Table showing results for June 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7TES	25851	2025-06-27	2022-01-05	4.7	8.44	4.80	4.3	0.004	0.92	0.0	0.05	14.89	0.01	2.261	9.08	1.27	8.9	90.9	0.3	-4.01	0.82	0.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31306	3986	8	0	0	0	0	logfile
✘	7WHZ	32516	2025-06-05	2022-01-01	3.42	3.64	—	3.7	0.007	0.94	0.0	0.06	14.21	0.01	2.276	5.93	0.40	8.4	91.6	0.0	-4.20	0.67	0.81	2.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6810	887	8	0	1	0	0	logfile
✘	7Qo1	14080	2025-06-12	2021-12-23	4.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14179	1694	9	62	1	0	0	logfile
✘	7T92	25750	2025-06-18	2021-12-17	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18777	1159	8	0	25	0	9156	logfile
✘	7WB0	32391	2025-06-09	2021-12-15	3.2	3.52	—	3.3	0.003	0.58	0.0	0.03	21.37	0.00	2.136	7.20	0.00	3.3	96.6	0.1	0.54	0.70	0.73	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10096	797	4	175	0	0	0	logfile
✘	7T6P	25723	2025-06-17	2021-12-14	2.8	3.33	—	3.3	0.005	1.13	0.0	0.06	14.54	0.01	2.310	3.72	0.00	4.0	96.0	0.0	-3.37	0.59	0.76	2.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19412	2424	4	0	0	0	0	logfile
✘	7T6X	25730	2025-06-08	2021-12-14	3.83	4.14	3.83	4.0	0.022	2.01	0.0	0.13	15.96	0.02	1.505	3.89	0.00	3.8	96.1	0.1	-0.16	0.77	0.82	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9217	1140	19	0	37	0	0	logfile
✘	7T02	25577	2025-06-13	2021-11-29	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14359	1752	4	25	5	0	0	logfile
✘	7QDo	13922	2025-06-04	2021-11-27	3.6	3.83	3.27	3.7	0.005	0.82	0.0	0.05	11.62	0.00	2.038	7.51	0.00	10.0	90.0	0.0	-0.82	0.71	0.74	3.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3304	424	2	0	0	0	0	logfile
✘	7SXT	25505	2025-06-22	2021-11-24	2.31	3.14	—	2.6	0.005	0.81	0.0	0.05	12.82	0.01	2.287	2.67	0.00	2.8	97.2	0.0	-0.67	0.84	0.83	2.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25248	3120	24	0	60	0	0	logfile
✘	7SWL	25474	2025-06-20	2021-11-20	2.88	3.12	—	3.1	0.003	0.51	0.0	0.04	11.23	0.00	1.953	5.64	0.95	3.0	96.9	0.1	0.12	0.71	0.82	3.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23907	3070	12	0	19	0	0	logfile
✘	7SVU	25453	2025-06-23	2021-11-19	3.5	2.79	3.39	3.4	0.023	1.92	12.0	0.11	15.10	0.01	0.871	14.62	0.42	2.3	97.6	0.2	-0.41	0.73	0.74	1.30	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	28015	3283	35	56	22	0	0	logfile
✘	7SVV	25454	2025-06-19	2021-11-19	3.54	3.06	3.43	3.5	0.024	1.88	10.0	0.10	16.78	0.01	1.320	4.73	0.00	1.4	98.6	0.0	-0.21	0.56	0.75	2.17	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23046	2710	32	38	20	0	0	logfile
✘	7VYH	32205	2025-06-24	2021-11-14	2.9	3.02	—	3.0	0.011	0.96	0.0	0.05	14.77	0.01	2.198	8.58	0.00	3.6	96.3	0.1	0.11	0.75	0.86	3.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27933	3488	27	0	16	0	0	logfile
✘	7VX1	32167	2025-06-22	2021-11-12	3.5	2.44	—	3.4	0.004	0.51	1.0	0.04	7.46	0.00	1.753	8.22	0.00	4.3	95.7	0.1	-2.11	0.63	0.59	1.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25362	3237	3	0	0	0	0	logfile
✘	7SPC	24770	2025-06-26	2021-11-02	2.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-0.98	—	—	1.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	0.50	—	—	—	2.60	29716	3978	34	0	0	0	0	logfile
✘	7SMP	25204	2025-06-23	2021-10-26	3.28	3.55	3.42	3.5	0.004	0.76	3.0	0.04	14.91	0.01	1.944	6.99	0.00	4.9	95.1	0.0	0.04	0.57	0.74	2.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26477	1668	4	0	5	0	13353	logfile
✘	7VRV	32107	2025-06-22	2021-10-25	4.2	4.29	—	4.2	0.004	0.71	0.0	0.05	13.40	0.00	2.071	14.14	0.00	6.7	93.3	0.0	-2.00	0.76	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26151	3257	19	0	57	0	0	logfile
✘	7SGZ	25121	2025-06-18	2021-10-07	3.17	3.52	—	3.5	0.002	0.53	0.0	0.04	15.38	0.00	2.128	7.19	0.04	5.5	94.5	0.0	0.10	0.68	0.74	1.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21055	2558	15	23	10	0	0	logfile
✘	7SCJ	25036	2025-06-08	2021-09-28	3.4	2.31	2.97	2.0	0.004	0.63	0.0	0.05	14.79	0.01	2.200	9.22	0.00	5.7	94.3	0.0	-0.25	0.75	0.72	3.17	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9336	1131	6	2	7	0	0	logfile

• ← previous
• Page 26 of 40
• next →