Table showing results for May 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7WV5	32846	2025-05-15	2022-02-09	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12958	1318	16	46	80	0	0	logfile
✘	7TW1	26147	2025-05-23	2022-02-06	4.6	3.99	—	3.7	0.003	0.74	0.0	0.05	13.82	0.00	2.117	7.55	0.08	2.5	97.5	0.0	-0.20	0.75	0.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23625	2993	4	0	0	0	0	logfile
✘	7R11	14227	2025-05-10	2022-02-02	3.5	3.66	3.48	3.7	0.004	0.56	0.0	0.05	11.82	0.00	2.261	4.32	0.54	3.4	96.6	0.0	0.15	0.69	0.75	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6870	837	4	0	8	0	0	logfile
✘	7R0C	14221	2025-05-10	2022-02-01	4.73	5.24	5.07	5.1	0.005	0.91	1.0	0.05	13.19	0.01	2.100	26.54	0.14	6.1	93.9	0.0	-0.89	0.64	0.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6816	875	5	0	1	0	0	logfile
✘	7TT1	26107	2025-05-20	2022-01-31	4.3	4.56	—	4.4	0.004	0.82	0.0	0.05	10.41	0.00	1.973	3.78	0.00	1.3	98.7	0.0	0.92	0.72	0.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20398	1329	6	0	0	0	10005	logfile
✘	7WRi	32727	2025-05-11	2022-01-26	3.03	3.18	—	3.2	0.004	0.58	1.0	0.04	15.54	0.00	2.099	6.76	2.03	6.0	94.0	0.0	-4.19	0.73	0.80	2.23	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6431	790	4	0	2	0	0	logfile
✘	7WPE	32684	2025-05-29	2022-01-23	2.69	2.24	—	1.9	0.004	0.69	3.0	0.08	13.02	0.00	1.889	4.63	0.12	3.2	96.8	0.0	0.32	0.73	0.76	3.30	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32038	4187	14	0	40	0	0	logfile
✘	7WoN	32652	2025-05-09	2022-01-22	3.9	4.07	—	4.0	0.006	0.98	0.0	0.06	16.81	0.01	2.035	5.41	0.28	9.8	90.2	0.0	-4.42	0.67	0.83	2.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3318	425	4	0	2	0	0	logfile
✘	7TNX	26022	2025-05-10	2022-01-22	3.54	3.76	—	3.8	0.011	1.08	0.0	0.06	15.46	0.00	2.247	6.37	0.17	7.7	92.2	0.2	-2.75	0.70	0.80	2.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5753	647	4	23	2	0	0	logfile
✘	7WoS	32657	2025-05-29	2022-01-22	3.91	3.20	—	3.1	0.003	0.53	1.0	0.04	9.08	0.01	2.210	8.37	5.30	7.0	92.9	0.1	-3.97	0.73	0.71	1.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31411	4034	10	0	21	0	0	logfile
✘	7TM0	25992	2025-05-26	2022-01-19	3.1	3.24	3.20	3.2	0.010	1.41	0.0	0.08	8.59	0.01	2.264	1.47	0.17	2.4	97.6	0.0	0.62	0.73	0.76	3.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27963	4401	19	0	52	0	0	logfile
✘	7TJT	25931	2025-05-22	2022-01-17	3.2	3.46	3.29	3.4	0.003	0.63	0.0	0.05	13.04	0.00	1.991	3.26	0.00	1.2	98.8	0.0	0.60	0.75	0.85	3.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23129	3099	11	0	7	0	0	logfile
✘	7TKT	25981	2025-05-15	2022-01-17	3.6	3.75	3.74	3.7	0.007	1.26	0.0	0.04	21.05	0.01	2.224	6.30	0.00	4.7	95.3	0.0	0.63	0.72	0.81	2.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13252	1560	8	0	56	0	0	logfile
✘	7WJN	32546	2025-05-15	2022-01-07	3.3	3.46	—	3.4	0.004	0.59	0.0	0.04	10.44	0.00	2.235	2.90	0.58	4.1	95.9	0.0	2.06	0.67	0.82	2.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13054	1616	4	0	4	0	0	logfile
✘	7TFo	25878	2025-05-25	2022-01-06	4.1	3.83	—	3.8	0.007	0.83	0.0	0.05	14.99	0.01	2.118	16.68	0.21	8.9	91.1	0.0	-1.50	0.74	0.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17774	2283	20	0	21	0	0	logfile
✘	7TES	25851	2025-05-29	2022-01-05	4.7	8.44	4.80	4.3	0.004	0.92	0.0	0.05	14.89	0.01	2.261	9.08	1.27	8.9	90.9	0.3	-4.01	0.82	0.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31306	3986	8	0	0	0	0	logfile
✘	7Wi6	32526	2025-05-13	2022-01-03	3.71	4.33	—	4.2	0.009	1.04	0.0	0.06	15.69	0.01	2.290	5.63	1.54	14.5	85.5	0.0	-6.21	0.76	0.78	1.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9696	1446	4	0	4	0	0	logfile
✘	7Qo1	14080	2025-05-16	2021-12-23	4.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14179	1694	9	62	1	0	0	logfile
✘	7QNC	14074	2025-05-17	2021-12-20	2.9	3.35	—	3.1	0.003	0.60	0.0	0.05	12.80	0.01	2.276	3.01	0.48	1.7	98.3	0.0	0.92	0.79	0.88	4.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15861	1881	19	0	39	0	0	logfile
✘	7T92	25750	2025-05-21	2021-12-17	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18777	1159	8	0	25	0	9156	logfile

• ← previous
• Page 25 of 38
• next →