Table showing results for June 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7Z12	14438	2025-06-16	2022-02-24	3.0	3.83	—	3.4	0.007	1.03	1.0	0.06	15.28	0.01	0.865	31.24	1.37	15.0	83.9	1.1	-3.04	0.84	0.81	1.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18352	2286	3	0	0	0	0	logfile
✘	7X07	32919	2025-06-09	2022-02-21	3.78	4.03	—	4.0	0.013	1.66	0.0	0.08	15.38	0.01	2.145	8.39	1.97	8.1	91.2	0.7	-4.75	0.61	0.78	1.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10125	1266	3	0	1	0	0	logfile
✘	7U16	26279	2025-06-04	2022-02-19	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3456	405	6	0	12	0	0	logfile
✘	7WVF	32852	2025-06-12	2022-02-10	3.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14249	1546	5	46	46	0	0	logfile
✘	7WVJ	32853	2025-06-11	2022-02-10	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12488	1318	4	46	46	0	0	logfile
✘	7WVE	32851	2025-06-11	2022-02-10	3.11	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12498	1318	4	46	46	0	0	logfile
✘	7WV3	32844	2025-06-21	2022-02-09	2.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25386	2672	18	80	124	0	0	logfile
✘	7WV4	32845	2025-06-21	2022-02-09	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24490	2636	6	80	80	0	0	logfile
✘	7TXV	26161	2025-06-23	2022-02-09	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27648	3528	16	0	28	0	0	logfile
✘	7WV5	32846	2025-06-11	2022-02-09	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12958	1318	16	46	80	0	0	logfile
✘	7WSC	32753	2025-06-04	2022-01-28	3.78	4.01	—	4.0	0.013	1.68	5.0	0.10	15.34	0.01	1.600	41.09	4.99	14.7	81.6	3.6	-4.09	0.65	0.78	2.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3369	422	4	0	2	0	0	logfile
✘	7WS3	32742	2025-06-26	2022-01-28	3.6	4.00	—	3.8	0.004	0.67	0.0	0.05	13.16	0.00	2.202	7.83	0.03	3.2	96.8	0.0	-0.92	0.80	0.76	2.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30215	3811	27	0	54	0	0	logfile
✘	7WS5	32744	2025-06-26	2022-01-28	3.7	4.15	—	3.9	0.003	0.65	0.0	0.05	13.30	0.00	2.168	9.14	0.09	2.5	97.5	0.1	-0.07	0.83	0.84	1.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30228	3800	26	0	38	0	0	logfile
✘	7WS8	32750	2025-06-29	2022-01-28	3.0	3.47	—	3.2	0.004	0.62	0.0	0.05	13.67	0.00	2.136	8.35	0.05	2.7	97.3	0.0	0.05	0.78	0.82	2.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34684	4286	24	0	48	0	0	logfile
✘	7TQU	26072	2025-06-18	2022-01-27	3.8	3.89	3.52	3.8	0.021	1.81	0.0	0.10	9.74	0.01	2.375	0.92	0.00	2.1	97.9	0.0	0.71	0.38	0.84	3.42	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20891	2544	17	0	217	0	0	logfile
✘	7WPC	32682	2025-06-06	2022-01-23	2.57	2.17	—	2.0	0.004	0.72	0.0	0.05	17.02	0.01	2.253	2.54	0.12	4.2	95.8	0.0	-4.19	0.69	0.72	2.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8057	980	6	0	9	0	0	logfile
✘	7TNM	26014	2025-06-17	2022-01-21	4.74	3.56	—	3.5	0.007	1.08	0.0	0.06	12.01	0.01	2.214	5.88	0.86	2.6	97.0	0.5	-1.48	0.68	0.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19448	2486	10	0	4	0	0	logfile
✘	7TMW	26003	2025-06-06	2022-01-20	3.2	2.40	3.16	3.2	0.003	0.70	0.0	0.05	13.22	0.01	2.193	9.31	0.00	2.6	97.4	0.0	-0.28	0.71	0.64	1.01	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7320	930	4	0	0	0	0	logfile
✘	7TM0	25992	2025-06-24	2022-01-19	3.1	3.24	3.20	3.2	0.010	1.41	0.0	0.08	8.59	0.01	2.264	1.47	0.17	2.4	97.6	0.0	0.62	0.73	0.76	3.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27963	4401	19	0	52	0	0	logfile
✘	7THE	25893	2025-06-05	2022-01-10	3.87	4.06	3.94	4.0	0.013	1.88	0.0	0.11	13.76	0.02	2.548	0.15	0.00	8.2	91.8	0.0	-2.01	0.67	0.75	3.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3305	423	4	0	1	0	0	logfile

• ← previous
• Page 25 of 40
• next →