Table showing results for August 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7ZBW	14594	2025-08-23	2022-03-24	3.5	2.45	3.32	2.0	0.003	0.54	0.0	0.04	13.85	0.00	2.162	5.53	0.07	2.9	97.1	0.0	1.39	0.77	0.76	1.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14784	2014	5	0	0	0	0	logfile
✘	7UEB	26471	2025-08-26	2022-03-21	3.08	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	37570	4006	25	0	106	0	0	logfile
✘	7XAU	33099	2025-08-22	2022-03-19	2.97	3.19	3.02	3.2	0.011	1.19	0.0	0.06	14.13	0.01	2.187	7.06	1.17	8.1	91.9	0.0	-4.69	0.64	0.76	3.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8443	1141	7	0	2	0	0	logfile
✘	7XAV	33100	2025-08-22	2022-03-19	2.87	3.03	2.89	3.1	0.009	1.05	0.0	0.06	14.14	0.01	1.494	7.78	0.71	8.3	91.7	0.0	-4.66	0.63	0.77	2.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8410	1140	7	0	1	0	0	logfile
✘	7XAQ	33097	2025-08-24	2022-03-18	3.59	4.39	—	4.3	0.007	1.02	1.0	0.05	23.46	0.01	1.800	11.83	2.87	11.8	87.9	0.3	-4.12	0.78	0.53	0.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13396	1197	10	172	0	0	0	logfile
✘	7X96	33068	2025-08-22	2022-03-15	3.4	4.29	3.35	4.0	0.003	0.62	0.0	0.04	15.74	0.00	2.101	5.71	0.00	8.8	91.2	0.0	-1.35	0.74	0.82	3.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6586	427	4	0	6	0	3184	logfile
✘	7Z6Q	14528	2025-08-26	2022-03-14	2.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	36557	3956	28	0	91	10	0	logfile
✘	7U9G	26397	2025-08-23	2022-03-10	3.39	4.19	3.27	3.9	0.007	0.78	0.0	0.05	11.02	0.01	2.293	5.12	0.00	3.1	96.9	0.0	0.29	0.88	0.86	2.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14553	1860	12	0	9	0	0	logfile
✘	7Z5J	14522	2025-08-27	2022-03-09	2.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25576	3234	24	0	54	0	0	logfile
✘	7X6U	33027	2025-08-26	2022-03-08	4.5	4.59	4.67	4.5	0.009	1.33	0.0	0.05	13.23	0.01	0.507	29.59	0.00	10.1	89.3	0.6	-3.46	0.38	0.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	39324	5328	24	0	30	0	0	logfile
✘	7U66	26361	2025-08-27	2022-03-03	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26664	3348	24	0	12	0	0	logfile
✘	7Z37	14472	2025-08-23	2022-03-01	3.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-0.30	—	—	2.17	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	0.10	—	—	—	2.20	14256	1740	6	0	2	0	0	logfile
✘	7Z29	14458	2025-08-22	2022-02-26	3.38	3.22	3.39	3.4	0.005	0.84	2.0	0.06	17.03	0.01	2.193	7.56	1.96	3.0	96.9	0.1	-0.47	0.61	0.71	1.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8307	935	4	36	1	0	0	logfile
✘	7Z15	14441	2025-08-27	2022-02-24	1.93	2.40	1.99	2.3	0.013	1.01	9.0	0.06	15.88	0.01	1.723	3.87	0.83	1.6	98.4	0.0	1.32	0.83	0.86	6.01	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	46112	2888	32	0	16	1171	22357	logfile
✘	7U16	26279	2025-08-22	2022-02-19	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3456	405	6	0	12	0	0	logfile
✘	7YZ4	14387	2025-08-24	2022-02-18	3.84	3.32	4.14	3.2	0.004	0.78	0.0	0.05	11.95	0.01	2.253	1.46	0.92	3.6	96.4	0.0	-2.13	0.65	0.63	1.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19805	1234	1	0	0	0	9953	logfile
✘	7WVJ	32853	2025-08-23	2022-02-10	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12488	1318	4	46	46	0	0	logfile
✘	7WVF	32852	2025-08-23	2022-02-10	3.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14249	1546	5	46	46	0	0	logfile
✘	7WVE	32851	2025-08-23	2022-02-10	3.11	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12498	1318	4	46	46	0	0	logfile
✘	7WV5	32846	2025-08-23	2022-02-09	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12958	1318	16	46	80	0	0	logfile

• ← previous
• Page 36 of 57
• next →