Table showing results for February 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7ZQ9	14867	2024-02-14	2022-04-29	2.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	92130	4713	47	0	397	88	35670	logfile
✘	7ZPo	14859	2024-02-16	2022-04-28	3.24	2.81	3.17	3.1	0.004	0.73	0.0	0.05	16.16	0.00	2.053	10.37	0.00	1.3	98.7	0.0	1.71	0.65	0.82	2.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15102	1932	20	0	16	0	0	logfile
✘	7XMV	33306	2024-02-16	2022-04-27	2.6	2.75	2.70	2.8	0.015	0.96	0.0	0.05	15.36	0.04	1.853	5.34	1.18	3.6	96.4	0.0	-0.87	0.72	0.86	4.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15228	1842	18	0	30	810	0	logfile
✘	7URC	26708	2024-02-13	2022-04-21	3.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5561	658	4	0	12	0	0	logfile
✘	7ZNK	14804	2024-02-20	2022-04-21	3.9	6.01	—	7.4	0.006	0.88	2.0	0.05	11.88	0.01	1.707	9.96	5.83	6.4	93.3	0.3	-2.12	0.73	0.46	0.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	88261	11599	32	6	0	0	0	logfile
✘	7ZNL	14808	2024-02-20	2022-04-21	3.45	3.67	3.55	3.4	0.005	0.78	0.0	0.04	11.78	0.01	2.171	7.60	6.04	6.6	93.1	0.3	-2.22	0.37	0.21	0.51	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	84821	11173	28	0	0	0	0	logfile
✘	7XL3	33271	2024-02-19	2022-04-21	3.13	3.20	—	3.2	0.002	0.39	0.0	0.04	12.03	0.00	2.263	4.77	1.08	2.9	97.1	0.0	-4.73	0.73	0.79	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25700	3480	8	0	3	0	0	logfile
✘	7XL4	33272	2024-02-19	2022-04-21	3.86	3.92	—	3.8	0.001	0.36	0.0	0.04	9.42	0.00	2.274	4.13	0.00	1.4	98.6	0.0	-4.82	0.78	0.75	1.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24560	3479	8	0	3	0	0	logfile
✘	7XJi	33228	2024-02-13	2022-04-18	3.9	3.60	3.70	3.9	0.003	0.60	0.0	0.04	13.92	0.00	2.165	9.02	0.00	4.3	95.7	0.0	-0.25	0.61	0.78	2.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7851	1027	6	0	1	0	0	logfile
✘	7UPi	26667	2024-02-13	2022-04-15	2.89	3.71	2.90	3.2	0.002	0.55	0.0	0.04	9.09	0.00	1.843	2.56	0.00	1.9	98.1	0.0	-0.12	0.91	0.87	3.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7775	972	5	0	5	0	0	logfile
✘	7XJ3	33218	2024-02-17	2022-04-14	3.54	3.75	3.55	3.7	0.019	1.03	0.0	0.04	16.43	0.01	2.242	12.56	6.79	8.8	91.2	0.0	-3.52	0.69	0.84	1.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18493	2428	8	0	14	0	0	logfile
✘	7UoP	26652	2024-02-16	2022-04-13	2.8	3.24	2.81	3.1	0.004	0.59	0.0	0.05	12.28	0.00	2.126	2.36	1.02	2.4	97.6	0.0	0.45	0.81	0.83	3.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15702	2010	12	0	12	0	0	logfile
✘	7XiD	33203	2024-02-22	2022-04-12	3.3	3.75	3.57	3.6	0.008	1.04	2.0	0.08	12.61	0.01	1.822	9.42	1.12	6.0	92.4	1.6	-2.95	0.65	0.62	1.85	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34256	4153	33	0	91	0	0	logfile
✘	7UNR	26630	2024-02-27	2022-04-11	2.9	3.18	2.93	3.1	0.005	0.64	2.0	0.04	22.70	0.02	1.879	6.56	0.26	7.2	92.4	0.4	-1.63	0.79	0.88	3.11	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	149327	6502	82	4606	632	200	0	logfile
✘	7UND	26621	2024-02-18	2022-04-10	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	129454	8269	40	269	10	0	61541	logfile
✘	7UNC	26620	2024-02-13	2022-04-10	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	105726	7924	38	311	9	0	48096	logfile
✘	7UMH	26601	2024-02-21	2022-04-07	2.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	140516	12747	124	0	798	461	0	logfile
✘	7XGR	33187	2024-02-13	2022-04-06	2.6	3.38	2.47	3.2	0.004	0.71	0.0	0.04	18.88	0.00	2.259	8.70	2.17	6.3	93.7	0.0	-0.28	0.52	0.75	2.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4340	546	1	0	0	0	0	logfile
✘	7ZGK	14708	2024-02-15	2022-04-03	3.59	4.63	3.57	3.7	0.002	0.45	0.0	0.04	13.81	0.00	0.454	5.10	0.46	2.2	97.6	0.2	1.65	0.73	0.55	1.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13639	1723	3	0	0	0	0	logfile
✘	7Uii	26546	2024-02-18	2022-03-29	2.6	2.91	2.65	2.9	0.003	0.61	0.0	0.05	13.58	0.00	2.234	5.76	0.00	5.1	94.9	0.0	-0.77	0.60	0.87	4.85	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	130944	16926	93	0	186	186	0	logfile

• ← previous
• Page 16 of 46
• next →