Table showing results for October 2021

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7RX5	24725	2021-10-03	2021-08-21	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9348	1189	41	0	0	0	0	logfile
✘	7RX4	24724	2021-10-04	2021-08-21	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14012	1798	62	0	0	0	0	logfile
✘	7PiJ	13438	2021-10-03	2021-08-20	3.47	4.14	—	4.1	0.015	1.17	0.0	0.05	13.54	0.01	1.166	13.15	0.11	10.6	89.3	0.1	-3.26	0.49	0.51	1.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8194	1068	8	0	0	16	0	logfile
✘	7PHP	13424	2021-10-03	2021-08-18	3.47	3.48	—	3.6	0.017	0.90	0.0	0.05	14.25	0.01	2.182	6.49	0.11	7.0	93.0	0.0	-1.50	0.72	0.83	3.15	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8647	1134	8	0	0	21	0	logfile
✘	7Fii	31598	2021-10-03	2021-07-31	4.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8765	1522	6	0	0	0	0	logfile
✘	7FiJ	31599	2021-10-03	2021-07-31	3.8	2.32	—	1.8	0.001	0.41	0.0	0.04	8.02	0.00	2.344	3.95	0.00	4.1	95.9	0.0	1.10	0.58	0.50	3.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3061	561	1	0	0	0	0	logfile
✘	7RJE	24486	2021-10-03	2021-07-20	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	57232	3818	24	0	10	0	27924	logfile
✘	7RH7	24457	2021-10-07	2021-07-16	3.0	3.06	—	3.2	0.007	1.32	0.0	0.25	14.59	0.01	1.182	16.11	0.00	7.7	92.1	0.2	-0.61	0.55	0.70	2.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	93330	6072	44	0	68	0	44390	logfile
✘	7RH6	24456	2021-10-07	2021-07-16	3.5	3.79	—	3.7	0.008	1.39	9.0	0.25	15.10	0.01	1.060	15.81	1.14	7.5	92.2	0.3	-0.59	0.66	0.72	2.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	89469	5901	42	0	64	0	41917	logfile
✘	7RH5	24455	2021-10-07	2021-07-16	3.0	3.17	—	3.2	0.008	1.35	1.0	0.25	14.70	0.01	1.180	16.59	0.11	7.7	92.0	0.2	-0.68	0.70	0.81	3.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	48948	6072	43	0	68	0	0	logfile
✘	7FBS	31519	2021-10-03	2021-07-12	3.4	3.24	—	3.2	0.008	0.82	0.0	0.05	15.34	0.01	1.141	18.65	3.06	7.4	92.5	0.1	-3.42	0.59	0.77	2.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9274	1118	1	0	17	0	0	logfile
✘	7RB9	24400	2021-10-04	2021-07-05	3.76	4.01	3.83	3.9	0.002	0.57	0.0	0.04	14.64	0.00	2.228	9.24	0.00	3.2	96.8	0.0	0.60	0.59	0.85	1.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14193	1786	7	0	6	0	0	logfile
✘	7R88	24311	2021-10-03	2021-06-26	3.5	3.76	—	3.7	0.002	0.45	0.0	0.04	12.49	0.00	2.274	5.25	1.02	3.5	96.5	0.0	-1.50	0.69	0.85	2.38	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10787	1368	4	0	0	0	0	logfile
✘	7oY8	13110	2021-10-05	2021-06-23	2.5	2.51	—	2.6	0.007	0.85	0.0	0.05	14.49	0.01	1.197	0.65	0.21	2.4	97.6	0.0	0.49	0.72	0.78	2.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22902	2293	103	0	68	372	0	logfile
✘	7oWG	13097	2021-10-04	2021-06-18	4.7	4.05	4.73	3.6	0.015	1.89	22.0	0.09	15.58	0.01	2.418	0.60	1.23	7.5	92.3	0.2	-3.00	0.81	0.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	114114	7078	8	0	110	0	57040	logfile
✘	7oUi	13078	2021-10-06	2021-06-11	2.79	3.20	—	3.1	0.017	2.00	0.0	0.06	18.28	0.04	1.216	51.35	1.81	5.1	94.7	0.2	0.45	0.63	0.78	3.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	84427	8342	108	0	374	139	0	logfile
✘	7N62	24192	2021-10-03	2021-06-07	4.0	3.42	—	3.9	0.006	0.81	0.0	0.05	13.91	0.01	2.203	20.57	0.00	14.9	85.1	0.0	-2.74	0.73	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5613	712	4	0	5	0	0	logfile
✘	7EVZ	31342	2021-10-03	2021-05-24	3.07	3.81	—	3.7	0.004	0.60	0.0	0.04	13.11	0.00	2.160	7.10	0.30	3.2	96.8	0.0	-1.99	0.54	0.75	1.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9078	1144	6	0	5	0	0	logfile
✘	7oJH	12951	2021-10-03	2021-05-15	3.1	2.57	4.81	20.0	0.016	1.03	0.0	0.29	10.92	0.00	2.239	2.98	0.52	2.9	97.1	0.0	0.37	0.00	0.00	-0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8999	1138	4	0	5	0	0	logfile
✘	7MTR	23995	2021-10-03	2021-05-13	3.3	2.40	—	2.1	0.007	0.97	1.0	0.05	14.03	0.01	2.236	7.57	1.03	3.9	96.1	0.0	-0.20	0.78	0.74	2.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10967	1524	4	0	3	0	0	logfile

• Page 1 of 27
• next →