Table showing results for August 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	9G74	51109	2025-08-23	2024-07-19	2.75	3.16	2.77	3.1	0.003	0.52	0.0	0.04	11.79	0.00	1.747	7.53	0.53	2.3	97.7	0.0	1.14	0.64	0.74	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14683	1741	6	38	2	0	0	logfile
✘	9G6E	51099	2025-08-23	2024-07-18	2.6	3.19	2.58	3.0	0.004	0.62	0.0	0.04	17.56	0.00	2.173	10.36	4.48	3.6	96.4	0.0	0.65	0.71	0.87	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11653	1412	9	0	24	0	0	logfile
✘	9G57	51082	2025-08-23	2024-07-16	2.48	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14285	1665	10	0	50	0	0	logfile
✘	9G23	50962	2025-08-26	2024-07-10	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34137	4117	22	71	8	0	0	logfile
✘	9G24	50963	2025-08-26	2024-07-10	3.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34117	4114	22	71	8	0	0	logfile
✘	9iND	60703	2025-08-22	2024-07-06	2.88	2.01	2.90	1.9	0.011	1.11	0.0	0.06	11.53	0.01	2.266	5.06	0.26	4.9	95.1	0.0	-3.25	0.76	0.77	5.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7644	1010	7	0	9	0	0	logfile
✘	9iNF	60705	2025-08-22	2024-07-06	3.36	3.58	3.31	3.6	0.003	0.67	0.0	0.04	17.90	0.00	2.212	14.78	0.56	3.5	96.5	0.0	1.40	0.57	0.80	1.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7282	802	6	0	18	6	0	logfile
✘	9CG3	45567	2025-08-26	2024-06-28	2.96	3.45	3.09	3.4	0.013	0.70	0.0	0.04	11.48	0.01	2.175	11.45	3.20	3.4	96.6	0.0	1.44	0.75	0.81	2.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31844	3995	26	0	8	0	0	logfile
✘	9CEW	45521	2025-08-23	2024-06-27	2.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15163	600	7	166	3	0	6758	logfile
✘	9CET	45518	2025-08-23	2024-06-27	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14090	596	5	134	1	0	6375	logfile
✘	9CEY	45523	2025-08-23	2024-06-27	3.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13829	607	6	121	3	3	6298	logfile
✘	9CEX	45522	2025-08-23	2024-06-27	3.27	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14679	600	8	151	3	3	6578	logfile
✘	9CEU	45519	2025-08-23	2024-06-27	3.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13398	607	5	108	1	0	6141	logfile
✘	9CER	45516	2025-08-23	2024-06-27	4.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14598	612	2	142	0	0	6561	logfile
✘	9CEZ	45524	2025-08-23	2024-06-27	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13540	600	6	115	3	3	6178	logfile
✘	9CEV	45520	2025-08-23	2024-06-27	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14047	600	6	131	3	3	6353	logfile
✘	9FUX	50781	2025-08-23	2024-06-26	2.49	2.83	—	2.8	0.006	0.70	0.0	0.05	13.85	0.01	1.993	8.00	0.00	3.7	96.2	0.1	0.21	0.72	0.82	3.71	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14556	1811	6	0	2	0	0	logfile
✘	9iK9	60651	2025-08-24	2024-06-26	3.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16993	1124	9	0	6	0	8388	logfile
✘	9CDD	45468	2025-08-22	2024-06-24	3.05	3.24	3.04	3.4	0.014	1.21	0.0	0.08	25.46	0.01	0.629	22.71	1.95	3.4	96.6	0.0	-1.04	0.50	0.64	2.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6867	720	6	0	24	81	0	logfile
✘	9CDE	45469	2025-08-22	2024-06-24	3.44	3.63	3.44	3.7	0.012	1.15	0.0	0.08	25.59	0.01	2.031	23.34	1.46	7.1	92.9	0.0	1.12	0.56	0.72	2.12	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6822	720	6	0	24	36	0	logfile

• ← previous
• Page 7 of 57
• next →