Table showing results for all available months

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	9CEZ	45524	2025-06-11	2024-06-27	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13540	600	6	115	3	3	6178	logfile
✘	9CEZ	45524	2025-05-15	2024-06-27	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13540	600	6	115	3	3	6178	logfile
✘	9CEZ	45524	2025-01-19	2024-06-27	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13540	600	6	115	3	3	6178	logfile
✘	9CEZ	45524	2024-12-30	2024-06-27	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13540	600	6	115	3	3	6178	logfile
✘	9CEZ	45524	2024-11-17	2024-06-27	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13540	600	6	115	3	3	6178	logfile
✔	9CFW	45565	2025-05-17	2024-06-27	3.0	3.62	2.92	3.5	0.013	1.83	1.0	0.09	14.92	0.02	1.823	0.29	1.88	4.4	95.5	0.2	-1.69	0.72	0.64	2.79	3.5	0.003	0.74	0.0	0.04	16.14	0.00	1.884	8.36	1.76	2.6	97.4	0.0	0.79	0.73	0.80	0.81	1.98	15838	1981	9	0	7	0	0	logfile
✔	9CFW	45565	2025-06-13	2024-06-27	3.0	3.62	2.92	3.5	0.013	1.83	1.0	0.09	14.92	0.02	1.823	0.29	1.88	4.4	95.5	0.2	-1.69	0.72	0.64	2.79	3.5	0.003	0.71	0.0	0.04	16.22	0.00	1.862	8.14	2.29	3.0	97.0	0.0	0.62	0.73	0.80	0.81	2.18	15838	1981	9	0	7	0	0	logfile
✘	9CEV	45520	2024-11-17	2024-06-27	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14047	600	6	131	3	3	6353	logfile
✘	9CEV	45520	2025-05-15	2024-06-27	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14047	600	6	131	3	3	6353	logfile
✘	9CEV	45520	2025-01-19	2024-06-27	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14047	600	6	131	3	3	6353	logfile
✘	9CEV	45520	2024-10-13	2024-06-27	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14047	600	6	131	3	3	6353	logfile
✘	9CEV	45520	2024-09-26	2024-06-27	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14047	600	6	131	3	3	6353	logfile
✔	9iKK	60657	2025-05-26	2024-06-27	3.51	3.86	3.59	3.9	0.003	0.70	0.0	0.04	15.43	0.00	2.199	12.01	0.52	5.2	94.8	0.0	-1.86	0.66	0.80	2.25	3.8	0.004	0.70	0.0	0.04	16.31	0.00	2.400	9.20	3.50	7.4	92.6	0.0	-2.38	1.67	0.67	0.83	2.04	28480	3792	16	0	0	0	0	logfile
✘	9CEV	45520	2025-06-12	2024-06-27	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14047	600	6	131	3	3	6353	logfile
✔	9iKK	60657	2025-06-24	2024-06-27	3.51	3.86	3.59	3.9	0.003	0.70	0.0	0.04	15.43	0.00	2.199	12.01	0.52	5.2	94.8	0.0	-1.86	0.66	0.80	2.25	3.8	0.003	0.69	0.0	0.04	16.26	0.00	2.419	9.42	3.21	7.4	92.6	0.0	-2.54	1.67	0.67	0.83	2.03	28480	3792	16	0	0	0	0	logfile
✘	9CEV	45520	2024-12-30	2024-06-27	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14047	600	6	131	3	3	6353	logfile
✔	9iKC	60655	2025-05-15	2024-06-27	1.9	2.03	1.95	2.0	0.002	0.47	0.0	0.05	15.82	0.00	2.221	3.12	0.50	2.3	97.7	0.0	0.18	0.75	0.89	6.25	2.0	0.005	0.70	0.0	0.05	15.87	0.00	2.534	2.95	1.22	2.7	97.3	0.0	-0.17	1.14	0.75	0.89	6.57	12555	1587	6	0	0	150	0	logfile
✔	9iKC	60655	2024-11-17	2024-06-27	1.9	2.03	1.95	2.0	0.002	0.47	0.0	0.05	15.82	0.00	2.221	3.12	0.50	2.3	97.7	0.0	0.18	0.75	0.89	6.25	2.0	0.006	0.74	0.0	0.05	15.95	0.01	2.523	2.99	1.00	2.8	97.2	0.0	-0.22	1.14	0.75	0.89	6.57	12555	1587	6	0	0	150	0	logfile
✔	9iKC	60655	2024-10-12	2024-06-27	1.9	2.03	1.95	2.0	0.002	0.47	0.0	0.05	15.82	0.00	2.221	3.12	0.50	2.3	97.7	0.0	0.18	0.75	0.89	6.25	2.0	0.006	0.74	0.0	0.05	15.95	0.01	2.523	2.99	1.00	2.8	97.2	0.0	-0.22	1.14	0.75	0.89	6.57	12555	1587	6	0	0	150	0	logfile
✔	9iKC	60655	2024-09-26	2024-06-27	1.9	2.03	1.95	2.0	0.002	0.47	0.0	0.05	15.82	0.00	2.221	3.12	0.50	2.3	97.7	0.0	0.18	0.75	0.89	6.25	2.0	0.006	0.74	0.0	0.05	15.95	0.01	2.523	2.99	1.00	2.8	97.2	0.0	-0.22	1.14	0.75	0.89	6.57	12555	1587	6	0	0	150	0	logfile

• ← previous
• Page 139 of 5208
• next →