Table showing results for September 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	8BQV	16188	2024-09-24	2023-01-18	2.0	1.96	1.89	1.9	0.008	1.01	0.0	0.07	8.75	0.00	0.000	15.13	0.00	6.8	93.2	0.0	-2.59	0.54	0.77	8.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8595	1155	45	0	105	120	0	logfile
✘	8i42	35162	2024-09-26	2023-01-18	2.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14060	1560	10	0	40	0	0	logfile
✘	8BQW	16189	2024-09-27	2023-01-18	2.3	2.12	2.14	2.2	0.008	1.14	0.0	0.07	8.96	0.00	0.052	12.77	0.00	9.6	90.4	0.0	-3.78	0.46	0.75	7.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17385	2310	90	0	270	135	0	logfile
✘	8FUK	29459	2024-09-29	2023-01-17	3.36	3.71	3.47	3.7	0.003	0.56	0.0	0.04	17.11	0.01	2.068	8.01	0.24	4.4	95.6	0.0	0.29	0.78	0.85	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23608	2784	11	60	0	0	0	logfile
✘	8FSB	29418	2024-09-27	2023-01-09	2.75	3.19	2.70	3.0	0.004	0.71	0.0	0.05	14.09	0.00	2.031	4.07	0.00	5.3	94.7	0.0	-0.81	0.81	0.82	3.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16640	1975	10	0	20	0	0	logfile
✘	8FoZ	29357	2024-09-29	2023-01-03	2.0	2.03	2.09	2.0	0.009	0.92	0.0	0.06	15.79	0.01	2.238	2.94	1.31	0.5	99.5	0.0	0.22	0.80	0.91	7.15	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23648	3072	16	0	16	0	0	logfile
✘	8Fo1	29338	2024-09-30	2022-12-29	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24481	1596	4	0	0	0	12140	logfile
✘	8HUD	35035	2024-09-25	2022-12-23	3.43	3.64	3.43	3.6	0.005	0.84	0.0	0.06	20.89	0.00	2.284	10.27	0.56	9.8	90.2	0.0	-1.38	0.71	0.70	1.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8670	767	4	108	0	0	0	logfile
✘	8C21	16387	2024-09-26	2022-12-21	3.6	4.19	3.27	3.8	0.003	0.58	0.0	0.04	14.61	0.00	2.223	10.61	0.07	5.2	94.4	0.4	0.00	0.65	0.67	2.10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11954	1441	6	0	2	0	0	logfile
✘	8HTT	35017	2024-09-23	2022-12-21	3.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3292	389	5	0	8	0	0	logfile
✘	8HQS	34953	2024-09-29	2022-12-14	3.2	3.55	3.31	3.4	0.003	0.57	0.0	0.04	11.43	0.00	2.203	11.20	0.60	5.2	94.8	0.0	0.73	0.63	0.59	1.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19224	2387	7	0	0	0	0	logfile
✘	8FGX	29077	2024-09-25	2022-12-13	2.62	3.60	2.58	3.0	0.003	0.45	0.0	0.04	9.99	0.00	2.400	1.82	0.00	1.6	98.4	0.0	1.41	0.90	0.88	4.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9899	645	4	0	3	0	4873	logfile
✘	8BYS	16332	2024-09-24	2022-12-13	3.28	3.60	3.29	3.7	0.004	0.56	0.0	0.04	13.51	0.00	2.195	6.52	0.00	6.0	94.0	0.0	-0.91	0.70	0.83	3.36	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7406	968	3	0	0	0	0	logfile
✘	8HQ7	34946	2024-09-25	2022-12-13	2.7	2.88	2.96	2.8	0.003	0.72	0.0	0.05	12.54	0.01	2.131	5.95	0.00	4.8	95.2	0.0	0.23	0.77	0.85	4.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8292	1082	6	0	2	0	0	logfile
✘	8BXF	16317	2024-09-26	2022-12-08	3.4	3.97	3.47	3.9	0.004	0.95	0.0	0.06	13.47	0.01	1.507	5.27	0.38	4.3	95.7	0.0	-2.13	0.67	0.81	3.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12692	1630	10	0	5	0	0	logfile
✘	8HN8	34908	2024-09-24	2022-12-07	3.0	3.50	3.16	3.5	0.003	0.59	0.0	0.04	13.37	0.00	2.225	4.83	0.41	3.1	96.9	0.0	0.55	0.57	0.78	3.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8860	1120	6	0	1	0	0	logfile
✘	8HMZ	34905	2024-09-26	2022-12-06	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11542	1367	9	82	6	0	0	logfile
✘	8BVS	16270	2024-09-23	2022-12-05	3.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4799	617	4	1	1	0	0	logfile
✘	8HLB	34871	2024-09-24	2022-11-29	3.63	3.93	3.68	4.0	0.003	0.65	1.0	0.04	13.64	0.01	2.204	10.49	0.00	8.4	91.2	0.4	-2.13	0.70	0.75	2.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7461	977	5	0	0	0	0	logfile
✘	8HKX	34862	2024-09-26	2022-11-28	3.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-2.91	—	—	1.03	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-3.07	—	—	—	0.69	59656	3419	28	1491	57	0	0	logfile

• ← previous
• Page 11 of 33
• next →