Table showing results for August 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7Xi9	33200	2025-08-22	2022-04-12	2.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7620	869	8	24	5	232	0	logfile
✘	7ZJE	14746	2025-08-24	2022-04-10	3.12	3.70	3.27	3.6	0.002	0.57	0.0	0.04	11.99	0.00	2.254	7.29	0.19	8.3	91.1	0.5	0.64	0.66	0.80	1.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19284	2380	4	0	0	0	0	logfile
✘	7XGY	33189	2025-08-22	2022-04-07	3.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4555	574	8	0	4	0	0	logfile
✘	7XH8	33191	2025-08-22	2022-04-07	2.99	3.75	3.31	3.6	0.014	1.81	0.0	0.09	13.61	0.03	2.472	0.80	0.88	3.5	95.5	1.0	-1.88	0.61	0.58	1.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3161	404	3	0	0	0	0	logfile
✘	7ZGX	14714	2025-08-24	2022-04-04	2.88	3.61	2.95	3.4	0.005	0.77	0.0	0.05	12.23	0.00	2.159	9.14	0.00	11.3	88.3	0.4	-3.11	0.71	0.86	4.42	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21351	2847	3	0	0	0	0	logfile
✘	7XG0	33181	2025-08-24	2022-04-02	2.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19893	2280	12	118	1	0	0	logfile
✘	7XG3	33184	2025-08-25	2022-04-02	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24368	2839	13	128	1	0	0	logfile
✘	7XG4	33185	2025-08-25	2022-04-02	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24769	2876	13	134	1	0	0	logfile
✘	7XG2	33183	2025-08-24	2022-04-02	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19904	2282	12	118	1	0	0	logfile
✘	7XFH	33172	2025-08-23	2022-04-01	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12969	957	11	264	0	0	0	logfile
✘	7XFM	33176	2025-08-23	2022-04-01	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12914	946	11	266	0	0	0	logfile
✘	7ZFW	14704	2025-08-23	2022-04-01	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13188	0	1	615	0	0	0	logfile
✘	7XFJ	33174	2025-08-23	2022-04-01	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12805	943	11	262	0	0	0	logfile
✘	7ZES	14692	2025-08-23	2022-03-31	3.1	3.32	3.11	3.4	0.007	0.64	0.0	0.04	13.69	0.01	1.966	5.90	0.00	2.3	97.7	0.0	0.35	0.75	0.82	3.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13538	1654	6	10	4	0	0	logfile
✘	7XEW	33161	2025-08-24	2022-03-31	2.59	3.02	2.86	3.0	0.003	0.70	0.0	0.04	13.28	0.01	2.210	10.97	1.10	5.5	94.0	0.5	0.26	0.75	0.85	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19988	2456	4	0	0	0	0	logfile
✘	7UJA	26562	2025-08-24	2022-03-30	3.7	3.48	3.69	3.8	0.003	0.67	0.0	0.04	15.09	0.00	2.114	7.70	0.13	5.6	94.4	0.0	-2.29	0.69	0.82	2.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20748	2694	21	0	3	0	0	logfile
✘	7ZDQ	14666	2025-08-22	2022-03-29	3.2	2.77	3.10	2.9	0.003	0.56	0.0	0.04	15.11	0.00	2.212	6.38	0.15	2.3	97.7	0.0	1.48	0.71	0.81	3.08	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6264	763	3	0	3	0	0	logfile
✘	7UiM	26549	2025-08-23	2022-03-29	3.1	4.12	3.82	3.6	0.005	0.87	0.0	0.04	24.93	0.01	1.903	9.02	0.00	3.7	96.3	0.0	-1.28	0.67	0.47	0.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14772	387	3	541	15	0	0	logfile
✘	7ZCW	14634	2025-08-27	2022-03-29	3.6	3.49	3.11	3.5	0.008	1.01	0.0	0.05	17.26	0.01	1.906	3.67	0.21	3.9	96.1	0.0	-1.14	0.68	0.79	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	44316	2839	14	0	12	0	21746	logfile
✘	7ZDK	14652	2025-08-23	2022-03-29	3.01	3.14	2.94	3.1	0.007	0.78	0.0	0.05	16.14	0.00	2.219	7.96	0.00	1.6	98.4	0.0	-1.50	0.76	0.89	3.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9089	1161	4	0	4	0	0	logfile

• ← previous
• Page 35 of 57
• next →