WU3	32818	2022-08-03	2022-02-05	3.1	3.13	—	3.1	0.003	0.52	0.0	0.04	13.74	0.00	1.185	7.73	0.00	2.4	97.6	0.0	1.63	0.70	0.80	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7877	1013	5	0	1	0	0	logfile
✘	7WU4	32819	2022-08-03	2022-02-05	3.4	3.44	—	3.8	0.002	0.48	0.0	0.04	14.07	0.00	1.185	8.62	0.00	2.5	97.5	0.0	0.46	0.58	0.71	2.09	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6887	888	4	0	2	0	0	logfile
✘	7WU5	32820	2022-08-03	2022-02-05	3.0	2.73	—	3.1	0.003	0.50	0.0	0.04	13.51	0.00	1.184	9.21	0.00	2.4	97.6	0.0	0.35	0.61	0.77	2.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6948	888	4	0	2	0	0	logfile
✘	7R12	14228	2022-08-03	2022-02-02	3.3	3.37	3.22	3.3	0.003	0.53	0.0	0.04	13.47	0.00	2.161	4.03	0.00	2.8	97.2	0.0	0.39	0.74	0.81	2.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6858	839	4	0	7	0	0	logfile
✘	7WRi	32727	2022-08-03	2022-01-26	3.03	3.18	—	3.2	0.003	0.58	1.0	0.04	15.50	0.00	2.099	6.84	2.03	6.0	94.0	0.0	-4.19	0.73	0.80	2.23	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6431	790	4	0	2	0	0	logfile
✘	7QWQ	14191	2022-08-09	2022-01-25	2.83	2.26	—	2.7	0.002	0.53	0.0	0.03	14.96	0.01	1.516	9.20	0.03	4.6	95.4	0.0	0.48	0.46	0.66	1.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	143809	7312	59	3936	158	0	0	logfile
✘	7Too	26033	2022-08-06	2022-01-24	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile

• Page 1 of 26
• next →