Table showing results for August 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7TF6	25863	2025-08-26	2022-01-06	2.15	2.26	—	2.3	0.002	0.51	0.0	0.04	16.47	0.00	2.048	4.68	1.34	3.7	96.3	0.0	0.26	0.48	0.71	5.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	43272	5400	36	0	24	0	120	logfile
✘	7TFK	25875	2025-08-23	2022-01-06	3.25	3.36	—	3.3	0.003	0.65	0.0	0.04	16.01	0.01	2.092	10.12	0.13	3.2	96.8	0.0	0.18	0.69	0.63	1.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14363	1680	14	45	9	0	0	logfile
✘	7TES	25851	2025-08-25	2022-01-05	4.7	8.44	4.80	4.3	0.004	0.92	0.0	0.05	14.89	0.01	2.261	9.03	1.27	8.9	90.9	0.3	-4.01	0.82	0.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31306	3986	8	0	0	0	0	logfile
✘	7WiZ	32541	2025-08-26	2022-01-05	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35568	2228	10	0	8	0	17752	logfile
✘	7WiV	32537	2025-08-23	2022-01-05	2.88	3.16	—	3.0	0.008	1.02	4.0	0.06	14.50	0.01	2.209	8.44	0.68	9.4	90.2	0.4	-5.21	0.69	0.88	3.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8646	1147	3	0	1	0	0	logfile
✘	7TDo	25837	2025-08-24	2022-01-02	3.15	4.00	—	3.7	0.004	0.57	0.0	0.04	14.51	0.00	2.284	4.69	0.00	4.1	95.9	0.0	-1.16	0.73	0.68	1.65	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19572	2520	12	0	6	0	0	logfile
✘	7WHP	32507	2025-08-24	2021-12-31	3.7	3.28	—	3.3	0.004	0.62	0.0	0.04	15.13	0.01	2.209	8.40	0.00	2.9	97.0	0.0	-0.85	0.30	0.77	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17038	2114	4	0	6	0	0	logfile
✘	7WFE	32463	2025-08-26	2021-12-26	3.25	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35123	3216	30	0	205	0	0	logfile
✘	7WFD	32462	2025-08-26	2021-12-26	3.25	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35603	3231	30	0	211	0	0	logfile
✘	7Qo1	14080	2025-08-23	2021-12-23	4.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14179	1694	9	62	1	0	0	logfile
✘	7WED	32447	2025-08-22	2021-12-23	3.5	3.62	—	3.7	0.003	0.71	0.0	0.05	13.75	0.01	2.285	7.13	0.00	8.2	91.8	0.0	-1.64	0.57	0.77	2.25	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3358	431	3	0	0	0	0	logfile
✘	7TB4	25792	2025-08-25	2021-12-21	3.29	4.32	3.44	3.7	0.003	0.65	0.0	0.05	14.80	0.00	2.173	7.15	0.03	7.1	92.6	0.3	-1.22	0.86	0.78	2.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26897	3329	21	0	59	0	0	logfile
✘	7T92	25750	2025-08-24	2021-12-17	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18777	1159	8	0	25	0	9156	logfile
✘	7QiY	14003	2025-08-27	2021-12-16	2.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	44117	1730	33	491	41	225	19554	logfile
✘	7T6X	25730	2025-08-23	2021-12-14	3.83	4.14	3.83	4.0	0.022	2.01	0.0	0.13	15.96	0.02	1.505	3.89	0.00	3.8	96.1	0.1	-0.16	0.77	0.82	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9217	1140	19	0	37	0	0	logfile
✘	7W7F	32343	2025-08-23	2021-12-04	3.35	3.74	—	3.7	0.017	1.04	0.0	0.07	18.83	0.01	2.144	13.74	0.31	8.1	91.6	0.3	-1.42	0.42	0.74	1.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11987	1424	7	0	29	0	0	logfile
✘	7T02	25577	2025-08-23	2021-11-29	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14359	1752	4	25	5	0	0	logfile
✘	7W4A	32299	2025-08-23	2021-11-26	2.76	2.16	2.70	2.2	0.006	0.72	0.0	0.04	13.80	0.00	2.048	7.12	0.09	2.3	97.7	0.0	1.29	0.63	0.77	3.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9855	1245	5	0	7	12	0	logfile
✘	7SXV	25507	2025-08-25	2021-11-24	2.79	3.66	—	3.1	0.005	0.80	0.0	0.05	12.94	0.01	2.290	2.51	0.00	2.7	97.3	0.0	-0.65	0.82	0.78	2.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25245	3120	24	0	60	0	0	logfile
✘	7SVV	25454	2025-08-24	2021-11-19	3.54	3.06	3.43	3.5	0.024	1.88	10.0	0.10	16.78	0.01	1.320	4.73	0.00	1.4	98.6	0.0	-0.21	0.56	0.75	2.17	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23046	2710	32	38	20	0	0	logfile

• ← previous
• Page 38 of 57
• next →