Table showing results for April 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	8iE3	35375	2024-04-16	2023-02-15	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	145205	7863	48	3795	0	0	0	logfile
✘	8iES	35392	2024-04-06	2023-02-15	3.73	4.01	3.68	4.0	0.003	1.16	0.0	0.04	13.70	0.00	2.268	5.19	0.00	6.0	94.0	0.0	-3.84	0.60	0.66	0.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7965	1026	2	0	3	0	0	logfile
✘	8G5F	29741	2024-04-14	2023-02-13	2.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30938	1888	18	0	29	0	15176	logfile
✘	8G5G	29742	2024-04-09	2023-02-13	2.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15860	1887	19	0	41	0	0	logfile
✘	8G5H	29743	2024-04-09	2023-02-13	2.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15875	1887	19	0	42	0	0	logfile
✘	8G4N	29727	2024-04-10	2023-02-10	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18308	2120	21	0	82	0	0	logfile
✘	8G4o	29728	2024-04-09	2023-02-10	3.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17353	2094	20	0	39	0	0	logfile
✘	8G4X	29733	2024-04-14	2023-02-10	2.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31102	1895	19	0	38	0	15204	logfile
✘	8iBZ	35350	2024-04-07	2023-02-10	3.04	3.25	3.07	3.1	0.003	0.60	0.0	0.04	23.46	0.00	2.190	9.49	0.29	4.3	95.6	0.1	0.68	0.73	0.74	1.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10273	817	3	180	1	0	0	logfile
✘	8CiN	16680	2024-04-15	2023-02-10	2.7	3.46	2.86	3.2	0.004	0.52	0.0	0.04	9.97	0.00	2.238	4.66	0.70	3.6	96.4	0.0	0.29	0.84	0.87	4.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35175	4479	24	0	51	0	0	logfile
✘	8CGV	16652	2024-04-13	2023-02-06	1.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	87899	2819	67	2743	307	6570	0	logfile
✘	8G31	29687	2024-04-16	2023-02-06	3.2	2.13	—	3.3	0.006	0.95	1.0	0.05	24.19	0.01	2.203	5.22	0.76	6.2	93.8	0.1	-2.51	0.49	0.38	0.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	144258	5922	52	4559	0	0	0	logfile
✘	8i9G	35270	2024-04-06	2023-02-06	3.2	3.67	3.09	3.6	0.005	0.67	0.0	0.05	16.41	0.00	2.213	4.97	4.97	6.6	93.4	0.0	-3.28	0.72	0.83	2.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6507	778	9	0	13	0	0	logfile
✘	8G34	29688	2024-04-16	2023-02-06	3.2	2.16	—	3.3	0.008	1.01	3.0	0.06	24.42	0.01	2.065	4.66	0.72	4.6	95.3	0.1	-1.60	0.52	0.41	0.11	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	144256	5922	52	4559	0	0	0	logfile
✘	8CGU	16651	2024-04-15	2023-02-06	1.89	1.60	1.82	1.8	0.009	1.59	1.0	0.11	22.08	0.02	1.895	0.38	0.38	2.4	97.6	0.0	-0.61	0.60	0.81	6.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35196	1266	31	1078	87	1871	0	logfile
✘	8CGi	16644	2024-04-09	2023-02-04	1.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17553	841	20	460	43	948	0	logfile
✘	8CEN	16610	2024-04-15	2023-02-02	3.0	2.82	2.90	2.6	0.004	0.80	1.0	0.05	14.49	0.01	2.160	5.96	0.05	2.9	97.1	0.0	-0.65	0.64	0.53	1.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	101943	12311	58	146	19	0	0	logfile
✘	8G1E	29668	2024-04-14	2023-02-02	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32649	4148	12	0	18	90	0	logfile
✘	8G1F	29669	2024-04-14	2023-02-02	2.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32911	4148	12	0	22	253	0	logfile
✘	8G1S	29676	2024-04-12	2023-02-02	3.7	4.04	3.83	3.9	0.003	0.58	0.0	0.04	16.07	0.00	2.004	17.34	1.07	8.3	91.6	0.1	-1.91	0.80	0.81	1.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26788	3172	9	95	1	0	0	logfile

• ← previous
• Page 10 of 75
• next →