Table showing results for June 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7UL5	26592	2025-06-04	2022-04-03	3.1	3.32	3.08	3.3	0.004	0.64	0.0	0.04	11.76	0.01	2.404	3.68	0.00	3.1	96.9	0.0	-1.07	0.64	0.85	3.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	2773	371	2	0	0	0	0	logfile
✘	7XG2	33183	2025-06-17	2022-04-02	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19904	2282	12	118	1	0	0	logfile
✘	7XG4	33185	2025-06-24	2022-04-02	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24769	2876	13	134	1	0	0	logfile
✘	7XG0	33181	2025-06-17	2022-04-02	2.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19893	2280	12	118	1	0	0	logfile
✘	7XG3	33184	2025-06-24	2022-04-02	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24368	2839	13	128	1	0	0	logfile
✘	7XFJ	33174	2025-06-11	2022-04-01	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12805	943	11	262	0	0	0	logfile
✘	7XFH	33172	2025-06-11	2022-04-01	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12969	957	11	264	0	0	0	logfile
✘	7ZFW	14704	2025-06-11	2022-04-01	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13188	0	1	615	0	0	0	logfile
✘	7XFM	33176	2025-06-11	2022-04-01	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12914	946	11	266	0	0	0	logfile
✘	7ZCE	14628	2025-06-25	2022-03-28	3.5	3.69	3.48	3.6	0.005	0.72	0.0	0.05	15.54	0.00	2.080	8.45	0.03	8.6	91.4	0.0	-1.09	0.77	0.84	2.13	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29502	3706	21	0	51	0	0	logfile
✘	7UHC	26512	2025-06-20	2022-03-26	3.1	3.68	3.17	3.5	0.011	1.34	0.0	0.08	9.94	0.00	2.551	0.55	0.31	2.6	97.3	0.1	0.29	0.79	0.80	4.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23136	3192	21	0	60	0	0	logfile
✘	7UGV	26497	2025-06-05	2022-03-25	2.94	3.59	2.93	3.4	0.003	0.57	0.0	0.04	9.13	0.00	2.111	3.29	0.00	0.7	99.3	0.0	2.34	0.50	0.85	4.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3107	418	2	0	3	0	0	logfile
✘	7XC6	33113	2025-06-14	2022-03-23	2.79	2.93	2.78	3.0	0.006	0.72	0.0	0.05	17.67	0.00	2.003	7.10	7.75	7.1	92.9	0.0	-2.40	0.63	0.67	0.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16176	2026	5	0	0	0	0	logfile
✘	7Z7H	14532	2025-06-14	2022-03-15	3.8	4.22	3.93	4.0	0.013	1.25	0.0	0.06	14.27	0.01	1.777	11.90	0.00	3.5	96.5	0.0	-0.19	0.75	0.77	1.93	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16111	2036	12	0	12	0	0	logfile
✘	7UB5	26435	2025-06-21	2022-03-14	3.35	3.64	3.33	3.5	0.004	0.69	0.0	0.05	13.35	0.01	2.287	3.61	0.00	3.5	96.5	0.0	-0.85	0.85	0.87	3.11	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24923	3104	16	0	47	0	0	logfile
✘	7X7N	33042	2025-06-23	2022-03-10	4.47	4.03	4.49	4.2	0.013	1.11	0.0	0.06	15.67	0.01	1.956	29.11	0.52	19.6	80.3	0.1	-5.63	0.73	0.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26493	3314	18	0	45	0	0	logfile
✘	7X6o	33024	2025-06-18	2022-03-07	3.5	2.65	—	3.8	0.002	0.49	0.0	0.04	8.09	0.00	2.283	3.17	1.82	2.0	98.0	0.0	-3.07	0.60	0.53	0.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21609	2787	12	0	0	0	0	logfile
✘	7Z37	14472	2025-06-13	2022-03-01	3.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-0.30	—	—	2.17	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-0.05	—	—	—	2.25	14256	1740	6	0	2	0	0	logfile
✘	7Z24	14457	2025-06-06	2022-02-25	3.32	2.74	3.27	3.3	0.007	1.05	2.0	0.08	18.10	0.01	2.387	7.61	2.07	2.8	97.2	0.0	-0.18	0.57	0.71	2.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8303	929	4	36	1	0	0	logfile
✘	7Z12	14438	2025-06-16	2022-02-24	3.0	3.83	—	3.4	0.007	1.03	1.0	0.06	15.28	0.01	0.865	31.24	1.37	15.0	83.9	1.1	-3.04	0.84	0.81	1.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18352	2286	3	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 24 of 40
• next →