Table showing results for February 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7XUG	33468	2024-02-19	2022-05-18	3.57	3.53	—	3.6	0.009	0.87	0.0	0.05	16.50	0.01	1.938	6.66	0.11	8.9	91.0	0.1	-2.20	0.77	0.82	2.48	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26026	3172	9	60	3	0	0	logfile
✘	8CV0	27004	2024-02-20	2022-05-17	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27791	1850	4	0	2	0	13711	logfile
✘	8CUZ	27003	2024-02-20	2022-05-17	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27791	1850	4	0	2	0	13711	logfile
✘	7XT8	33442	2024-02-17	2022-05-16	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16812	1055	5	0	8	0	8287	logfile
✘	7XT9	33443	2024-02-16	2022-05-16	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14875	927	4	0	7	0	7351	logfile
✘	7XTA	33444	2024-02-17	2022-05-16	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17478	1115	5	0	1	0	8707	logfile
✘	7XTB	33445	2024-02-13	2022-05-16	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8101	1037	5	0	1	0	0	logfile
✘	7XSU	33435	2024-02-14	2022-05-15	3.4	3.68	3.45	3.7	0.011	1.61	9.0	0.11	19.27	0.01	1.440	12.45	5.06	5.5	94.1	0.4	1.66	0.55	0.75	2.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8969	1152	3	0	13	0	0	logfile
✘	7XSo	33429	2024-02-15	2022-05-15	3.01	2.21	2.88	2.1	0.009	1.02	4.0	0.07	18.96	0.01	2.157	4.29	3.99	6.0	94.0	0.1	-2.97	0.80	0.81	3.02	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10971	1271	3	35	4	0	0	logfile
✘	8CTK	26993	2024-02-13	2022-05-15	3.52	3.87	3.55	3.9	0.003	0.69	0.0	0.05	14.37	0.00	2.347	4.69	0.00	3.8	96.2	0.0	-1.07	0.54	0.70	0.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3042	376	2	0	0	0	0	logfile
✘	8CSW	26973	2024-02-13	2022-05-13	2.5	2.22	2.46	2.3	0.007	0.86	0.0	0.06	14.46	0.01	2.219	5.03	2.33	1.2	98.8	0.0	0.83	0.64	0.88	6.02	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5332	657	1	0	0	165	0	logfile
✘	7UZE	26886	2024-02-16	2022-05-09	2.4	2.27	2.42	2.3	0.003	0.58	0.0	0.04	14.97	0.00	2.040	3.56	0.68	3.0	96.6	0.4	1.69	0.66	0.88	6.32	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14969	988	12	0	4	113	7392	logfile
✘	7ZTA	14956	2024-02-27	2022-05-09	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7UY7	26866	2024-02-16	2022-05-06	4.2	4.18	4.04	3.2	0.002	0.56	1.0	0.04	15.12	0.00	2.203	13.96	0.18	3.8	96.2	0.0	-0.53	0.73	0.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15161	1808	7	10	1	0	0	logfile
✘	7ZRZ	14923	2024-02-13	2022-05-05	3.09	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7ZRi	14915	2024-02-15	2022-05-04	3.5	3.62	3.50	3.6	0.006	0.92	0.0	0.05	16.16	0.01	2.196	7.56	0.00	4.6	95.4	0.0	-1.22	0.70	0.82	1.47	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11014	1450	6	0	9	0	0	logfile
✘	7UVX	26819	2024-02-19	2022-05-02	2.35	2.56	—	2.4	0.005	0.61	0.0	0.04	23.01	0.02	2.144	4.47	2.57	2.3	97.5	0.2	0.69	0.91	0.91	3.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	136470	5510	53	4358	2	0	0	logfile
✘	7XoL	33351	2024-02-13	2022-05-01	3.26	4.02	3.37	3.4	0.002	0.49	0.0	0.04	13.50	0.00	2.224	10.95	0.00	0.5	99.5	0.0	2.40	0.89	0.88	1.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	53970	7336	14	0	0	0	0	logfile
✘	7ZQC	14870	2024-02-22	2022-04-29	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	82030	4165	39	0	351	621	31531	logfile
✘	7ZQ9	14867	2024-02-14	2022-04-29	2.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	92130	4713	47	0	397	88	35670	logfile

• ← previous
• Page 15 of 46
• next →