Table showing results for August 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7TXV	26161	2025-08-25	2022-02-09	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27648	3528	16	0	28	0	0	logfile
✘	7WV4	32845	2025-08-25	2022-02-09	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24490	2636	6	80	80	0	0	logfile
✘	7WV3	32844	2025-08-25	2022-02-09	2.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25386	2672	18	80	124	0	0	logfile
✘	7TU8	26129	2025-08-26	2022-02-02	2.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20232	2604	12	0	24	0	0	logfile
✘	7R17	14233	2025-08-24	2022-02-02	3.7	4.04	3.82	3.9	0.004	0.54	0.0	0.04	12.98	0.01	2.221	5.15	0.50	3.1	96.9	0.0	0.37	0.83	0.83	2.01	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23626	2981	7	0	22	0	0	logfile
✘	7WSE	32755	2025-08-23	2022-01-29	2.93	3.45	—	3.4	0.002	0.45	0.0	0.04	10.17	0.00	2.193	4.86	1.01	1.8	98.2	0.0	-0.67	0.69	0.79	3.50	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6431	791	3	0	1	0	0	logfile
✘	7WSF	32756	2025-08-23	2022-01-29	2.87	3.08	—	3.1	0.003	0.44	0.0	0.04	11.23	0.00	2.016	6.14	3.87	2.7	97.3	0.0	-0.12	0.72	0.81	4.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7170	879	3	0	1	0	0	logfile
✘	7WSC	32753	2025-08-22	2022-01-28	3.78	4.01	—	4.0	0.013	1.68	5.0	0.10	15.34	0.01	1.600	41.09	4.99	14.7	81.6	3.6	-4.09	0.65	0.78	2.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3369	422	4	0	2	0	0	logfile
✘	7WR7	32717	2025-08-22	2022-01-26	3.1	3.81	—	3.7	0.004	0.61	0.0	0.04	10.28	0.00	2.309	10.38	3.29	9.1	90.9	0.0	-4.53	0.72	0.72	2.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3995	496	4	0	10	0	0	logfile
✘	7ToE	26030	2025-08-23	2022-01-24	3.0	3.29	—	3.3	0.003	0.59	0.0	0.04	14.04	0.00	2.201	8.90	0.12	3.9	96.0	0.1	-0.13	0.72	0.83	3.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15100	1868	4	0	0	0	0	logfile
✘	7WQ4	32699	2025-08-22	2022-01-24	2.6	2.77	—	2.9	0.007	0.61	0.0	0.05	8.52	0.00	1.399	6.75	0.45	0.8	99.2	0.0	-1.07	0.51	0.70	3.03	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8290	1048	7	0	2	0	0	logfile
✘	7WoQ	32655	2025-08-25	2022-01-22	3.47	2.83	—	3.2	0.003	0.57	0.0	0.05	9.33	0.02	2.216	9.29	5.15	7.8	91.9	0.3	-4.15	0.75	0.74	2.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26221	3328	7	0	28	0	0	logfile
✘	7TNM	26014	2025-08-24	2022-01-21	4.74	3.56	—	3.5	0.007	1.08	0.0	0.06	12.01	0.01	2.214	5.81	0.86	2.6	97.0	0.5	-1.48	0.68	0.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19448	2486	10	0	4	0	0	logfile
✘	7QV7	14169	2025-08-26	2022-01-19	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	41236	5276	32	0	58	0	0	logfile
✘	7TL1	25983	2025-08-25	2022-01-18	3.5	3.79	3.46	3.6	0.004	0.73	0.0	0.05	11.66	0.01	2.302	3.28	0.00	3.6	96.4	0.0	-0.64	0.85	0.83	2.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25109	3138	11	0	38	0	0	logfile
✘	7TJT	25931	2025-08-24	2022-01-17	3.2	3.46	3.29	3.4	0.003	0.63	0.0	0.05	13.04	0.00	1.991	3.26	0.00	1.2	98.8	0.0	0.60	0.75	0.85	3.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23129	3099	11	0	7	0	0	logfile
✘	7TJS	25930	2025-08-24	2022-01-17	3.2	3.47	3.27	3.4	0.003	0.60	0.0	0.05	12.99	0.00	1.901	1.77	0.00	1.5	98.5	0.0	0.55	0.78	0.85	3.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23539	3102	12	0	8	0	0	logfile
✘	7TJW	25934	2025-08-24	2022-01-17	4.0	3.71	4.04	3.8	0.003	0.64	0.0	0.05	13.06	0.00	1.855	2.42	0.00	2.2	97.8	0.0	0.19	0.61	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22500	3097	12	0	10	0	0	logfile
✘	7WK6	32560	2025-08-22	2022-01-08	3.67	2.86	—	3.8	0.008	1.07	1.0	0.07	15.40	0.01	2.328	5.81	0.57	4.7	94.9	0.4	-5.05	0.77	0.77	2.23	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6428	791	2	0	0	0	0	logfile
✘	7WK9	32563	2025-08-25	2022-01-08	3.48	3.16	—	3.7	0.005	0.79	0.0	0.05	8.28	0.01	2.342	3.06	0.36	3.9	95.9	0.2	-2.70	0.70	0.65	0.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29745	3805	7	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 37 of 57
• next →