Table showing results for August 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7UWE	26830	2024-08-09	2022-05-03	2.9	3.49	2.92	3.2	0.004	0.75	0.0	0.05	14.00	0.00	2.097	8.35	0.67	4.4	95.5	0.1	-0.75	0.80	0.73	2.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27327	3349	10	56	3	0	0	logfile
✘	7XoA	33342	2024-08-10	2022-05-01	3.2	2.32	3.20	2.1	0.003	0.56	0.0	0.04	9.80	0.01	1.863	8.79	0.06	2.8	97.2	0.1	-2.65	0.59	0.48	1.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29202	3670	8	0	35	0	0	logfile
✘	7XNo	33321	2024-08-06	2022-04-29	2.54	2.96	2.54	2.8	0.002	0.53	0.0	0.04	12.89	0.00	2.215	5.72	0.12	4.5	95.4	0.1	1.92	0.69	0.85	3.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15888	2085	15	0	3	0	0	logfile
✘	7XMZ	33308	2024-08-10	2022-04-27	3.25	3.45	3.31	3.4	0.009	1.06	5.0	0.07	13.61	0.00	1.460	5.15	0.47	4.4	95.5	0.1	-1.48	0.73	0.80	3.38	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29203	3745	12	0	32	0	0	logfile
✘	7XMV	33306	2024-08-06	2022-04-27	2.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15228	1842	18	0	30	810	0	logfile
✘	7UTS	26788	2024-08-09	2022-04-27	3.6	2.51	3.41	2.1	0.008	0.97	0.0	0.05	13.01	0.01	2.296	0.78	0.99	4.0	96.0	0.0	-1.10	0.59	0.65	2.93	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25804	3092	10	0	203	0	0	logfile
✘	7UTR	26787	2024-08-11	2022-04-27	3.7	2.66	3.48	2.9	0.008	0.92	0.0	0.05	12.99	0.01	2.067	0.73	0.66	3.7	96.3	0.0	-0.87	0.62	0.74	3.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32764	3976	10	0	202	0	0	logfile
✘	7XMU	33305	2024-08-06	2022-04-26	2.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15294	1842	18	0	36	822	0	logfile
✘	7XLT	33286	2024-08-02	2022-04-22	4.4	4.55	4.45	4.3	0.004	0.89	0.0	0.05	18.80	0.01	2.288	8.02	0.79	6.8	93.2	0.0	-2.19	0.68	0.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4985	431	4	80	0	0	0	logfile
✘	7XL3	33271	2024-08-09	2022-04-21	3.13	3.20	—	3.2	0.002	0.39	0.0	0.04	12.03	0.00	2.263	4.77	1.08	2.9	97.1	0.0	-4.73	0.73	0.79	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25700	3480	8	0	3	0	0	logfile
✘	7XK0	33239	2024-08-04	2022-04-19	3.59	3.85	3.58	3.7	0.011	0.96	0.0	0.06	19.03	0.01	2.206	10.11	5.36	10.4	89.6	0.0	-5.27	0.81	0.86	2.36	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9208	983	2	70	1	0	0	logfile
✘	7ZKi	14763	2024-08-03	2022-04-13	3.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7120	688	5	77	2	0	0	logfile
✘	7XiB	33201	2024-08-03	2022-04-12	2.23	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7178	815	8	24	2	196	0	logfile
✘	7Xi9	33200	2024-08-03	2022-04-12	2.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7620	870	8	24	4	232	0	logfile
✘	7UNK	26625	2024-08-05	2022-04-11	3.45	3.69	3.50	3.6	0.003	0.66	0.0	0.04	15.44	0.01	2.169	7.74	0.75	3.0	97.0	0.0	1.09	0.72	0.83	0.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10992	1401	4	0	0	0	0	logfile
✘	7XHN	33196	2024-08-08	2022-04-09	3.71	3.96	3.74	3.8	0.011	1.26	0.0	0.06	19.32	0.01	1.828	35.23	1.25	8.6	90.7	0.7	-2.92	0.75	0.72	1.04	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23364	2888	20	50	0	0	0	logfile
✘	7UMN	26606	2024-08-05	2022-04-07	3.6	3.47	—	3.5	0.011	0.89	0.0	0.06	12.51	0.01	2.206	15.23	0.22	7.9	92.1	0.0	-2.39	0.69	0.76	3.01	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12375	1581	9	0	0	0	0	logfile
✘	7XG3	33184	2024-08-10	2022-04-02	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24368	2839	13	128	1	0	0	logfile
✘	7XG2	33183	2024-08-07	2022-04-02	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19904	2282	12	118	1	0	0	logfile
✘	7XG0	33181	2024-08-07	2022-04-02	2.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19893	2280	12	118	1	0	0	logfile

• ← previous
• Page 19 of 39
• next →