Table showing results for September 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	9P6B	71303	2025-09-19	2025-06-18	2.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22762	2568	12	0	42	92	0	logfile
✘	9R96	53854	2025-09-18	2025-05-19	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14606	1568	7	102	3	0	0	logfile
✘	9R6Q	53684	2025-09-17	2025-05-13	3.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4280	535	5	0	6	0	0	logfile
✘	9R6R	53685	2025-09-17	2025-05-13	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	2229	266	4	0	6	0	0	logfile
✘	9oA8	70275	2025-09-18	2025-04-19	3.59	3.98	3.60	3.9	0.003	0.46	0.0	0.04	14.79	0.00	1.515	2.09	0.00	3.5	96.5	0.0	0.68	0.68	0.82	1.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15255	2024	13	0	15	0	0	logfile
✘	9o8U	70238	2025-09-18	2025-04-16	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13972	1746	11	0	6	0	0	logfile
✘	9NSV	49753	2025-09-18	2025-03-17	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17487	1996	12	0	8	1394	0	logfile
✘	9NPY	49636	2025-09-19	2025-03-11	2.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25171	1877	36	483	32	827	0	logfile
✘	9QAY	52979	2025-09-18	2025-02-28	3.8	4.25	3.82	3.2	0.009	1.23	2.0	0.08	21.97	0.01	1.280	6.90	0.09	6.2	93.4	0.4	-3.03	0.83	0.76	0.32	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15471	1247	6	260	0	0	0	logfile
✘	9NE9	49302	2025-09-18	2025-02-19	3.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16735	1935	7	65	3	0	0	logfile
✘	9NEA	49303	2025-09-18	2025-02-19	3.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16578	1936	7	57	2	0	0	logfile
✘	9LUC	63394	2025-09-17	2025-02-08	3.5	3.84	3.62	3.9	0.010	1.49	2.0	0.09	17.83	0.03	2.239	8.46	11.92	2.6	97.3	0.1	-1.36	0.67	0.89	2.13	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9584	1249	7	0	0	0	0	logfile
✘	9N5U	49039	2025-09-18	2025-02-04	2.85	2.43	2.89	1.3	0.005	0.97	0.0	0.05	11.62	0.01	2.196	5.04	2.47	3.4	96.6	0.0	-0.70	0.92	0.87	4.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13355	1692	6	0	14	0	0	logfile
✘	9N2F	48837	2025-09-17	2025-01-28	3.5	2.39	3.39	2.2	0.004	0.71	1.0	0.05	18.69	0.00	2.415	10.57	5.19	6.3	93.5	0.2	-0.74	0.70	0.74	2.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7600	948	2	0	0	0	0	logfile
✘	9N2D	48835	2025-09-18	2025-01-28	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18488	2284	15	0	18	16	0	logfile
✘	9N13	48804	2025-09-17	2025-01-24	3.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4424	269	4	0	12	0	2083	logfile
✘	9N0D	48781	2025-09-18	2025-01-24	3.8	3.98	3.75	4.0	0.003	0.79	6.0	0.05	17.50	0.00	2.190	12.23	4.85	7.4	92.6	0.0	-0.03	0.63	0.75	1.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16989	2079	30	0	36	0	0	logfile
✘	9MVZ	48675	2025-09-19	2025-01-16	2.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26415	3468	12	0	3	0	0	logfile
✘	9MW0	48676	2025-09-18	2025-01-16	3.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19668	2589	9	0	3	0	0	logfile
✘	9MNY	48443	2025-09-17	2024-12-24	2.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5332	675	7	0	1	0	0	logfile

• Page 1 of 39
• next →